MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 30190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017050	ACA	2	6	18395	18400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383488294
502	NC_017050	AGATA	2	10	18449	18458	60 %	20 %	20 %	0 %	383488294
503	NC_017050	ATT	2	6	18460	18465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488294
504	NC_017050	TCAAA	2	10	18479	18488	60 %	20 %	0 %	20 %	383488294
505	NC_017050	CAT	2	6	18501	18506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488294
506	NC_017050	AATTAT	2	12	18537	18548	50 %	50 %	0 %	0 %	383488294
507	NC_017050	TAT	3	9	18563	18571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488294
508	NC_017050	TA	3	6	18616	18621	50 %	50 %	0 %	0 %	383488294
509	NC_017050	AAT	2	6	18669	18674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488294
510	NC_017050	AT	3	6	18673	18678	50 %	50 %	0 %	0 %	383488294
511	NC_017050	TAA	2	6	18734	18739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488294
512	NC_017050	TTA	2	6	18808	18813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488294
513	NC_017050	ATA	2	6	18823	18828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488294
514	NC_017050	TAT	2	6	18890	18895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488294
515	NC_017050	AAT	2	6	18906	18911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488294
516	NC_017050	ATT	2	6	18934	18939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488294
517	NC_017050	TAAA	2	8	18943	18950	75 %	25 %	0 %	0 %	383488294
518	NC_017050	TCA	2	6	18962	18967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488294
519	NC_017050	ATA	2	6	19083	19088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017050	ACC	2	6	19133	19138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017050	ATA	2	6	19230	19235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017050	TAA	2	6	19243	19248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017050	AAG	2	6	19265	19270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017050	TTA	2	6	19307	19312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017050	ATTTA	2	10	19317	19326	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017050	CTT	2	6	19381	19386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017050	TATT	2	8	19387	19394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017050	ATCTAA	2	12	19396	19407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
529	NC_017050	ATT	2	6	19408	19413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017050	TAG	2	6	19444	19449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017050	AGTTT	2	10	19515	19524	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017050	A	6	6	19547	19552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017050	GTAA	2	8	19561	19568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017050	AAT	2	6	19573	19578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017050	TTAT	2	8	19639	19646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017050	TCAA	2	8	19671	19678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_017050	AT	3	6	19680	19685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017050	CAT	2	6	19731	19736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017050	TATAA	2	10	19748	19757	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017050	GTAA	2	8	19840	19847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017050	TA	3	6	19867	19872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017050	AT	3	6	19880	19885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017050	TAG	2	6	19900	19905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017050	GTA	2	6	20024	20029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017050	TAA	2	6	20030	20035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017050	ATAG	2	8	20075	20082	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017050	AAT	2	6	20107	20112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017050	A	8	8	20120	20127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017050	A	8	8	20143	20150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017050	ATTA	2	8	20179	20186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017050	GAA	2	6	20207	20212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017050	TAA	2	6	20225	20230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017050	A	8	8	20236	20243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017050	TAG	2	6	20244	20249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017050	AGT	2	6	20337	20342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017050	TAT	2	6	20398	20403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017050	A	6	6	20414	20419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017050	AAT	2	6	20425	20430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017050	TA	3	6	20435	20440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017050	AT	3	6	20531	20536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017050	AATCT	2	10	20557	20566	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
562	NC_017050	ATT	2	6	20584	20589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017050	AAG	2	6	20643	20648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017050	GTT	2	6	20673	20678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017050	AAT	2	6	20710	20715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017050	ATCA	2	8	20740	20747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_017050	ATA	2	6	20770	20775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017050	TA	3	6	20856	20861	50 %	50 %	0 %	0 %	383488295
569	NC_017050	TCT	2	6	20903	20908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383488295
570	NC_017050	TAAAA	2	10	20918	20927	80 %	20 %	0 %	0 %	383488295
571	NC_017050	ATC	2	6	20933	20938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488295
572	NC_017050	A	6	6	21017	21022	100 %	0 %	0 %	0 %	383488295
573	NC_017050	T	6	6	21029	21034	0 %	100 %	0 %	0 %	383488295
574	NC_017050	A	8	8	21036	21043	100 %	0 %	0 %	0 %	383488295
575	NC_017050	A	6	6	21080	21085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017050	TGA	2	6	21092	21097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017050	AACA	2	8	21101	21108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_017050	GTAT	2	8	21140	21147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017050	T	6	6	21253	21258	0 %	100 %	0 %	0 %	383488296
580	NC_017050	TCA	2	6	21306	21311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488296
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582	NC_017050	T	6	6	21380	21385	0 %	100 %	0 %	0 %	383488296
583	NC_017050	TTC	2	6	21398	21403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383488296
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585	NC_017050	TCT	2	6	21453	21458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383488296
586	NC_017050	TTTGTA	2	12	21487	21498	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383488296
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589	NC_017050	T	6	6	21539	21544	0 %	100 %	0 %	0 %	383488296
590	NC_017050	T	7	7	21605	21611	0 %	100 %	0 %	0 %	383488296
591	NC_017050	TAAAT	2	10	21621	21630	60 %	40 %	0 %	0 %	383488296
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594	NC_017050	GTA	2	6	21708	21713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488297
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599	NC_017050	TGAT	2	8	21833	21840	25 %	50 %	25 %	0 %	383488297
600	NC_017050	T	8	8	21869	21876	0 %	100 %	0 %	0 %	383488297
601	NC_017050	T	6	6	21906	21911	0 %	100 %	0 %	0 %	383488297
602	NC_017050	T	7	7	21913	21919	0 %	100 %	0 %	0 %	383488297
603	NC_017050	TTTGT	2	10	21938	21947	0 %	80 %	20 %	0 %	383488297
604	NC_017050	TCT	2	6	21986	21991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383488297
605	NC_017050	AGC	2	6	21997	22002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488297
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610	NC_017050	TATCAA	2	12	22140	22151	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383488297
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612	NC_017050	A	6	6	22209	22214	100 %	0 %	0 %	0 %	383488298
613	NC_017050	AG	3	6	22304	22309	50 %	0 %	50 %	0 %	383488298
614	NC_017050	TAAT	2	8	22413	22420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017050	CAT	2	6	22449	22454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488299
616	NC_017050	ATAC	2	8	22459	22466	50 %	25 %	0 %	25 %	383488299
617	NC_017050	CAT	2	6	22618	22623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488299
618	NC_017050	GCA	2	6	22628	22633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488299
619	NC_017050	AACT	2	8	22647	22654	50 %	25 %	0 %	25 %	383488299
620	NC_017050	A	7	7	22727	22733	100 %	0 %	0 %	0 %	383488299
621	NC_017050	A	6	6	22739	22744	100 %	0 %	0 %	0 %	383488299
622	NC_017050	TAG	2	6	22827	22832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488299
623	NC_017050	AATAA	2	10	22871	22880	80 %	20 %	0 %	0 %	383488299
624	NC_017050	AAAT	2	8	22881	22888	75 %	25 %	0 %	0 %	383488299
625	NC_017050	CACT	2	8	22977	22984	25 %	25 %	0 %	50 %	383488299
626	NC_017050	AAGT	2	8	23030	23037	50 %	25 %	25 %	0 %	383488299
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629	NC_017050	TAT	2	6	23204	23209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488300
630	NC_017050	ATA	2	6	23217	23222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488300
631	NC_017050	T	6	6	23326	23331	0 %	100 %	0 %	0 %	383488300
632	NC_017050	TTAGAA	2	12	23340	23351	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383488300
633	NC_017050	ATTA	2	8	23412	23419	50 %	50 %	0 %	0 %	383488300
634	NC_017050	TTA	3	9	23459	23467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488301
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