MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Katsinyian chromosome

Total Repeats: 30190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017050	ATA	2	6	206659	206664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488440
5502	NC_017050	CT	3	6	206685	206690	0 %	50 %	0 %	50 %	383488440
5503	NC_017050	TAG	2	6	206696	206701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488440
5504	NC_017050	AG	3	6	206724	206729	50 %	0 %	50 %	0 %	383488440
5505	NC_017050	TAT	2	6	206740	206745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488440
5506	NC_017050	GCA	2	6	206770	206775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488440
5507	NC_017050	T	6	6	206833	206838	0 %	100 %	0 %	0 %	383488440
5508	NC_017050	GAA	2	6	206925	206930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383488440
5509	NC_017050	TA	3	6	206966	206971	50 %	50 %	0 %	0 %	383488440
5510	NC_017050	CT	3	6	207019	207024	0 %	50 %	0 %	50 %	383488440
5511	NC_017050	ATA	2	6	207093	207098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488440
5512	NC_017050	TTG	2	6	207105	207110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383488440
5513	NC_017050	TAA	2	6	207140	207145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488440
5514	NC_017050	T	8	8	207191	207198	0 %	100 %	0 %	0 %	383488440
5515	NC_017050	CATCT	2	10	207221	207230	20 %	40 %	0 %	40 %	383488440
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5518	NC_017050	T	6	6	207305	207310	0 %	100 %	0 %	0 %	383488440
5519	NC_017050	T	8	8	207316	207323	0 %	100 %	0 %	0 %	383488440
5520	NC_017050	ATC	2	6	207419	207424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383488440
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5522	NC_017050	TTGC	2	8	207532	207539	0 %	50 %	25 %	25 %	383488440
5523	NC_017050	TTA	2	6	207555	207560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488440
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5525	NC_017050	TA	3	6	207631	207636	50 %	50 %	0 %	0 %	383488440
5526	NC_017050	TAT	3	9	207643	207651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488440
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5529	NC_017050	T	7	7	207706	207712	0 %	100 %	0 %	0 %	383488440
5530	NC_017050	ATT	2	6	207714	207719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488440
5531	NC_017050	AAT	2	6	207720	207725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017050	ATTAA	2	10	207730	207739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_017050	TAA	2	6	207871	207876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017050	TAT	2	6	207894	207899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017050	ATA	2	6	207930	207935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_017050	A	6	6	207982	207987	100 %	0 %	0 %	0 %	383488441
5537	NC_017050	CATT	2	8	208021	208028	25 %	50 %	0 %	25 %	383488441
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5539	NC_017050	AGTA	2	8	208078	208085	50 %	25 %	25 %	0 %	383488441
5540	NC_017050	TAT	2	6	208144	208149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488441
5541	NC_017050	AT	3	6	208159	208164	50 %	50 %	0 %	0 %	383488441
5542	NC_017050	T	8	8	208173	208180	0 %	100 %	0 %	0 %	383488441
5543	NC_017050	GGC	2	6	208184	208189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383488441
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5545	NC_017050	AATAA	2	10	208232	208241	80 %	20 %	0 %	0 %	383488441
5546	NC_017050	ATT	2	6	208253	208258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488441
5547	NC_017050	ATA	2	6	208260	208265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383488441
5548	NC_017050	CTG	2	6	208332	208337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383488441
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5551	NC_017050	GCA	2	6	208439	208444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488441
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5554	NC_017050	ATT	2	6	208603	208608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488441
5555	NC_017050	TAATT	2	10	208618	208627	40 %	60 %	0 %	0 %	383488441
5556	NC_017050	AGC	2	6	208645	208650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383488441
5557	NC_017050	GCTAG	2	10	208721	208730	20 %	20 %	40 %	20 %	383488441
5558	NC_017050	TAG	2	6	208801	208806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488441
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5560	NC_017050	AAATTC	2	12	208816	208827	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383488441
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5567	NC_017050	ATTA	2	8	209065	209072	50 %	50 %	0 %	0 %	383488441
5568	NC_017050	ATCT	2	8	209087	209094	25 %	50 %	0 %	25 %	383488441
5569	NC_017050	TGC	2	6	209112	209117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383488441
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5571	NC_017050	AATT	2	8	209155	209162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_017050	TTG	2	6	209165	209170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017050	A	6	6	209177	209182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5575	NC_017050	TAG	3	9	209237	209245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5583	NC_017050	ATA	2	6	209438	209443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_017050	ATA	2	6	209458	209463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_017050	ACTATA	2	12	209837	209848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5596	NC_017050	TTA	2	6	209919	209924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5598	NC_017050	TAG	2	6	209987	209992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5603	NC_017050	ATTTT	2	10	210200	210209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5605	NC_017050	GTT	2	6	210278	210283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5612	NC_017050	ATT	2	6	210654	210659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383488442
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5619	NC_017050	ACGA	2	8	210834	210841	50 %	0 %	25 %	25 %	383488442
5620	NC_017050	TAG	2	6	210886	210891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383488442
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5622	NC_017050	T	7	7	210949	210955	0 %	100 %	0 %	0 %	383488442
5623	NC_017050	AT	5	10	210985	210994	50 %	50 %	0 %	0 %	383488442
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5628	NC_017050	A	6	6	211247	211252	100 %	0 %	0 %	0 %	383488442
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