MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 3477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017049	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	383487433
2	NC_017049	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383487433
3	NC_017049	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017049	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017049	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	383487435
6	NC_017049	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	383487436
7	NC_017049	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	383487436
8	NC_017049	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	383487436
9	NC_017049	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	383487436
10	NC_017049	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	383487437
11	NC_017049	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	383487437
12	NC_017049	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	383487437
13	NC_017049	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	383487437
14	NC_017049	GGCT	2	8	6126	6133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017049	TTTA	2	8	6199	6206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017049	TAAA	2	8	6218	6225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017049	ACCT	2	8	6584	6591	25 %	25 %	0 %	50 %	383487438
18	NC_017049	ACCA	2	8	6668	6675	50 %	0 %	0 %	50 %	383487438
19	NC_017049	TAAA	2	8	6676	6683	75 %	25 %	0 %	0 %	383487438
20	NC_017049	ATAA	2	8	6839	6846	75 %	25 %	0 %	0 %	383487438
21	NC_017049	CCTG	2	8	7897	7904	0 %	25 %	25 %	50 %	383487440
22	NC_017049	ATTT	2	8	8915	8922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017049	TTTA	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017049	TATT	2	8	9211	9218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017049	TAAT	2	8	9257	9264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017049	CAAT	2	8	9862	9869	50 %	25 %	0 %	25 %	383487441
27	NC_017049	CATG	2	8	9885	9892	25 %	25 %	25 %	25 %	383487441
28	NC_017049	ATGA	2	8	9961	9968	50 %	25 %	25 %	0 %	383487441
29	NC_017049	TTGG	2	8	10133	10140	0 %	50 %	50 %	0 %	383487441
30	NC_017049	AAAT	2	8	10677	10684	75 %	25 %	0 %	0 %	383487441
31	NC_017049	TAAA	2	8	10957	10964	75 %	25 %	0 %	0 %	383487442
32	NC_017049	TAAA	2	8	10984	10991	75 %	25 %	0 %	0 %	383487442
33	NC_017049	AAAG	2	8	11261	11268	75 %	0 %	25 %	0 %	383487442
34	NC_017049	TCAT	2	8	11381	11388	25 %	50 %	0 %	25 %	383487442
35	NC_017049	TAAT	2	8	12445	12452	50 %	50 %	0 %	0 %	383487444
36	NC_017049	GCTT	2	8	12460	12467	0 %	50 %	25 %	25 %	383487444
37	NC_017049	AATA	2	8	13373	13380	75 %	25 %	0 %	0 %	383487445
38	NC_017049	GCTC	2	8	13577	13584	0 %	25 %	25 %	50 %	383487445
39	NC_017049	TAAG	2	8	14774	14781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017049	ATTA	2	8	14795	14802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017049	AAAG	2	8	14864	14871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017049	TTAT	2	8	15035	15042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017049	TAAG	2	8	15229	15236	50 %	25 %	25 %	0 %	383487446
44	NC_017049	AATA	2	8	15659	15666	75 %	25 %	0 %	0 %	383487446
45	NC_017049	GTAA	2	8	15807	15814	50 %	25 %	25 %	0 %	383487446
46	NC_017049	AGCA	2	8	16089	16096	50 %	0 %	25 %	25 %	383487447
47	NC_017049	AATT	2	8	16702	16709	50 %	50 %	0 %	0 %	383487447
48	NC_017049	AAAG	2	8	17172	17179	75 %	0 %	25 %	0 %	383487447
49	NC_017049	ATTC	2	8	17265	17272	25 %	50 %	0 %	25 %	383487447
50	NC_017049	TTCA	2	8	18317	18324	25 %	50 %	0 %	25 %	383487448
51	NC_017049	TAAA	2	8	18956	18963	75 %	25 %	0 %	0 %	383487448
52	NC_017049	TATT	2	8	19400	19407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017049	GTAA	2	8	19574	19581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017049	TTAT	2	8	19652	19659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017049	TCAA	2	8	19684	19691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017049	GTAA	2	8	19853	19860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017049	ATAG	2	8	20088	20095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017049	ATTA	2	8	20192	20199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017049	ATCA	2	8	20754	20761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017049	AACA	2	8	21115	21122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017049	GTAT	2	8	21154	21161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017049	TGAT	2	8	21847	21854	25 %	50 %	25 %	0 %	383487451
63	NC_017049	TAAT	2	8	22427	22434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017049	ATAC	2	8	22473	22480	50 %	25 %	0 %	25 %	383487453
65	NC_017049	AACT	2	8	22661	22668	50 %	25 %	0 %	25 %	383487453
66	NC_017049	AAAT	2	8	22895	22902	75 %	25 %	0 %	0 %	383487453
67	NC_017049	CACT	2	8	22991	22998	25 %	25 %	0 %	50 %	383487453
68	NC_017049	AAGT	2	8	23044	23051	50 %	25 %	25 %	0 %	383487453
69	NC_017049	ATTA	2	8	23426	23433	50 %	50 %	0 %	0 %	383487454
70	NC_017049	ATTT	2	8	23485	23492	25 %	75 %	0 %	0 %	383487455
71	NC_017049	TATT	2	8	23732	23739	25 %	75 %	0 %	0 %	383487455
72	NC_017049	TCTT	2	8	25042	25049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017049	AAAT	2	8	25633	25640	75 %	25 %	0 %	0 %	383487457
74	NC_017049	TAAA	2	8	26862	26869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017049	TTAA	2	8	27109	27116	50 %	50 %	0 %	0 %	383487458
76	NC_017049	TAGT	2	8	27272	27279	25 %	50 %	25 %	0 %	383487458
77	NC_017049	ATTT	2	8	27291	27298	25 %	75 %	0 %	0 %	383487458
78	NC_017049	TTGC	2	8	27566	27573	0 %	50 %	25 %	25 %	383487458
79	NC_017049	ATTT	2	8	27716	27723	25 %	75 %	0 %	0 %	383487458
80	NC_017049	TTCC	2	8	27806	27813	0 %	50 %	0 %	50 %	383487458
81	NC_017049	GCTT	2	8	27944	27951	0 %	50 %	25 %	25 %	383487458
82	NC_017049	ATTT	3	12	28776	28787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017049	TACA	2	8	28918	28925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017049	ATAA	2	8	29093	29100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017049	AATA	2	8	29723	29730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017049	TTTG	2	8	31044	31051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017049	ATTA	2	8	31254	31261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017049	ATAG	2	8	31393	31400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017049	TTTG	2	8	31483	31490	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017049	ATTT	2	8	31809	31816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017049	TTCT	2	8	31851	31858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017049	AAAT	2	8	32612	32619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017049	TATT	2	8	32713	32720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017049	ATTT	2	8	32854	32861	25 %	75 %	0 %	0 %	383487460
95	NC_017049	ATTT	2	8	33294	33301	25 %	75 %	0 %	0 %	383487461
96	NC_017049	AAAT	2	8	33318	33325	75 %	25 %	0 %	0 %	383487461
97	NC_017049	ATAA	2	8	33794	33801	75 %	25 %	0 %	0 %	383487461
98	NC_017049	AGCA	2	8	34282	34289	50 %	0 %	25 %	25 %	383487462
99	NC_017049	TTTC	2	8	34950	34957	0 %	75 %	0 %	25 %	383487463
100	NC_017049	ATTT	2	8	35815	35822	25 %	75 %	0 %	0 %	383487463
101	NC_017049	TCGT	2	8	36094	36101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017049	AATC	2	8	36405	36412	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017049	TGAT	2	8	36477	36484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017049	TTGA	2	8	36657	36664	25 %	50 %	25 %	0 %	383487464
105	NC_017049	AGTA	2	8	36776	36783	50 %	25 %	25 %	0 %	383487464
106	NC_017049	TACT	2	8	37126	37133	25 %	50 %	0 %	25 %	383487464
107	NC_017049	TCAA	2	8	37987	37994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017049	ATGT	2	8	38047	38054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017049	TTAA	2	8	38313	38320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017049	TTAT	2	8	38379	38386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017049	TAAA	2	8	38589	38596	75 %	25 %	0 %	0 %	383487465
112	NC_017049	GAGT	2	8	39883	39890	25 %	25 %	50 %	0 %	383487465
113	NC_017049	AATA	2	8	41067	41074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017049	AAAT	2	8	41133	41140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017049	ATTA	2	8	42008	42015	50 %	50 %	0 %	0 %	383487466
116	NC_017049	ACTT	2	8	42956	42963	25 %	50 %	0 %	25 %	383487467
117	NC_017049	AATA	2	8	43445	43452	75 %	25 %	0 %	0 %	383487467
118	NC_017049	TAAA	2	8	43501	43508	75 %	25 %	0 %	0 %	383487467
119	NC_017049	AAAC	2	8	43798	43805	75 %	0 %	0 %	25 %	383487467
120	NC_017049	ATTT	3	12	43813	43824	25 %	75 %	0 %	0 %	383487467
121	NC_017049	TTTA	2	8	44000	44007	25 %	75 %	0 %	0 %	383487467
122	NC_017049	TAAG	2	8	44392	44399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017049	GTTT	2	8	44784	44791	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017049	AGAA	2	8	45036	45043	75 %	0 %	25 %	0 %	383487468
125	NC_017049	AAAG	2	8	45416	45423	75 %	0 %	25 %	0 %	383487469
126	NC_017049	TAAA	2	8	45483	45490	75 %	25 %	0 %	0 %	383487469
127	NC_017049	AAGA	2	8	46461	46468	75 %	0 %	25 %	0 %	383487471
128	NC_017049	TAAT	2	8	46968	46975	50 %	50 %	0 %	0 %	383487471
129	NC_017049	ATTA	2	8	47044	47051	50 %	50 %	0 %	0 %	383487471
130	NC_017049	TTAT	2	8	47239	47246	25 %	75 %	0 %	0 %	383487471
131	NC_017049	GAAT	2	8	47816	47823	50 %	25 %	25 %	0 %	383487472
132	NC_017049	CTTA	2	8	48090	48097	25 %	50 %	0 %	25 %	383487472
133	NC_017049	ATGG	2	8	48370	48377	25 %	25 %	50 %	0 %	383487472
134	NC_017049	TATG	2	8	49098	49105	25 %	50 %	25 %	0 %	383487472
135	NC_017049	TAAT	2	8	49491	49498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017049	GCTA	2	8	51869	51876	25 %	25 %	25 %	25 %	383487474
137	NC_017049	AATT	2	8	51965	51972	50 %	50 %	0 %	0 %	383487474
138	NC_017049	CGAC	2	8	51988	51995	25 %	0 %	25 %	50 %	383487474
139	NC_017049	AAAT	2	8	52062	52069	75 %	25 %	0 %	0 %	383487475
140	NC_017049	ATAA	2	8	52425	52432	75 %	25 %	0 %	0 %	383487475
141	NC_017049	ATAA	2	8	52754	52761	75 %	25 %	0 %	0 %	383487475
142	NC_017049	TAAT	2	8	52806	52813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017049	TGTT	2	8	53033	53040	0 %	75 %	25 %	0 %	383487476
144	NC_017049	TTAA	2	8	53071	53078	50 %	50 %	0 %	0 %	383487476
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