MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 30141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017049	ATT	2	6	111473	111478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017049	TAT	2	6	111496	111501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017049	TTA	2	6	111573	111578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017049	TAA	2	6	111595	111600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017049	TAA	2	6	111645	111650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017049	ATA	2	6	111722	111727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017049	AGTA	2	8	111815	111822	50 %	25 %	25 %	0 %	383487525
3008	NC_017049	TATT	2	8	111862	111869	25 %	75 %	0 %	0 %	383487525
3009	NC_017049	TAG	2	6	111916	111921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487525
3010	NC_017049	TTATA	2	10	111923	111932	40 %	60 %	0 %	0 %	383487525
3011	NC_017049	TAAA	2	8	111967	111974	75 %	25 %	0 %	0 %	383487525
3012	NC_017049	TAA	2	6	111998	112003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487525
3013	NC_017049	TAC	2	6	112008	112013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487525
3014	NC_017049	AT	3	6	112030	112035	50 %	50 %	0 %	0 %	383487525
3015	NC_017049	T	6	6	112045	112050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017049	GTAAT	2	10	112061	112070	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017049	AGG	2	6	112122	112127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017049	ATA	2	6	112128	112133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017049	A	6	6	112169	112174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017049	A	6	6	112196	112201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017049	AGC	2	6	112242	112247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487526
3022	NC_017049	AAGA	2	8	112268	112275	75 %	0 %	25 %	0 %	383487526
3023	NC_017049	TTA	2	6	112345	112350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487526
3024	NC_017049	TTA	2	6	112355	112360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487526
3025	NC_017049	GAT	2	6	112390	112395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487526
3026	NC_017049	TGCTT	2	10	112428	112437	0 %	60 %	20 %	20 %	383487526
3027	NC_017049	AGA	2	6	112483	112488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487526
3028	NC_017049	TTA	2	6	112556	112561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487526
3029	NC_017049	T	6	6	112609	112614	0 %	100 %	0 %	0 %	383487526
3030	NC_017049	TA	3	6	112622	112627	50 %	50 %	0 %	0 %	383487526
3031	NC_017049	TA	3	6	112637	112642	50 %	50 %	0 %	0 %	383487526
3032	NC_017049	TGG	2	6	112653	112658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487526
3033	NC_017049	TGC	2	6	112659	112664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487526
3034	NC_017049	T	6	6	112677	112682	0 %	100 %	0 %	0 %	383487526
3035	NC_017049	AAG	2	6	112684	112689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487526
3036	NC_017049	TAA	2	6	112704	112709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487526
3037	NC_017049	GAAA	2	8	112740	112747	75 %	0 %	25 %	0 %	383487526
3038	NC_017049	TAAT	2	8	112868	112875	50 %	50 %	0 %	0 %	383487526
3039	NC_017049	TGA	2	6	112920	112925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487526
3040	NC_017049	TACC	2	8	112931	112938	25 %	25 %	0 %	50 %	383487526
3041	NC_017049	ATT	2	6	112944	112949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487526
3042	NC_017049	T	6	6	112948	112953	0 %	100 %	0 %	0 %	383487526
3043	NC_017049	AAG	2	6	112974	112979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487526
3044	NC_017049	ATC	2	6	113005	113010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487526
3045	NC_017049	ACA	2	6	113142	113147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487526
3046	NC_017049	CTA	2	6	113219	113224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487526
3047	NC_017049	GCG	2	6	113225	113230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383487526
3048	NC_017049	ATC	2	6	113246	113251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487526
3049	NC_017049	AGA	2	6	113292	113297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487526
3050	NC_017049	TAT	2	6	113300	113305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487526
3051	NC_017049	GCA	2	6	113311	113316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487526
3052	NC_017049	TA	3	6	113407	113412	50 %	50 %	0 %	0 %	383487526
3053	NC_017049	CTA	2	6	113423	113428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487526
3054	NC_017049	TTTTA	2	10	113545	113554	20 %	80 %	0 %	0 %	383487526
3055	NC_017049	T	6	6	113671	113676	0 %	100 %	0 %	0 %	383487526
3056	NC_017049	ATA	2	6	113861	113866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487526
3057	NC_017049	A	8	8	113906	113913	100 %	0 %	0 %	0 %	383487526
3058	NC_017049	GAT	2	6	114034	114039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487526
3059	NC_017049	TA	3	6	114122	114127	50 %	50 %	0 %	0 %	383487526
3060	NC_017049	AT	3	6	114143	114148	50 %	50 %	0 %	0 %	383487526
3061	NC_017049	A	6	6	114161	114166	100 %	0 %	0 %	0 %	383487526
3062	NC_017049	TGA	2	6	114180	114185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487526
3063	NC_017049	AGA	2	6	114291	114296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487526
3064	NC_017049	TGC	2	6	114297	114302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487526
3065	NC_017049	AGT	2	6	114307	114312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487526
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3067	NC_017049	CA	3	6	114342	114347	50 %	0 %	0 %	50 %	383487526
3068	NC_017049	T	7	7	114350	114356	0 %	100 %	0 %	0 %	383487526
3069	NC_017049	AT	3	6	114414	114419	50 %	50 %	0 %	0 %	383487526
3070	NC_017049	TTAA	2	8	114421	114428	50 %	50 %	0 %	0 %	383487526
3071	NC_017049	CTA	2	6	114440	114445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487526
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3073	NC_017049	AAT	2	6	114511	114516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487526
3074	NC_017049	TATT	2	8	114645	114652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017049	TAG	2	6	114667	114672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017049	CTT	2	6	114696	114701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_017049	GTAA	2	8	114743	114750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017049	ATT	2	6	114762	114767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487527
3079	NC_017049	GTA	2	6	114773	114778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487527
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3082	NC_017049	ATTT	2	8	115034	115041	25 %	75 %	0 %	0 %	383487527
3083	NC_017049	GCTTT	2	10	115121	115130	0 %	60 %	20 %	20 %	383487527
3084	NC_017049	TAA	2	6	115134	115139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487527
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3086	NC_017049	TTGCTA	2	12	115187	115198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383487527
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3089	NC_017049	A	8	8	115255	115262	100 %	0 %	0 %	0 %	383487527
3090	NC_017049	TGA	2	6	115296	115301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487527
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3092	NC_017049	AGATAG	2	12	115353	115364	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383487527
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3095	NC_017049	AT	3	6	115444	115449	50 %	50 %	0 %	0 %	383487527
3096	NC_017049	AGA	2	6	115467	115472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487527
3097	NC_017049	TTA	2	6	115481	115486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487527
3098	NC_017049	CAA	2	6	115493	115498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487527
3099	NC_017049	TGC	2	6	115539	115544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487527
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3101	NC_017049	GTT	2	6	115687	115692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383487527
3102	NC_017049	TCA	2	6	115699	115704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487527
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3104	NC_017049	GTAT	2	8	115739	115746	25 %	50 %	25 %	0 %	383487527
3105	NC_017049	TATGT	2	10	115774	115783	20 %	60 %	20 %	0 %	383487527
3106	NC_017049	T	6	6	115783	115788	0 %	100 %	0 %	0 %	383487527
3107	NC_017049	TTA	2	6	115798	115803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487527
3108	NC_017049	GCC	2	6	115818	115823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383487527
3109	NC_017049	TA	3	6	115834	115839	50 %	50 %	0 %	0 %	383487527
3110	NC_017049	ATA	2	6	115855	115860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487527
3111	NC_017049	GAT	2	6	115932	115937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487527
3112	NC_017049	CTTA	2	8	115956	115963	25 %	50 %	0 %	25 %	383487527
3113	NC_017049	TGC	2	6	115998	116003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487527
3114	NC_017049	TAA	2	6	116025	116030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487527
3115	NC_017049	ATG	2	6	116039	116044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487527
3116	NC_017049	ATT	2	6	116096	116101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487527
3117	NC_017049	AT	3	6	116111	116116	50 %	50 %	0 %	0 %	383487527
3118	NC_017049	TCTAC	2	10	116119	116128	20 %	40 %	0 %	40 %	383487527
3119	NC_017049	T	6	6	116157	116162	0 %	100 %	0 %	0 %	383487527
3120	NC_017049	T	7	7	116172	116178	0 %	100 %	0 %	0 %	383487527
3121	NC_017049	C	7	7	116189	116195	0 %	0 %	0 %	100 %	383487527
3122	NC_017049	AT	3	6	116196	116201	50 %	50 %	0 %	0 %	383487527
3123	NC_017049	ATG	2	6	116236	116241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487527
3124	NC_017049	TGC	2	6	116286	116291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487527
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3498	NC_017049	AGC	2	6	130027	130032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487532
3499	NC_017049	TAT	2	6	130050	130055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487532
3500	NC_017049	GTA	2	6	130091	130096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487532

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