MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 30141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18003	NC_017049	ATA	2	6	660085	660090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487939
18004	NC_017049	AT	3	6	660188	660193	50 %	50 %	0 %	0 %	383487939
18005	NC_017049	TTG	2	6	660194	660199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383487939
18006	NC_017049	CCA	2	6	660211	660216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383487939
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18008	NC_017049	TTTG	2	8	660247	660254	0 %	75 %	25 %	0 %	383487939
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18011	NC_017049	CTA	2	6	660383	660388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487939
18012	NC_017049	TAA	2	6	660408	660413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487939
18013	NC_017049	GAG	2	6	660416	660421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383487939
18014	NC_017049	ACT	2	6	660477	660482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487939
18015	NC_017049	TATG	2	8	660509	660516	25 %	50 %	25 %	0 %	383487939
18016	NC_017049	T	6	6	660642	660647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_017049	TA	3	6	660658	660663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_017049	A	7	7	660676	660682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_017049	TTAA	2	8	660789	660796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_017049	ATA	2	6	660806	660811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18021	NC_017049	TGT	2	6	660912	660917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_017049	ATA	2	6	660925	660930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_017049	TAA	2	6	660960	660965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_017049	AT	3	6	661016	661021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_017049	T	6	6	661033	661038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_017049	AT	3	6	661039	661044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_017049	ACA	3	9	661049	661057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_017049	ATA	2	6	661061	661066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_017049	AT	4	8	661074	661081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_017049	TAA	2	6	661106	661111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_017049	ACTAA	2	10	661119	661128	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18032	NC_017049	TAT	2	6	661143	661148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_017049	CTA	2	6	661163	661168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_017049	TAC	2	6	661182	661187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18035	NC_017049	AT	3	6	661223	661228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_017049	ATG	2	6	661300	661305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_017049	AAT	2	6	661316	661321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_017049	AT	3	6	661354	661359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_017049	ATA	2	6	661368	661373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_017049	TAAT	2	8	661406	661413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_017049	TAAT	2	8	661429	661436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_017049	CTT	2	6	661460	661465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18043	NC_017049	TAAT	2	8	661478	661485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_017049	ATTC	2	8	661502	661509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18045	NC_017049	TGC	2	6	661669	661674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18047	NC_017049	ATT	2	6	661705	661710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18048	NC_017049	TATT	2	8	661842	661849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_017049	TAT	2	6	661882	661887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18050	NC_017049	AT	3	6	661905	661910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18051	NC_017049	TAC	2	6	661914	661919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18052	NC_017049	ATTAT	2	10	661951	661960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_017049	ATC	2	6	661993	661998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18054	NC_017049	TAC	2	6	662067	662072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_017049	TCA	2	6	662083	662088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18056	NC_017049	ATT	2	6	662120	662125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_017049	TAATT	2	10	662217	662226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_017049	TTA	2	6	662268	662273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_017049	ATGA	2	8	662286	662293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18060	NC_017049	ATTA	2	8	662312	662319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18061	NC_017049	AAT	2	6	662333	662338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_017049	ATA	2	6	662361	662366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_017049	GAT	2	6	662409	662414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18065	NC_017049	T	6	6	662448	662453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_017049	ATTTT	2	10	662479	662488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_017049	TGTA	2	8	662492	662499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_017049	AT	3	6	662518	662523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_017049	A	6	6	662536	662541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18070	NC_017049	ATA	3	9	662570	662578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18111	NC_017049	AT	3	6	663554	663559	50 %	50 %	0 %	0 %	383487940
18112	NC_017049	AGT	2	6	663562	663567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487940
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