MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 30141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017049	T	6	6	37136	37141	0 %	100 %	0 %	0 %	383487464
1003	NC_017049	T	6	6	37169	37174	0 %	100 %	0 %	0 %	383487464
1004	NC_017049	TTC	2	6	37178	37183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487464
1005	NC_017049	AGC	2	6	37241	37246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487464
1006	NC_017049	A	6	6	37260	37265	100 %	0 %	0 %	0 %	383487464
1007	NC_017049	T	6	6	37290	37295	0 %	100 %	0 %	0 %	383487464
1008	NC_017049	ATT	2	6	37359	37364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487464
1009	NC_017049	TTA	2	6	37389	37394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017049	A	6	6	37419	37424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017049	ATA	2	6	37427	37432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017049	AAC	2	6	37449	37454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017049	AT	3	6	37477	37482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017049	T	6	6	37482	37487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017049	ATG	2	6	37488	37493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017049	TTTAAT	2	12	37524	37535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017049	TAT	2	6	37554	37559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017049	AGT	2	6	37560	37565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017049	T	6	6	37595	37600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017049	T	6	6	37602	37607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017049	GTT	2	6	37618	37623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017049	TAT	2	6	37839	37844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017049	T	6	6	37882	37887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017049	AAT	2	6	37923	37928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017049	TAA	2	6	37952	37957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017049	CAT	2	6	37979	37984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017049	TCAA	2	8	37987	37994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_017049	T	6	6	38018	38023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017049	ATGT	2	8	38047	38054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017049	TA	4	8	38062	38069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017049	T	6	6	38159	38164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017049	TCA	2	6	38198	38203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017049	T	7	7	38233	38239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017049	TTAA	2	8	38313	38320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017049	TTA	2	6	38362	38367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017049	TTAT	2	8	38379	38386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017049	ATC	2	6	38433	38438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487465
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1039	NC_017049	TAT	2	6	38487	38492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487465
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1041	NC_017049	TAA	2	6	38536	38541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487465
1042	NC_017049	AGG	2	6	38545	38550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383487465
1043	NC_017049	TTA	2	6	38561	38566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487465
1044	NC_017049	TAAA	2	8	38589	38596	75 %	25 %	0 %	0 %	383487465
1045	NC_017049	TAT	2	6	38633	38638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487465
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1050	NC_017049	A	6	6	38789	38794	100 %	0 %	0 %	0 %	383487465
1051	NC_017049	A	6	6	38828	38833	100 %	0 %	0 %	0 %	383487465
1052	NC_017049	ATG	2	6	38862	38867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487465
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1057	NC_017049	TAT	2	6	39097	39102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487465
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1059	NC_017049	ATT	2	6	39206	39211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487465
1060	NC_017049	TTA	2	6	39281	39286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487465
1061	NC_017049	GTG	2	6	39303	39308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487465
1062	NC_017049	CTA	2	6	39327	39332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487465
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1099	NC_017049	AAT	2	6	40862	40867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487465
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1102	NC_017049	ATT	2	6	40989	40994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1104	NC_017049	T	6	6	41022	41027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1106	NC_017049	AATA	2	8	41067	41074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017049	AAAT	2	8	41133	41140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017049	TAT	2	6	41174	41179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017049	TTG	2	6	41190	41195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1111	NC_017049	TAG	2	6	41394	41399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017049	CTG	2	6	41400	41405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017049	GTATT	2	10	41432	41441	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017049	TAC	2	6	41464	41469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017049	ATT	2	6	41483	41488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017049	TA	3	6	41513	41518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017049	TA	3	6	41547	41552	50 %	50 %	0 %	0 %	383487466
1118	NC_017049	TAT	2	6	41605	41610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487466
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1123	NC_017049	GAT	2	6	41893	41898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487466
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1126	NC_017049	TAC	2	6	41959	41964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487466
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1129	NC_017049	CTT	2	6	42028	42033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487466
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