MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 2818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017048	TA	3	6	327	332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017048	TA	3	6	466	471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017048	AT	3	6	627	632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017048	AT	3	6	1182	1187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017048	TA	4	8	1356	1363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017048	AT	3	6	1577	1582	50 %	50 %	0 %	0 %	383486604
7	NC_017048	TA	3	6	1665	1670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017048	AT	3	6	1781	1786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017048	AT	3	6	1835	1840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017048	AT	3	6	1856	1861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017048	TA	3	6	2052	2057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017048	TA	3	6	2374	2379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017048	GT	3	6	2550	2555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017048	TG	4	8	2903	2910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017048	TA	3	6	4276	4281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017048	AT	3	6	4572	4577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017048	AT	3	6	5023	5028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017048	GT	3	6	5229	5234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017048	CA	3	6	5722	5727	50 %	0 %	0 %	50 %	383486605
20	NC_017048	CT	3	6	6061	6066	0 %	50 %	0 %	50 %	383486605
21	NC_017048	TA	3	6	7338	7343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017048	CT	3	6	7525	7530	0 %	50 %	0 %	50 %	383486606
23	NC_017048	AT	3	6	8670	8675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017048	TA	3	6	9413	9418	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
25	NC_017048	TA	4	8	10179	10186	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
26	NC_017048	AT	3	6	10972	10977	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
27	NC_017048	TA	3	6	11038	11043	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
28	NC_017048	TA	3	6	11155	11160	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
29	NC_017048	TA	3	6	11292	11297	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
30	NC_017048	CA	3	6	11322	11327	50 %	0 %	0 %	50 %	383486608
31	NC_017048	AT	3	6	12560	12565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017048	TA	3	6	12647	12652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017048	AT	3	6	12832	12837	50 %	50 %	0 %	0 %	383486609
34	NC_017048	AT	4	8	13243	13250	50 %	50 %	0 %	0 %	383486609
35	NC_017048	AT	3	6	13406	13411	50 %	50 %	0 %	0 %	383486609
36	NC_017048	TA	3	6	13587	13592	50 %	50 %	0 %	0 %	383486609
37	NC_017048	TA	3	6	14670	14675	50 %	50 %	0 %	0 %	383486609
38	NC_017048	TA	3	6	15239	15244	50 %	50 %	0 %	0 %	383486610
39	NC_017048	AG	3	6	16161	16166	50 %	0 %	50 %	0 %	383486610
40	NC_017048	CT	3	6	16620	16625	0 %	50 %	0 %	50 %	383486611
41	NC_017048	AT	3	6	16806	16811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017048	AT	3	6	16826	16831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017048	AT	3	6	17834	17839	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
44	NC_017048	TA	3	6	18210	18215	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
45	NC_017048	TA	4	8	18406	18413	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
46	NC_017048	TA	3	6	19007	19012	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
47	NC_017048	TA	3	6	19825	19830	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
48	NC_017048	TA	3	6	19922	19927	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
49	NC_017048	AT	3	6	20251	20256	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
50	NC_017048	AT	3	6	20826	20831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017048	AT	3	6	20886	20891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017048	GA	3	6	21219	21224	50 %	0 %	50 %	0 %	383486613
53	NC_017048	AT	3	6	21566	21571	50 %	50 %	0 %	0 %	383486613
54	NC_017048	AT	3	6	21645	21650	50 %	50 %	0 %	0 %	383486613
55	NC_017048	GT	3	6	21746	21751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017048	AT	3	6	21915	21920	50 %	50 %	0 %	0 %	383486614
57	NC_017048	AT	3	6	22308	22313	50 %	50 %	0 %	0 %	383486614
58	NC_017048	TA	3	6	22575	22580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017048	TA	4	8	22648	22655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017048	TA	3	6	23698	23703	50 %	50 %	0 %	0 %	383486615
61	NC_017048	GA	3	6	23745	23750	50 %	0 %	50 %	0 %	383486615
62	NC_017048	TA	3	6	24060	24065	50 %	50 %	0 %	0 %	383486615
63	NC_017048	AT	3	6	24192	24197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017048	AG	4	8	24387	24394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017048	AT	3	6	25183	25188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017048	AT	3	6	25299	25304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017048	TA	3	6	25491	25496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017048	AT	3	6	25877	25882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017048	AT	3	6	26433	26438	50 %	50 %	0 %	0 %	383486616
70	NC_017048	TA	3	6	27233	27238	50 %	50 %	0 %	0 %	383486617
71	NC_017048	CA	3	6	27814	27819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017048	TA	3	6	27871	27876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017048	AT	3	6	28010	28015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017048	TA	4	8	30224	30231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017048	AT	3	6	30283	30288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017048	AT	4	8	30450	30457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017048	AT	3	6	31200	31205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017048	AT	3	6	31592	31597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017048	TA	3	6	31627	31632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017048	AT	3	6	31782	31787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017048	AG	3	6	31882	31887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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85	NC_017048	TA	3	6	33554	33559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_017048	TA	4	8	34389	34396	50 %	50 %	0 %	0 %	383486622
88	NC_017048	TA	3	6	34642	34647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_017048	AT	3	6	34961	34966	50 %	50 %	0 %	0 %	383486623
91	NC_017048	TA	3	6	35356	35361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017048	AT	3	6	35436	35441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017048	TA	3	6	36072	36077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017048	AT	3	6	36998	37003	50 %	50 %	0 %	0 %	383486625
95	NC_017048	TA	4	8	37531	37538	50 %	50 %	0 %	0 %	383486626
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99	NC_017048	TA	3	6	39470	39475	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
100	NC_017048	AT	3	6	39546	39551	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
101	NC_017048	AT	3	6	39626	39631	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
102	NC_017048	AT	3	6	39770	39775	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
103	NC_017048	AT	3	6	40071	40076	50 %	50 %	0 %	0 %	383486630
104	NC_017048	TA	3	6	40104	40109	50 %	50 %	0 %	0 %	383486630
105	NC_017048	AT	3	6	40258	40263	50 %	50 %	0 %	0 %	383486630
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109	NC_017048	AT	4	8	42662	42669	50 %	50 %	0 %	0 %	383486634
110	NC_017048	TA	3	6	43419	43424	50 %	50 %	0 %	0 %	383486636
111	NC_017048	TA	3	6	43594	43599	50 %	50 %	0 %	0 %	383486636
112	NC_017048	TA	4	8	44056	44063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_017048	TA	3	6	46372	46377	50 %	50 %	0 %	0 %	383486644
116	NC_017048	TA	3	6	46916	46921	50 %	50 %	0 %	0 %	383486645
117	NC_017048	TA	3	6	47351	47356	50 %	50 %	0 %	0 %	383486646
118	NC_017048	CT	3	6	48338	48343	0 %	50 %	0 %	50 %	383486647
119	NC_017048	TA	3	6	48667	48672	50 %	50 %	0 %	0 %	383486648
120	NC_017048	CT	3	6	48686	48691	0 %	50 %	0 %	50 %	383486649
121	NC_017048	AT	3	6	49233	49238	50 %	50 %	0 %	0 %	383486649
122	NC_017048	TA	3	6	49336	49341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017048	TA	3	6	51188	51193	50 %	50 %	0 %	0 %	383486652
124	NC_017048	AT	3	6	51427	51432	50 %	50 %	0 %	0 %	383486652
125	NC_017048	CT	3	6	51795	51800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017048	CA	3	6	51895	51900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017048	AT	3	6	51959	51964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017048	AT	3	6	52026	52031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017048	TA	3	6	52680	52685	50 %	50 %	0 %	0 %	383486653
130	NC_017048	AT	3	6	52799	52804	50 %	50 %	0 %	0 %	383486653
131	NC_017048	AT	3	6	53158	53163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017048	TA	4	8	53189	53196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017048	AT	3	6	54007	54012	50 %	50 %	0 %	0 %	383486654
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135	NC_017048	TA	3	6	54852	54857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017048	TA	3	6	54959	54964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017048	AT	3	6	55070	55075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017048	GC	3	6	55387	55392	0 %	0 %	50 %	50 %	383486655
139	NC_017048	CT	3	6	56809	56814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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142	NC_017048	TA	3	6	57890	57895	50 %	50 %	0 %	0 %	383486657
143	NC_017048	AT	3	6	57929	57934	50 %	50 %	0 %	0 %	383486657
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149	NC_017048	TA	3	6	60158	60163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017048	CT	3	6	60255	60260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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