MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 1189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017048	GAAAT	2	10	2274	2283	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017048	CACGA	2	10	2870	2879	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017048	AGATA	2	10	4925	4934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017048	TAATT	2	10	6455	6464	40 %	60 %	0 %	0 %	383486605
5	NC_017048	ACTAA	2	10	6891	6900	60 %	20 %	0 %	20 %	383486605
6	NC_017048	TTAGT	2	10	8823	8832	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017048	TTATA	2	10	9738	9747	40 %	60 %	0 %	0 %	383486608
8	NC_017048	CTTGC	2	10	16408	16417	0 %	40 %	20 %	40 %	383486610
9	NC_017048	CTGTT	2	10	17492	17501	0 %	60 %	20 %	20 %	383486612
10	NC_017048	ATTAT	2	10	18368	18377	40 %	60 %	0 %	0 %	383486612
11	NC_017048	TATGC	2	10	19277	19286	20 %	40 %	20 %	20 %	383486612
12	NC_017048	AGTTA	2	10	20677	20686	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017048	TAATA	2	10	21011	21020	60 %	40 %	0 %	0 %	383486613
14	NC_017048	AATCA	2	10	21365	21374	60 %	20 %	0 %	20 %	383486613
15	NC_017048	AAATT	2	10	21478	21487	60 %	40 %	0 %	0 %	383486613
16	NC_017048	TATAT	2	10	21733	21742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017048	GAAAA	2	10	22495	22504	80 %	0 %	20 %	0 %	383486614
18	NC_017048	GAAAA	2	10	24029	24038	80 %	0 %	20 %	0 %	383486615
19	NC_017048	TTTTA	2	10	24138	24147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017048	GATAT	2	10	26612	26621	40 %	40 %	20 %	0 %	383486616
21	NC_017048	CTAAT	2	10	30310	30319	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017048	AATTA	2	10	32102	32111	60 %	40 %	0 %	0 %	383486620
23	NC_017048	CATCG	2	10	32397	32406	20 %	20 %	20 %	40 %	383486620
24	NC_017048	CGATG	2	10	32478	32487	20 %	20 %	40 %	20 %	383486620
25	NC_017048	CATAC	2	10	32501	32510	40 %	20 %	0 %	40 %	383486620
26	NC_017048	AAAAT	2	10	32799	32808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017048	GCATT	2	10	34236	34245	20 %	40 %	20 %	20 %	383486622
28	NC_017048	TTTAC	2	10	35029	35038	20 %	60 %	0 %	20 %	383486623
29	NC_017048	TGTGT	2	10	35786	35795	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017048	ATTTA	2	10	36696	36705	40 %	60 %	0 %	0 %	383486624
31	NC_017048	TTAAA	2	10	37428	37437	60 %	40 %	0 %	0 %	383486626
32	NC_017048	ATTTT	2	10	39899	39908	20 %	80 %	0 %	0 %	383486630
33	NC_017048	ATTTA	2	10	40395	40404	40 %	60 %	0 %	0 %	383486630
34	NC_017048	ATTTT	2	10	42424	42433	20 %	80 %	0 %	0 %	383486634
35	NC_017048	TTAGC	2	10	42757	42766	20 %	40 %	20 %	20 %	383486634
36	NC_017048	AATTT	2	10	42788	42797	40 %	60 %	0 %	0 %	383486635
37	NC_017048	TTTAA	2	10	43068	43077	40 %	60 %	0 %	0 %	383486635
38	NC_017048	TAAAT	2	10	44088	44097	60 %	40 %	0 %	0 %	383486638
39	NC_017048	TACCT	2	10	44863	44872	20 %	40 %	0 %	40 %	383486639
40	NC_017048	TTTAA	2	10	44927	44936	40 %	60 %	0 %	0 %	383486639
41	NC_017048	TTAAA	2	10	45717	45726	60 %	40 %	0 %	0 %	383486642
42	NC_017048	TTAAT	2	10	47854	47863	40 %	60 %	0 %	0 %	383486647
43	NC_017048	TTTCA	2	10	47942	47951	20 %	60 %	0 %	20 %	383486647
44	NC_017048	CTTGA	2	10	48022	48031	20 %	40 %	20 %	20 %	383486647
45	NC_017048	ATTCT	2	10	48136	48145	20 %	60 %	0 %	20 %	383486647
46	NC_017048	TAATT	2	10	49429	49438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017048	ATGTA	2	10	49476	49485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017048	ATTTT	2	10	50496	50505	20 %	80 %	0 %	0 %	383486651
49	NC_017048	GTAAA	2	10	54366	54375	60 %	20 %	20 %	0 %	383486654
50	NC_017048	ATTAG	2	10	54792	54801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017048	TGACA	2	10	55961	55970	40 %	20 %	20 %	20 %	383486655
52	NC_017048	CAAAT	2	10	56640	56649	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017048	CAAAA	2	10	58508	58517	80 %	0 %	0 %	20 %	383486657
54	NC_017048	CCTAT	2	10	59191	59200	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017048	TACCT	2	10	60917	60926	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017048	TTATA	2	10	61985	61994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017048	TATAA	2	10	62741	62750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017048	ATATT	2	10	63509	63518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017048	TAATT	2	10	63923	63932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017048	AAAAT	2	10	64773	64782	80 %	20 %	0 %	0 %	383486660
61	NC_017048	CTATA	2	10	66525	66534	40 %	40 %	0 %	20 %	383486662
62	NC_017048	TTCTA	2	10	67270	67279	20 %	60 %	0 %	20 %	383486662
63	NC_017048	TGTTT	2	10	67914	67923	0 %	80 %	20 %	0 %	383486662
64	NC_017048	CACAA	2	10	68297	68306	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017048	ATTGC	2	10	68388	68397	20 %	40 %	20 %	20 %	383486663
66	NC_017048	TAAAA	2	10	68593	68602	80 %	20 %	0 %	0 %	383486663
67	NC_017048	CAATC	2	10	69210	69219	40 %	20 %	0 %	40 %	383486663
68	NC_017048	TTAGA	2	10	70085	70094	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017048	AATTT	2	10	70369	70378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017048	AATAT	2	10	73642	73651	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017048	GATTG	2	10	74995	75004	20 %	40 %	40 %	0 %	383486667
72	NC_017048	AGGAA	2	10	75017	75026	60 %	0 %	40 %	0 %	383486667
73	NC_017048	AAGTA	2	10	77342	77351	60 %	20 %	20 %	0 %	383486669
74	NC_017048	TAAAA	2	10	78006	78015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017048	ATAAG	2	10	78152	78161	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017048	GAATT	2	10	78164	78173	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017048	TATTT	2	10	79742	79751	20 %	80 %	0 %	0 %	383486671
78	NC_017048	AATTA	2	10	79775	79784	60 %	40 %	0 %	0 %	383486671
79	NC_017048	TACTT	2	10	81517	81526	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017048	AAGTT	2	10	81903	81912	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017048	GAAAT	2	10	82646	82655	60 %	20 %	20 %	0 %	383486673
82	NC_017048	TGTTT	2	10	83801	83810	0 %	80 %	20 %	0 %	383486674
83	NC_017048	TATTT	2	10	84590	84599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017048	AAGAG	2	10	89477	89486	60 %	0 %	40 %	0 %	383486678
85	NC_017048	TTGAT	2	10	89698	89707	20 %	60 %	20 %	0 %	383486678
86	NC_017048	ATTAT	2	10	91099	91108	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017048	ACTTT	2	10	92279	92288	20 %	60 %	0 %	20 %	383486679
88	NC_017048	ACATA	2	10	93652	93661	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017048	TTTCT	2	10	96716	96725	0 %	80 %	0 %	20 %	383486681
90	NC_017048	TATAT	2	10	98321	98330	40 %	60 %	0 %	0 %	383486683
91	NC_017048	TAATT	2	10	98438	98447	40 %	60 %	0 %	0 %	383486683
92	NC_017048	ATATT	2	10	99433	99442	40 %	60 %	0 %	0 %	383486683
93	NC_017048	AGAAT	2	10	99937	99946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017048	GATTG	2	10	100249	100258	20 %	40 %	40 %	0 %	383486684
95	NC_017048	AATCT	2	10	101029	101038	40 %	40 %	0 %	20 %	383486685
96	NC_017048	ATTAT	2	10	101167	101176	40 %	60 %	0 %	0 %	383486685
97	NC_017048	ATTTT	2	10	101366	101375	20 %	80 %	0 %	0 %	383486685
98	NC_017048	ATTAC	2	10	106641	106650	40 %	40 %	0 %	20 %	383486688
99	NC_017048	AAGAT	2	10	107875	107884	60 %	20 %	20 %	0 %	383486689
100	NC_017048	CTTTA	2	10	108046	108055	20 %	60 %	0 %	20 %	383486689
101	NC_017048	TTGGA	2	10	109427	109436	20 %	40 %	40 %	0 %	383486689
102	NC_017048	TAAAA	2	10	109586	109595	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017048	ATAAC	2	10	109794	109803	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017048	TGTCT	2	10	109811	109820	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017048	ATTAC	2	10	110110	110119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017048	GCATT	2	10	110971	110980	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017048	GCATT	2	10	111831	111840	20 %	40 %	20 %	20 %	383486690
108	NC_017048	TTAAT	2	10	114603	114612	40 %	60 %	0 %	0 %	383486690
109	NC_017048	TTCAA	2	10	115424	115433	40 %	40 %	0 %	20 %	383486690
110	NC_017048	ATTAA	2	10	115766	115775	60 %	40 %	0 %	0 %	383486690
111	NC_017048	CCCTG	2	10	115916	115925	0 %	20 %	20 %	60 %	383486690
112	NC_017048	TATTT	2	10	116638	116647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017048	TTATC	2	10	118226	118235	20 %	60 %	0 %	20 %	383486691
114	NC_017048	TACCA	2	10	118398	118407	40 %	20 %	0 %	40 %	383486691
115	NC_017048	TATTT	2	10	120026	120035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017048	ATACG	2	10	120464	120473	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017048	TTGAT	2	10	123170	123179	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017048	AGATA	2	10	123420	123429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017048	CACAT	2	10	123802	123811	40 %	20 %	0 %	40 %	383486695
120	NC_017048	ATGAG	2	10	125510	125519	40 %	20 %	40 %	0 %	383486699
121	NC_017048	AACTT	2	10	126445	126454	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017048	ATTAT	2	10	126800	126809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017048	TTTGT	2	10	127666	127675	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017048	AGCTA	2	10	128688	128697	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017048	AGAAT	2	10	129228	129237	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017048	GAGAA	2	10	129301	129310	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017048	GATAA	2	10	131649	131658	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017048	TTCTA	2	10	133827	133836	20 %	60 %	0 %	20 %	383486703
129	NC_017048	TCTTT	2	10	135389	135398	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017048	ATTTA	2	10	135894	135903	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017048	GATAG	2	10	136046	136055	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017048	TCTAA	2	10	137623	137632	40 %	40 %	0 %	20 %	383486705
133	NC_017048	AAGAA	2	10	140779	140788	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017048	AAAAT	2	10	142124	142133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017048	ATATC	2	10	142808	142817	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017048	TGATT	2	10	142847	142856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017048	TTATT	2	10	143475	143484	20 %	80 %	0 %	0 %	383486709
138	NC_017048	TTAAG	2	10	144688	144697	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017048	TTTTA	2	10	146300	146309	20 %	80 %	0 %	0 %	383486713
140	NC_017048	TAATT	2	10	146447	146456	40 %	60 %	0 %	0 %	383486713
141	NC_017048	AAATT	2	10	147153	147162	60 %	40 %	0 %	0 %	383486714
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