MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 3487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017048	TAAG	2	8	736	743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017048	CTTA	2	8	907	914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017048	AATC	2	8	1155	1162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017048	CTTC	2	8	1189	1196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017048	ATTT	2	8	1617	1624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017048	TAAT	2	8	1656	1663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017048	AATA	2	8	1913	1920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017048	CATA	2	8	1961	1968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017048	AATG	2	8	2085	2092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017048	CATC	2	8	3696	3703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017048	CGTT	2	8	3873	3880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017048	CTAT	2	8	3980	3987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017048	CTTA	2	8	4209	4216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017048	AAAC	2	8	4236	4243	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017048	AAAT	2	8	4354	4361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017048	ACAT	2	8	4582	4589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017048	AGTT	2	8	4959	4966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017048	TAAA	2	8	4968	4975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017048	ATTA	2	8	5253	5260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017048	ATTT	2	8	5705	5712	25 %	75 %	0 %	0 %	383486605
21	NC_017048	GTAT	2	8	5756	5763	25 %	50 %	25 %	0 %	383486605
22	NC_017048	TAAA	2	8	6250	6257	75 %	25 %	0 %	0 %	383486605
23	NC_017048	ATTT	2	8	6601	6608	25 %	75 %	0 %	0 %	383486605
24	NC_017048	TAAA	2	8	6664	6671	75 %	25 %	0 %	0 %	383486605
25	NC_017048	TCAT	2	8	7228	7235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017048	ATAA	2	8	7262	7269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017048	TTTC	2	8	7414	7421	0 %	75 %	0 %	25 %	383486606
28	NC_017048	AATG	2	8	7762	7769	50 %	25 %	25 %	0 %	383486607
29	NC_017048	CGGA	2	8	7841	7848	25 %	0 %	50 %	25 %	383486607
30	NC_017048	ATTA	2	8	8317	8324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017048	TAAA	2	8	8526	8533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017048	ATTT	2	8	9036	9043	25 %	75 %	0 %	0 %	383486608
33	NC_017048	AGAA	2	8	9206	9213	75 %	0 %	25 %	0 %	383486608
34	NC_017048	AGTG	2	8	9301	9308	25 %	25 %	50 %	0 %	383486608
35	NC_017048	CAAG	2	8	9328	9335	50 %	0 %	25 %	25 %	383486608
36	NC_017048	CTTG	2	8	9640	9647	0 %	50 %	25 %	25 %	383486608
37	NC_017048	AAAT	2	8	10253	10260	75 %	25 %	0 %	0 %	383486608
38	NC_017048	ATTT	2	8	10286	10293	25 %	75 %	0 %	0 %	383486608
39	NC_017048	TGGT	2	8	10668	10675	0 %	50 %	50 %	0 %	383486608
40	NC_017048	TAAA	2	8	11066	11073	75 %	25 %	0 %	0 %	383486608
41	NC_017048	TTGC	2	8	11334	11341	0 %	50 %	25 %	25 %	383486608
42	NC_017048	AAAT	2	8	11441	11448	75 %	25 %	0 %	0 %	383486608
43	NC_017048	TATT	2	8	11501	11508	25 %	75 %	0 %	0 %	383486608
44	NC_017048	CTTG	2	8	11542	11549	0 %	50 %	25 %	25 %	383486608
45	NC_017048	TTAA	2	8	11599	11606	50 %	50 %	0 %	0 %	383486608
46	NC_017048	TTTA	2	8	12499	12506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017048	ATTT	2	8	12704	12711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017048	TACT	2	8	12723	12730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017048	TAAT	2	8	13295	13302	50 %	50 %	0 %	0 %	383486609
50	NC_017048	ATTA	2	8	13581	13588	50 %	50 %	0 %	0 %	383486609
51	NC_017048	TACT	2	8	13682	13689	25 %	50 %	0 %	25 %	383486609
52	NC_017048	AATA	2	8	14226	14233	75 %	25 %	0 %	0 %	383486609
53	NC_017048	ACTC	2	8	14436	14443	25 %	25 %	0 %	50 %	383486609
54	NC_017048	TACA	2	8	14697	14704	50 %	25 %	0 %	25 %	383486609
55	NC_017048	TAAA	2	8	16194	16201	75 %	25 %	0 %	0 %	383486610
56	NC_017048	AGAA	2	8	16659	16666	75 %	0 %	25 %	0 %	383486611
57	NC_017048	AATA	2	8	16738	16745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017048	ACAA	2	8	17165	17172	75 %	0 %	0 %	25 %	383486612
59	NC_017048	TAAA	2	8	17571	17578	75 %	25 %	0 %	0 %	383486612
60	NC_017048	ATTA	2	8	17692	17699	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
61	NC_017048	AAAT	2	8	17769	17776	75 %	25 %	0 %	0 %	383486612
62	NC_017048	TGCT	2	8	17904	17911	0 %	50 %	25 %	25 %	383486612
63	NC_017048	TATT	2	8	18036	18043	25 %	75 %	0 %	0 %	383486612
64	NC_017048	ATTT	2	8	18180	18187	25 %	75 %	0 %	0 %	383486612
65	NC_017048	TACT	2	8	18595	18602	25 %	50 %	0 %	25 %	383486612
66	NC_017048	GGAA	2	8	19223	19230	50 %	0 %	50 %	0 %	383486612
67	NC_017048	ATTA	2	8	19264	19271	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
68	NC_017048	TACT	2	8	20409	20416	25 %	50 %	0 %	25 %	383486612
69	NC_017048	TTAC	2	8	20736	20743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017048	TAAT	2	8	21441	21448	50 %	50 %	0 %	0 %	383486613
71	NC_017048	TCAA	2	8	21808	21815	50 %	25 %	0 %	25 %	383486614
72	NC_017048	TTAT	2	8	22281	22288	25 %	75 %	0 %	0 %	383486614
73	NC_017048	GAAT	2	8	22443	22450	50 %	25 %	25 %	0 %	383486614
74	NC_017048	CTAC	2	8	23069	23076	25 %	25 %	0 %	50 %	383486615
75	NC_017048	GCTT	2	8	23760	23767	0 %	50 %	25 %	25 %	383486615
76	NC_017048	TCAT	2	8	24688	24695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017048	ACAT	2	8	24797	24804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017048	AAAG	2	8	24838	24845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017048	TACA	2	8	24968	24975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017048	TACA	2	8	25228	25235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017048	TAAA	2	8	25283	25290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017048	AATA	2	8	25886	25893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017048	TTTA	2	8	26002	26009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017048	ATTA	2	8	26043	26050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017048	AAAT	2	8	26877	26884	75 %	25 %	0 %	0 %	383486616
86	NC_017048	AGAA	2	8	26908	26915	75 %	0 %	25 %	0 %	383486616
87	NC_017048	TAAT	2	8	27437	27444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017048	AATT	2	8	27843	27850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017048	GTAC	2	8	28371	28378	25 %	25 %	25 %	25 %	383486618
90	NC_017048	ATAA	2	8	29278	29285	75 %	25 %	0 %	0 %	383486618
91	NC_017048	CAAC	2	8	29557	29564	50 %	0 %	0 %	50 %	383486618
92	NC_017048	TAAT	3	12	29896	29907	50 %	50 %	0 %	0 %	383486619
93	NC_017048	CTTT	2	8	29924	29931	0 %	75 %	0 %	25 %	383486619
94	NC_017048	CTAT	2	8	30516	30523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017048	TGAA	2	8	30839	30846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017048	TAAT	2	8	31113	31120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017048	AAGA	2	8	31398	31405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017048	AAAT	2	8	31438	31445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017048	AATA	2	8	31455	31462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017048	AATT	2	8	31493	31500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017048	TACA	2	8	31709	31716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017048	ATTA	2	8	31895	31902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017048	TTCT	2	8	32075	32082	0 %	75 %	0 %	25 %	383486620
104	NC_017048	ATTA	2	8	32387	32394	50 %	50 %	0 %	0 %	383486620
105	NC_017048	CCTA	2	8	32408	32415	25 %	25 %	0 %	50 %	383486620
106	NC_017048	ATCC	2	8	32520	32527	25 %	25 %	0 %	50 %	383486620
107	NC_017048	ACAT	2	8	32780	32787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017048	CTTA	2	8	33684	33691	25 %	50 %	0 %	25 %	383486622
109	NC_017048	AAAT	2	8	33736	33743	75 %	25 %	0 %	0 %	383486622
110	NC_017048	TACT	2	8	34225	34232	25 %	50 %	0 %	25 %	383486622
111	NC_017048	TTGC	2	8	34503	34510	0 %	50 %	25 %	25 %	383486622
112	NC_017048	ATTA	2	8	34791	34798	50 %	50 %	0 %	0 %	383486623
113	NC_017048	ATTA	2	8	35100	35107	50 %	50 %	0 %	0 %	383486623
114	NC_017048	AAGT	2	8	35645	35652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017048	ATGT	2	8	35691	35698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017048	ATTT	2	8	35863	35870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017048	TTTA	2	8	35926	35933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017048	TCAT	2	8	36274	36281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017048	ATTA	2	8	36331	36338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017048	TATT	2	8	36406	36413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017048	ATTA	2	8	36843	36850	50 %	50 %	0 %	0 %	383486624
122	NC_017048	TCTA	2	8	36982	36989	25 %	50 %	0 %	25 %	383486625
123	NC_017048	AGCA	2	8	37270	37277	50 %	0 %	25 %	25 %	383486625
124	NC_017048	AATA	2	8	37672	37679	75 %	25 %	0 %	0 %	383486626
125	NC_017048	ACCC	2	8	37789	37796	25 %	0 %	0 %	75 %	383486626
126	NC_017048	TAAA	2	8	37836	37843	75 %	25 %	0 %	0 %	383486626
127	NC_017048	ATCA	2	8	38008	38015	50 %	25 %	0 %	25 %	383486626
128	NC_017048	ATTT	2	8	38771	38778	25 %	75 %	0 %	0 %	383486627
129	NC_017048	TCTT	2	8	38926	38933	0 %	75 %	0 %	25 %	383486628
130	NC_017048	TCAG	2	8	39025	39032	25 %	25 %	25 %	25 %	383486628
131	NC_017048	ATTT	2	8	39234	39241	25 %	75 %	0 %	0 %	383486629
132	NC_017048	TCCT	2	8	39394	39401	0 %	50 %	0 %	50 %	383486629
133	NC_017048	TAAT	2	8	39518	39525	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
134	NC_017048	TGCT	2	8	39594	39601	0 %	50 %	25 %	25 %	383486629
135	NC_017048	AATT	2	8	39726	39733	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
136	NC_017048	TACT	2	8	39925	39932	25 %	50 %	0 %	25 %	383486630
137	NC_017048	TAAG	2	8	39939	39946	50 %	25 %	25 %	0 %	383486630
138	NC_017048	AAAG	2	8	40009	40016	75 %	0 %	25 %	0 %	383486630
139	NC_017048	TAAT	2	8	40235	40242	50 %	50 %	0 %	0 %	383486630
140	NC_017048	AAGC	2	8	40823	40830	50 %	0 %	25 %	25 %	383486630
141	NC_017048	ATTT	2	8	40857	40864	25 %	75 %	0 %	0 %	383486630
142	NC_017048	TTTA	2	8	41749	41756	25 %	75 %	0 %	0 %	383486632
143	NC_017048	GATA	2	8	41902	41909	50 %	25 %	25 %	0 %	383486633
144	NC_017048	ACCC	2	8	42072	42079	25 %	0 %	0 %	75 %	383486633
145	NC_017048	ATTT	2	8	42823	42830	25 %	75 %	0 %	0 %	383486635
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