MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 18081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017048	TTA	2	6	2	7	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017048	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017048	TAA	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017048	TTA	2	6	155	160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017048	TAA	2	6	445	450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017048	ATT	2	6	535	540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017048	TAT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017048	ATG	2	6	595	600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017048	AAC	2	6	615	620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017048	TTA	2	6	674	679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017048	TAA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017048	ATA	2	6	980	985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017048	ATT	2	6	991	996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017048	TAA	2	6	1023	1028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017048	TAA	2	6	1065	1070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017048	TAA	2	6	1237	1242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017048	ATT	2	6	1293	1298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017048	TAG	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017048	ATA	2	6	1447	1452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486604
20	NC_017048	ATA	2	6	1494	1499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486604
21	NC_017048	ACC	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486604
22	NC_017048	ATA	2	6	1698	1703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017048	AGA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017048	TAA	2	6	1771	1776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017048	ATT	2	6	1883	1888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017048	TAT	2	6	1889	1894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017048	ATA	2	6	1948	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017048	AAT	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017048	TAG	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017048	TTA	2	6	2079	2084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017048	ATT	2	6	2100	2105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017048	TAT	2	6	2129	2134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017048	TAA	2	6	2166	2171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017048	AAG	2	6	2214	2219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017048	TAA	2	6	2225	2230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017048	AAG	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017048	AGG	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017048	CAC	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017048	ATG	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017048	CGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017048	TCC	2	6	2769	2774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017048	GAC	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017048	ACC	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017048	TCC	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017048	TCC	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017048	CAT	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017048	CTA	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017048	TAG	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017048	AAC	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017048	GCT	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017048	TCA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017048	CTG	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017048	ATC	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017048	TCG	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017048	TCC	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017048	ATT	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017048	ATT	2	6	4083	4088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017048	TAA	2	6	4144	4149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017048	TAC	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017048	AGT	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017048	ATC	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017048	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017048	ATT	2	6	4366	4371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017048	GCT	2	6	4372	4377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017048	ATT	2	6	4489	4494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017048	TGT	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017048	ATT	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017048	TTA	2	6	4691	4696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017048	CAT	2	6	4697	4702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017048	AAG	2	6	4715	4720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017048	GAA	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017048	ATC	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017048	ACT	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017048	ATA	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017048	CTC	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017048	ATG	2	6	5033	5038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017048	TAT	2	6	5052	5057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017048	AAT	2	6	5087	5092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017048	ATA	2	6	5107	5112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017048	TAT	2	6	5115	5120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017048	TAT	2	6	5196	5201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017048	CAT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017048	ATT	2	6	5333	5338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017048	TTA	2	6	5352	5357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017048	ACC	2	6	5369	5374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486605
86	NC_017048	ATT	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
87	NC_017048	TCT	2	6	5439	5444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486605
88	NC_017048	CTA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
89	NC_017048	TAC	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
90	NC_017048	GTT	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486605
91	NC_017048	ATC	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
92	NC_017048	ATC	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
93	NC_017048	AAT	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
94	NC_017048	AAT	2	6	5909	5914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
95	NC_017048	GCT	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
96	NC_017048	GCT	2	6	6100	6105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
97	NC_017048	TAA	2	6	6287	6292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
98	NC_017048	TAT	2	6	6331	6336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
99	NC_017048	TAT	2	6	6355	6360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
100	NC_017048	GCT	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
101	NC_017048	TAT	2	6	6406	6411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486605
102	NC_017048	CTA	2	6	6412	6417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
103	NC_017048	TAA	2	6	6428	6433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
104	NC_017048	CAT	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
105	NC_017048	CTA	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
106	NC_017048	TCA	2	6	6621	6626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
107	NC_017048	CTA	2	6	6775	6780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
108	NC_017048	TCT	2	6	6808	6813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486605
109	NC_017048	AGC	2	6	6884	6889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486605
110	NC_017048	TAA	2	6	7010	7015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
111	NC_017048	AGT	2	6	7067	7072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486605
112	NC_017048	ATA	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486605
113	NC_017048	GCT	2	6	7089	7094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486605
114	NC_017048	CTA	2	6	7119	7124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486605
115	NC_017048	AAT	2	6	7212	7217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017048	TTC	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486606
117	NC_017048	TGC	2	6	7444	7449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486606
118	NC_017048	ATA	2	6	7489	7494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486606
119	NC_017048	GAA	2	6	7702	7707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
120	NC_017048	ATT	2	6	7749	7754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486607
121	NC_017048	AAT	3	9	7771	7779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
122	NC_017048	GAA	2	6	7786	7791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
123	NC_017048	AGA	2	6	7794	7799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
124	NC_017048	TAA	2	6	7829	7834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
125	NC_017048	ATA	2	6	7858	7863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
126	NC_017048	AAT	2	6	7890	7895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
127	NC_017048	AGA	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486607
128	NC_017048	TAT	2	6	7986	7991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486607
129	NC_017048	CTT	2	6	8006	8011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486607
130	NC_017048	ATT	2	6	8105	8110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486607
131	NC_017048	AAT	2	6	8280	8285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486607
132	NC_017048	ATA	2	6	8326	8331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017048	CTT	2	6	8343	8348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017048	ATT	2	6	8366	8371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017048	TAT	2	6	8382	8387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017048	TAT	2	6	8448	8453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017048	TTA	2	6	8640	8645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017048	TAT	2	6	8865	8870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017048	TAA	2	6	8885	8890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017048	AAT	2	6	8898	8903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486608
141	NC_017048	GCT	2	6	8950	8955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486608
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269	NC_017048	TAA	2	6	17476	17481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486612
270	NC_017048	TTG	2	6	17604	17609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486612
271	NC_017048	TTA	2	6	17656	17661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486612
272	NC_017048	AAT	2	6	17672	17677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486612
273	NC_017048	TTA	2	6	17718	17723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486612
274	NC_017048	ATA	2	6	17760	17765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486612
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280	NC_017048	CAA	2	6	18318	18323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486612
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387	NC_017048	ATT	2	6	25005	25010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_017048	TAA	2	6	25076	25081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_017048	CAT	2	6	25084	25089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
391	NC_017048	AGT	2	6	25120	25125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
392	NC_017048	TCA	2	6	25127	25132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_017048	TTA	2	6	25202	25207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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