MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 30224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017048	TACT	2	8	149291	149298	25 %	50 %	0 %	25 %	383486716
4003	NC_017048	T	7	7	149312	149318	0 %	100 %	0 %	0 %	383486716
4004	NC_017048	A	7	7	149319	149325	100 %	0 %	0 %	0 %	383486716
4005	NC_017048	AGA	2	6	149340	149345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486716
4006	NC_017048	AAT	2	6	149347	149352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486716
4007	NC_017048	ATG	2	6	149363	149368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486716
4008	NC_017048	TAC	2	6	149377	149382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486716
4009	NC_017048	AAT	2	6	149398	149403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486716
4010	NC_017048	GTT	2	6	149421	149426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486716
4011	NC_017048	TGAT	2	8	149459	149466	25 %	50 %	25 %	0 %	383486716
4012	NC_017048	ACT	2	6	149506	149511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486716
4013	NC_017048	TAA	2	6	149513	149518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486716
4014	NC_017048	TGA	2	6	149568	149573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486716
4015	NC_017048	TAA	3	9	149658	149666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486716
4016	NC_017048	ATTT	2	8	149768	149775	25 %	75 %	0 %	0 %	383486716
4017	NC_017048	ATC	2	6	149796	149801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486716
4018	NC_017048	TTA	2	6	149839	149844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486716
4019	NC_017048	T	7	7	149866	149872	0 %	100 %	0 %	0 %	383486716
4020	NC_017048	GAT	2	6	149887	149892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486716
4021	NC_017048	CTG	2	6	149906	149911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486716
4022	NC_017048	AAGCT	2	10	150071	150080	40 %	20 %	20 %	20 %	383486716
4023	NC_017048	TTA	2	6	150160	150165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486716
4024	NC_017048	TGA	3	9	150168	150176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486716
4025	NC_017048	CTTG	2	8	150184	150191	0 %	50 %	25 %	25 %	383486716
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4027	NC_017048	GCT	2	6	150240	150245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486716
4028	NC_017048	A	9	9	150249	150257	100 %	0 %	0 %	0 %	383486716
4029	NC_017048	AT	4	8	150296	150303	50 %	50 %	0 %	0 %	383486716
4030	NC_017048	T	7	7	150354	150360	0 %	100 %	0 %	0 %	383486716
4031	NC_017048	GAT	2	6	150412	150417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486716
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4035	NC_017048	ATTT	2	8	150639	150646	25 %	75 %	0 %	0 %	383486716
4036	NC_017048	GAT	2	6	150649	150654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486716
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4038	NC_017048	TAA	2	6	150813	150818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486716
4039	NC_017048	ATACC	2	10	150821	150830	40 %	20 %	0 %	40 %	383486716
4040	NC_017048	TTG	2	6	150837	150842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486716
4041	NC_017048	AAAC	2	8	150856	150863	75 %	0 %	0 %	25 %	383486716
4042	NC_017048	ATA	2	6	150901	150906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017048	TAT	2	6	150972	150977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017048	ACAA	2	8	150994	151001	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_017048	ACT	2	6	151016	151021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017048	ATT	2	6	151032	151037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017048	TAC	2	6	151038	151043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_017048	AT	3	6	151068	151073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017048	TAA	2	6	151110	151115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017048	CAGT	2	8	151229	151236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4051	NC_017048	TTTTA	2	10	151254	151263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017048	T	7	7	151280	151286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017048	TAAA	2	8	151290	151297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017048	CTTT	2	8	151321	151328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4055	NC_017048	T	6	6	151339	151344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017048	AT	3	6	151382	151387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017048	TAG	2	6	151407	151412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017048	AT	3	6	151471	151476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017048	TAT	2	6	151490	151495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017048	AT	3	6	151498	151503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017048	ATAA	2	8	151508	151515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017048	T	7	7	151529	151535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017048	TCTTTT	2	12	151559	151570	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4064	NC_017048	TAA	2	6	151574	151579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017048	AAGC	2	8	151590	151597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_017048	ATT	2	6	151619	151624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017048	TA	3	6	151641	151646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4069	NC_017048	T	6	6	151692	151697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017048	GTT	2	6	151730	151735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017048	TAG	3	9	151794	151802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4073	NC_017048	A	6	6	151871	151876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017048	TAA	2	6	151906	151911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017048	ATA	2	6	151921	151926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017048	TGA	2	6	152037	152042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486717
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4090	NC_017048	CAAT	2	8	152648	152655	50 %	25 %	0 %	25 %	383486717
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4094	NC_017048	T	6	6	152853	152858	0 %	100 %	0 %	0 %	383486717
4095	NC_017048	CAA	2	6	152868	152873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486717
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4097	NC_017048	AAT	2	6	152985	152990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017048	T	6	6	152995	153000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017048	AAT	2	6	153007	153012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017048	CAAG	2	8	153031	153038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_017048	TAG	2	6	153095	153100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017048	TAC	2	6	153106	153111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017048	AAT	2	6	153180	153185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017048	TGA	2	6	153255	153260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017048	AT	3	6	153264	153269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017048	CTA	2	6	153319	153324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_017048	TAT	2	6	153369	153374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017048	TAA	2	6	153396	153401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017048	TA	3	6	153404	153409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017048	TTA	2	6	153434	153439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017048	ATT	2	6	153449	153454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017048	TAA	2	6	153455	153460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017048	ATA	2	6	153501	153506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017048	ATT	2	6	153507	153512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017048	AGT	2	6	153514	153519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017048	TA	4	8	153520	153527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017048	TAA	3	9	153571	153579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017048	ATT	2	6	153584	153589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017048	ATA	2	6	153601	153606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017048	TAT	2	6	153665	153670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017048	ATG	2	6	153694	153699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017048	TTAG	2	8	153704	153711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017048	ATT	2	6	153716	153721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017048	TTA	2	6	153743	153748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017048	GAT	2	6	153749	153754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017048	TAA	2	6	153767	153772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017048	GA	3	6	153777	153782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017048	GGC	2	6	153799	153804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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