MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 30224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017048	GGTGCA	2	12	55362	55373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383486655
1503	NC_017048	GC	3	6	55387	55392	0 %	0 %	50 %	50 %	383486655
1504	NC_017048	TGC	2	6	55394	55399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486655
1505	NC_017048	TATT	2	8	55450	55457	25 %	75 %	0 %	0 %	383486655
1506	NC_017048	CAG	2	6	55459	55464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486655
1507	NC_017048	GGT	2	6	55473	55478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383486655
1508	NC_017048	TAT	2	6	55499	55504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486655
1509	NC_017048	AGG	2	6	55571	55576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383486655
1510	NC_017048	AACA	2	8	55678	55685	75 %	0 %	0 %	25 %	383486655
1511	NC_017048	ATG	2	6	55827	55832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486655
1512	NC_017048	AGC	2	6	55871	55876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486655
1513	NC_017048	TGACA	2	10	55961	55970	40 %	20 %	20 %	20 %	383486655
1514	NC_017048	GCT	2	6	55989	55994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486655
1515	NC_017048	AGA	2	6	56006	56011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486655
1516	NC_017048	ATT	2	6	56034	56039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486655
1517	NC_017048	GTT	2	6	56088	56093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383486655
1518	NC_017048	GAA	2	6	56166	56171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486655
1519	NC_017048	ACA	2	6	56192	56197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486655
1520	NC_017048	CAA	2	6	56324	56329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486655
1521	NC_017048	ATC	2	6	56351	56356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486655
1522	NC_017048	AAT	2	6	56394	56399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486655
1523	NC_017048	ATA	2	6	56446	56451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486655
1524	NC_017048	AAGA	2	8	56486	56493	75 %	0 %	25 %	0 %	383486655
1525	NC_017048	GAA	2	6	56515	56520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017048	ATA	2	6	56533	56538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017048	ATT	2	6	56547	56552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017048	CAAAT	2	10	56640	56649	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1529	NC_017048	AAG	2	6	56667	56672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017048	A	6	6	56679	56684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017048	AAT	2	6	56733	56738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017048	AAT	2	6	56778	56783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017048	CT	3	6	56809	56814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_017048	T	7	7	56838	56844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017048	TGA	2	6	56873	56878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017048	ATA	2	6	56888	56893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017048	ATT	2	6	56955	56960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017048	T	6	6	56959	56964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017048	T	7	7	56970	56976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017048	ATA	2	6	56993	56998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017048	CTT	2	6	57040	57045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486656
1542	NC_017048	T	6	6	57087	57092	0 %	100 %	0 %	0 %	383486656
1543	NC_017048	TAG	2	6	57100	57105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486656
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1547	NC_017048	GAT	2	6	57230	57235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486656
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1549	NC_017048	ATA	2	6	57333	57338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486656
1550	NC_017048	ATT	2	6	57431	57436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486656
1551	NC_017048	CTT	2	6	57465	57470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486656
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1553	NC_017048	A	6	6	57533	57538	100 %	0 %	0 %	0 %	383486656
1554	NC_017048	TTC	2	6	57563	57568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486656
1555	NC_017048	TAA	2	6	57592	57597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017048	TTG	2	6	57600	57605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017048	AT	3	6	57661	57666	50 %	50 %	0 %	0 %	383486657
1558	NC_017048	A	7	7	57698	57704	100 %	0 %	0 %	0 %	383486657
1559	NC_017048	TCCA	2	8	57709	57716	25 %	25 %	0 %	50 %	383486657
1560	NC_017048	TAC	2	6	57742	57747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486657
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1562	NC_017048	A	7	7	57838	57844	100 %	0 %	0 %	0 %	383486657
1563	NC_017048	TA	3	6	57890	57895	50 %	50 %	0 %	0 %	383486657
1564	NC_017048	A	6	6	57918	57923	100 %	0 %	0 %	0 %	383486657
1565	NC_017048	AT	3	6	57929	57934	50 %	50 %	0 %	0 %	383486657
1566	NC_017048	AT	3	6	57959	57964	50 %	50 %	0 %	0 %	383486657
1567	NC_017048	CT	3	6	57970	57975	0 %	50 %	0 %	50 %	383486657
1568	NC_017048	TAAG	3	12	57976	57987	50 %	25 %	25 %	0 %	383486657
1569	NC_017048	CCA	2	6	58026	58031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486657
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1582	NC_017048	A	6	6	58564	58569	100 %	0 %	0 %	0 %	383486657
1583	NC_017048	T	6	6	58636	58641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_017048	ACT	2	6	58980	58985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1599	NC_017048	TTTA	2	8	59094	59101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_017048	ATC	2	6	59133	59138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017048	CCTAT	2	10	59191	59200	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1603	NC_017048	AAT	2	6	59204	59209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017048	TAAT	2	8	59233	59240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017048	TGC	2	6	59274	59279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1608	NC_017048	TTA	2	6	59500	59505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1610	NC_017048	TTA	2	6	59545	59550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017048	ATA	2	6	59563	59568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_017048	TCT	2	6	59674	59679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_017048	TAT	2	6	59730	59735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_017048	ATA	2	6	59779	59784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017048	ATA	2	6	59800	59805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017048	T	8	8	59815	59822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1622	NC_017048	TTTA	2	8	59897	59904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017048	AGT	2	6	59957	59962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1626	NC_017048	AAT	2	6	60122	60127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_017048	TAC	2	6	60218	60223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_017048	TAA	2	6	60230	60235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017048	CT	3	6	60255	60260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_017048	ATG	2	6	60279	60284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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