MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 30224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017048	ATCA	2	8	38008	38015	50 %	25 %	0 %	25 %	383486626
1002	NC_017048	CTG	2	6	38019	38024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486626
1003	NC_017048	ACA	2	6	38027	38032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486626
1004	NC_017048	TCT	2	6	38126	38131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486626
1005	NC_017048	AGA	2	6	38146	38151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486626
1006	NC_017048	AGA	2	6	38206	38211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486626
1007	NC_017048	TAA	2	6	38212	38217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486626
1008	NC_017048	TAT	2	6	38289	38294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486626
1009	NC_017048	TTA	2	6	38334	38339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486626
1010	NC_017048	CTT	3	9	38396	38404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486627
1011	NC_017048	GAT	2	6	38435	38440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486627
1012	NC_017048	CTG	2	6	38637	38642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486627
1013	NC_017048	AGA	2	6	38647	38652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486627
1014	NC_017048	TAT	2	6	38691	38696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486627
1015	NC_017048	ACA	2	6	38717	38722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486627
1016	NC_017048	TCTTTT	2	12	38736	38747	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383486627
1017	NC_017048	ATTT	2	8	38771	38778	25 %	75 %	0 %	0 %	383486627
1018	NC_017048	TAT	2	6	38794	38799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486628
1019	NC_017048	T	7	7	38807	38813	0 %	100 %	0 %	0 %	383486628
1020	NC_017048	TCTT	2	8	38926	38933	0 %	75 %	0 %	25 %	383486628
1021	NC_017048	AAT	2	6	38994	38999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486628
1022	NC_017048	TTA	2	6	39011	39016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486628
1023	NC_017048	TCAG	2	8	39025	39032	25 %	25 %	25 %	25 %	383486628
1024	NC_017048	TTA	2	6	39067	39072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486628
1025	NC_017048	CTG	2	6	39080	39085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486628
1026	NC_017048	TAT	2	6	39137	39142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486628
1027	NC_017048	AAT	2	6	39175	39180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017048	ATA	2	6	39207	39212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017048	TGA	2	6	39223	39228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017048	ATTT	2	8	39234	39241	25 %	75 %	0 %	0 %	383486629
1031	NC_017048	TA	3	6	39297	39302	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
1032	NC_017048	TAA	2	6	39322	39327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486629
1033	NC_017048	TA	3	6	39353	39358	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
1034	NC_017048	T	8	8	39368	39375	0 %	100 %	0 %	0 %	383486629
1035	NC_017048	CTT	2	6	39380	39385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486629
1036	NC_017048	TAT	2	6	39386	39391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486629
1037	NC_017048	TCCT	2	8	39394	39401	0 %	50 %	0 %	50 %	383486629
1038	NC_017048	TA	3	6	39470	39475	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
1039	NC_017048	TAAT	2	8	39518	39525	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
1040	NC_017048	AT	3	6	39546	39551	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
1041	NC_017048	TGCT	2	8	39594	39601	0 %	50 %	25 %	25 %	383486629
1042	NC_017048	AT	3	6	39626	39631	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
1043	NC_017048	ATA	2	6	39653	39658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486629
1044	NC_017048	A	7	7	39658	39664	100 %	0 %	0 %	0 %	383486629
1045	NC_017048	ATT	2	6	39720	39725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486629
1046	NC_017048	AATT	2	8	39726	39733	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
1047	NC_017048	TAA	2	6	39755	39760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486629
1048	NC_017048	AT	3	6	39770	39775	50 %	50 %	0 %	0 %	383486629
1049	NC_017048	T	7	7	39803	39809	0 %	100 %	0 %	0 %	383486629
1050	NC_017048	GGA	2	6	39847	39852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383486629
1051	NC_017048	A	7	7	39856	39862	100 %	0 %	0 %	0 %	383486629
1052	NC_017048	T	6	6	39892	39897	0 %	100 %	0 %	0 %	383486630
1053	NC_017048	ATTTT	2	10	39899	39908	20 %	80 %	0 %	0 %	383486630
1054	NC_017048	T	7	7	39905	39911	0 %	100 %	0 %	0 %	383486630
1055	NC_017048	TACT	2	8	39925	39932	25 %	50 %	0 %	25 %	383486630
1056	NC_017048	TAAG	2	8	39939	39946	50 %	25 %	25 %	0 %	383486630
1057	NC_017048	A	6	6	39991	39996	100 %	0 %	0 %	0 %	383486630
1058	NC_017048	CCT	2	6	40003	40008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383486630
1059	NC_017048	AAAG	2	8	40009	40016	75 %	0 %	25 %	0 %	383486630
1060	NC_017048	AT	3	6	40071	40076	50 %	50 %	0 %	0 %	383486630
1061	NC_017048	TA	3	6	40104	40109	50 %	50 %	0 %	0 %	383486630
1062	NC_017048	AAT	2	6	40115	40120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486630
1063	NC_017048	T	6	6	40129	40134	0 %	100 %	0 %	0 %	383486630
1064	NC_017048	ATT	2	6	40176	40181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486630
1065	NC_017048	TTC	2	6	40188	40193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486630
1066	NC_017048	A	8	8	40217	40224	100 %	0 %	0 %	0 %	383486630
1067	NC_017048	A	6	6	40227	40232	100 %	0 %	0 %	0 %	383486630
1068	NC_017048	TAAT	2	8	40235	40242	50 %	50 %	0 %	0 %	383486630
1069	NC_017048	ATA	2	6	40250	40255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486630
1070	NC_017048	AT	3	6	40258	40263	50 %	50 %	0 %	0 %	383486630
1071	NC_017048	TAA	2	6	40285	40290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486630
1072	NC_017048	GTA	2	6	40339	40344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486630
1073	NC_017048	TGG	2	6	40374	40379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383486630
1074	NC_017048	ATTTA	2	10	40395	40404	40 %	60 %	0 %	0 %	383486630
1075	NC_017048	AAT	2	6	40471	40476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486630
1076	NC_017048	A	8	8	40494	40501	100 %	0 %	0 %	0 %	383486630
1077	NC_017048	TAA	2	6	40515	40520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486630
1078	NC_017048	ACT	2	6	40522	40527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486630
1079	NC_017048	TAA	2	6	40592	40597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486630
1080	NC_017048	TAC	2	6	40758	40763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486630
1081	NC_017048	AAGC	2	8	40823	40830	50 %	0 %	25 %	25 %	383486630
1082	NC_017048	ATTT	2	8	40857	40864	25 %	75 %	0 %	0 %	383486630
1083	NC_017048	CTT	2	6	40883	40888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486630
1084	NC_017048	T	7	7	40887	40893	0 %	100 %	0 %	0 %	383486630
1085	NC_017048	ATA	2	6	40933	40938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486630
1086	NC_017048	AT	3	6	40951	40956	50 %	50 %	0 %	0 %	383486630
1087	NC_017048	GGTATA	2	12	41083	41094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486630
1088	NC_017048	AAT	2	6	41136	41141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486630
1089	NC_017048	T	6	6	41166	41171	0 %	100 %	0 %	0 %	383486630
1090	NC_017048	AT	3	6	41188	41193	50 %	50 %	0 %	0 %	383486630
1091	NC_017048	TAA	2	6	41196	41201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486631
1092	NC_017048	AGA	2	6	41238	41243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486631
1093	NC_017048	ATC	2	6	41280	41285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486631
1094	NC_017048	ATA	2	6	41297	41302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486631
1095	NC_017048	TAT	2	6	41318	41323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486631
1096	NC_017048	TAA	2	6	41357	41362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486631
1097	NC_017048	CTT	2	6	41396	41401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486631
1098	NC_017048	TAT	2	6	41418	41423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486631
1099	NC_017048	T	6	6	41430	41435	0 %	100 %	0 %	0 %	383486631
1100	NC_017048	ACC	2	6	41490	41495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486631
1101	NC_017048	CAG	2	6	41552	41557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486631
1102	NC_017048	T	7	7	41594	41600	0 %	100 %	0 %	0 %	383486631
1103	NC_017048	T	8	8	41602	41609	0 %	100 %	0 %	0 %	383486631
1104	NC_017048	ATT	2	6	41619	41624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486631
1105	NC_017048	TAA	2	6	41677	41682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486632
1106	NC_017048	TTA	2	6	41741	41746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486632
1107	NC_017048	TTTA	2	8	41749	41756	25 %	75 %	0 %	0 %	383486632
1108	NC_017048	TAT	2	6	41829	41834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486632
1109	NC_017048	TAT	2	6	41841	41846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486632
1110	NC_017048	GATA	2	8	41902	41909	50 %	25 %	25 %	0 %	383486633
1111	NC_017048	T	6	6	41920	41925	0 %	100 %	0 %	0 %	383486633
1112	NC_017048	TCT	2	6	41929	41934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486633
1113	NC_017048	CAA	2	6	42027	42032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486633
1114	NC_017048	ACCC	2	8	42072	42079	25 %	0 %	0 %	75 %	383486633
1115	NC_017048	CTT	2	6	42107	42112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486633
1116	NC_017048	AGC	2	6	42124	42129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486633
1117	NC_017048	CAA	2	6	42141	42146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486633
1118	NC_017048	ATG	2	6	42151	42156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486633
1119	NC_017048	TCA	2	6	42186	42191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486633
1120	NC_017048	CTT	2	6	42237	42242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486633
1121	NC_017048	CAA	2	6	42285	42290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486633
1122	NC_017048	TCT	2	6	42313	42318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383486633
1123	NC_017048	ACC	2	6	42319	42324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383486633
1124	NC_017048	TAC	2	6	42328	42333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486633
1125	NC_017048	T	8	8	42383	42390	0 %	100 %	0 %	0 %	383486633
1126	NC_017048	ATT	2	6	42401	42406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486633
1127	NC_017048	ATTTT	2	10	42424	42433	20 %	80 %	0 %	0 %	383486634
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1129	NC_017048	TAC	2	6	42497	42502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486634
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