MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii str. GvV257 chromosome

Total Repeats: 30224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017048	AGG	2	6	19516	19521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383486612
503	NC_017048	TTA	2	6	19537	19542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486612
504	NC_017048	ATT	2	6	19545	19550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486612
505	NC_017048	TGA	2	6	19564	19569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383486612
506	NC_017048	TAA	2	6	19584	19589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486612
507	NC_017048	ATT	2	6	19751	19756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486612
508	NC_017048	TA	3	6	19825	19830	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
509	NC_017048	T	6	6	19867	19872	0 %	100 %	0 %	0 %	383486612
510	NC_017048	T	8	8	19906	19913	0 %	100 %	0 %	0 %	383486612
511	NC_017048	TA	3	6	19922	19927	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
512	NC_017048	TAA	2	6	19975	19980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486612
513	NC_017048	TAT	2	6	20029	20034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486612
514	NC_017048	ATA	2	6	20055	20060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486612
515	NC_017048	ATT	2	6	20080	20085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486612
516	NC_017048	G	6	6	20132	20137	0 %	0 %	100 %	0 %	383486612
517	NC_017048	TTA	2	6	20141	20146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486612
518	NC_017048	CAT	2	6	20161	20166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486612
519	NC_017048	AT	3	6	20251	20256	50 %	50 %	0 %	0 %	383486612
520	NC_017048	GAA	2	6	20324	20329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486612
521	NC_017048	GCT	2	6	20363	20368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383486612
522	NC_017048	A	6	6	20397	20402	100 %	0 %	0 %	0 %	383486612
523	NC_017048	TACT	2	8	20409	20416	25 %	50 %	0 %	25 %	383486612
524	NC_017048	TTA	2	6	20477	20482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486612
525	NC_017048	AGTTA	2	10	20677	20686	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017048	TTAC	2	8	20736	20743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_017048	TAA	2	6	20745	20750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017048	AAT	2	6	20763	20768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017048	AAT	2	6	20773	20778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017048	CAT	2	6	20786	20791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017048	AT	3	6	20826	20831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017048	ACT	2	6	20843	20848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017048	GAT	2	6	20851	20856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017048	AT	3	6	20886	20891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017048	T	6	6	20945	20950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017048	ACA	2	6	20986	20991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486613
537	NC_017048	TAATA	2	10	21011	21020	60 %	40 %	0 %	0 %	383486613
538	NC_017048	GCA	2	6	21063	21068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486613
539	NC_017048	TAA	2	6	21076	21081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486613
540	NC_017048	ATC	2	6	21108	21113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486613
541	NC_017048	ATC	2	6	21144	21149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486613
542	NC_017048	CAA	2	6	21187	21192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383486613
543	NC_017048	AGC	2	6	21200	21205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383486613
544	NC_017048	GA	3	6	21219	21224	50 %	0 %	50 %	0 %	383486613
545	NC_017048	AAT	2	6	21245	21250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486613
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548	NC_017048	AATCA	2	10	21365	21374	60 %	20 %	0 %	20 %	383486613
549	NC_017048	TAT	2	6	21418	21423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486613
550	NC_017048	AAG	2	6	21430	21435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383486613
551	NC_017048	TAAT	2	8	21441	21448	50 %	50 %	0 %	0 %	383486613
552	NC_017048	AAATT	2	10	21478	21487	60 %	40 %	0 %	0 %	383486613
553	NC_017048	ATT	2	6	21509	21514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486613
554	NC_017048	A	9	9	21518	21526	100 %	0 %	0 %	0 %	383486613
555	NC_017048	A	6	6	21538	21543	100 %	0 %	0 %	0 %	383486613
556	NC_017048	TAT	2	6	21554	21559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486613
557	NC_017048	AT	3	6	21566	21571	50 %	50 %	0 %	0 %	383486613
558	NC_017048	A	6	6	21609	21614	100 %	0 %	0 %	0 %	383486613
559	NC_017048	CTA	2	6	21615	21620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486613
560	NC_017048	AT	3	6	21645	21650	50 %	50 %	0 %	0 %	383486613
561	NC_017048	AATTAA	2	12	21695	21706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486613
562	NC_017048	TAT	2	6	21713	21718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383486613
563	NC_017048	TATAT	2	10	21733	21742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017048	GT	3	6	21746	21751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017048	TCA	2	6	21756	21761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017048	TGA	2	6	21775	21780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017048	ATC	2	6	21792	21797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017048	TCAA	2	8	21808	21815	50 %	25 %	0 %	25 %	383486614
569	NC_017048	A	6	6	21817	21822	100 %	0 %	0 %	0 %	383486614
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571	NC_017048	AT	3	6	21915	21920	50 %	50 %	0 %	0 %	383486614
572	NC_017048	A	6	6	21926	21931	100 %	0 %	0 %	0 %	383486614
573	NC_017048	TGG	3	9	21984	21992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383486614
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579	NC_017048	CTA	2	6	22256	22261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383486614
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589	NC_017048	ATT	2	6	22587	22592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_017048	CTAC	2	8	23069	23076	25 %	25 %	0 %	50 %	383486615
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610	NC_017048	GA	3	6	23745	23750	50 %	0 %	50 %	0 %	383486615
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614	NC_017048	TAA	2	6	23975	23980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486615
615	NC_017048	GAAAA	2	10	24029	24038	80 %	0 %	20 %	0 %	383486615
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617	NC_017048	TAA	2	6	24069	24074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383486615
618	NC_017048	A	7	7	24095	24101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017048	CAA	2	6	24121	24126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017048	TTTTA	2	10	24138	24147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017048	TTA	2	6	24169	24174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017048	AT	3	6	24192	24197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017048	TTCAAT	2	12	24198	24209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
624	NC_017048	A	6	6	24217	24222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017048	TAA	2	6	24244	24249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_017048	TTA	2	6	24465	24470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017048	TAT	2	6	24476	24481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017048	ATG	2	6	24498	24503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017048	AAT	2	6	24528	24533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017048	TAA	2	6	24546	24551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017048	ATA	2	6	24639	24644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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