MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 12436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017047	GCTT	2	8	236	243	0 %	50 %	25 %	25 %	384255906
2	NC_017047	CAGC	2	8	315	322	25 %	0 %	25 %	50 %	384255906
3	NC_017047	TTCG	2	8	1114	1121	0 %	50 %	25 %	25 %	384255906
4	NC_017047	GCCC	2	8	1252	1259	0 %	0 %	25 %	75 %	384255906
5	NC_017047	ACCA	2	8	1294	1301	50 %	0 %	0 %	50 %	384255906
6	NC_017047	CGTT	2	8	1900	1907	0 %	50 %	25 %	25 %	384255907
7	NC_017047	CGAC	2	8	1962	1969	25 %	0 %	25 %	50 %	384255907
8	NC_017047	GCAG	2	8	2218	2225	25 %	0 %	50 %	25 %	384255907
9	NC_017047	CAGT	2	8	2509	2516	25 %	25 %	25 %	25 %	384255907
10	NC_017047	ACTG	2	8	2642	2649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017047	GGTC	2	8	2762	2769	0 %	25 %	50 %	25 %	384255908
12	NC_017047	TTTC	2	8	3334	3341	0 %	75 %	0 %	25 %	384255908
13	NC_017047	GCGG	2	8	3559	3566	0 %	0 %	75 %	25 %	384255908
14	NC_017047	CCGA	2	8	3610	3617	25 %	0 %	25 %	50 %	384255908
15	NC_017047	GCTG	2	8	3626	3633	0 %	25 %	50 %	25 %	384255908
16	NC_017047	ATCC	2	8	4492	4499	25 %	25 %	0 %	50 %	384255909
17	NC_017047	CTGG	2	8	4984	4991	0 %	25 %	50 %	25 %	384255909
18	NC_017047	GCGG	2	8	5068	5075	0 %	0 %	75 %	25 %	384255909
19	NC_017047	CGTG	2	8	5736	5743	0 %	25 %	50 %	25 %	384255909
20	NC_017047	TTCA	2	8	5827	5834	25 %	50 %	0 %	25 %	384255909
21	NC_017047	GGCT	2	8	6281	6288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017047	AATT	2	8	6355	6362	50 %	50 %	0 %	0 %	384255910
23	NC_017047	CCGT	2	8	6476	6483	0 %	25 %	25 %	50 %	384255910
24	NC_017047	TCAG	2	8	6844	6851	25 %	25 %	25 %	25 %	384255910
25	NC_017047	AAAC	2	8	7102	7109	75 %	0 %	0 %	25 %	384255910
26	NC_017047	CGTC	2	8	7276	7283	0 %	25 %	25 %	50 %	384255911
27	NC_017047	ATCA	2	8	8687	8694	50 %	25 %	0 %	25 %	384255912
28	NC_017047	AAGC	2	8	8947	8954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017047	TTTA	2	8	9302	9309	25 %	75 %	0 %	0 %	384255913
30	NC_017047	GTTG	2	8	9365	9372	0 %	50 %	50 %	0 %	384255913
31	NC_017047	GCTG	2	8	9545	9552	0 %	25 %	50 %	25 %	384255913
32	NC_017047	AGTA	2	8	10298	10305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017047	TATT	2	8	10316	10323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017047	TGTA	2	8	11081	11088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017047	TGTA	2	8	11109	11116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017047	GTTT	2	8	11119	11126	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017047	ATAA	2	8	11281	11288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017047	GAAT	2	8	11362	11369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017047	ATAA	2	8	11396	11403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017047	AAAC	2	8	12313	12320	75 %	0 %	0 %	25 %	384255916
41	NC_017047	TTCT	2	8	12497	12504	0 %	75 %	0 %	25 %	384255916
42	NC_017047	GCGT	2	8	12679	12686	0 %	25 %	50 %	25 %	384255916
43	NC_017047	TCAT	2	8	12693	12700	25 %	50 %	0 %	25 %	384255916
44	NC_017047	ATTA	2	8	13125	13132	50 %	50 %	0 %	0 %	384255917
45	NC_017047	GCTG	2	8	13269	13276	0 %	25 %	50 %	25 %	384255917
46	NC_017047	GAAA	2	8	13823	13830	75 %	0 %	25 %	0 %	384255917
47	NC_017047	GCTG	2	8	14737	14744	0 %	25 %	50 %	25 %	384255918
48	NC_017047	CGCA	2	8	15068	15075	25 %	0 %	25 %	50 %	384255918
49	NC_017047	AAAT	2	8	15381	15388	75 %	25 %	0 %	0 %	384255919
50	NC_017047	TTGT	2	8	15599	15606	0 %	75 %	25 %	0 %	384255919
51	NC_017047	ACAA	2	8	15662	15669	75 %	0 %	0 %	25 %	384255919
52	NC_017047	CAGC	2	8	15967	15974	25 %	0 %	25 %	50 %	384255919
53	NC_017047	GCCA	2	8	16062	16069	25 %	0 %	25 %	50 %	384255919
54	NC_017047	AGGC	2	8	16697	16704	25 %	0 %	50 %	25 %	384255920
55	NC_017047	CGCC	2	8	17722	17729	0 %	0 %	25 %	75 %	384255921
56	NC_017047	CTGG	2	8	18422	18429	0 %	25 %	50 %	25 %	384255921
57	NC_017047	TGCC	2	8	19043	19050	0 %	25 %	25 %	50 %	384255922
58	NC_017047	CCGC	2	8	19570	19577	0 %	0 %	25 %	75 %	384255922
59	NC_017047	GCCA	2	8	20090	20097	25 %	0 %	25 %	50 %	384255923
60	NC_017047	AAAT	2	8	21233	21240	75 %	25 %	0 %	0 %	384255923
61	NC_017047	CAAA	2	8	22157	22164	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017047	CGCC	2	8	22307	22314	0 %	0 %	25 %	75 %	384255924
63	NC_017047	ACCG	2	8	22398	22405	25 %	0 %	25 %	50 %	384255924
64	NC_017047	GCTT	2	8	22949	22956	0 %	50 %	25 %	25 %	384255924
65	NC_017047	CTGC	2	8	24752	24759	0 %	25 %	25 %	50 %	384255927
66	NC_017047	CTTT	2	8	24800	24807	0 %	75 %	0 %	25 %	384255927
67	NC_017047	GGCA	2	8	25456	25463	25 %	0 %	50 %	25 %	384255928
68	NC_017047	GGCG	2	8	26218	26225	0 %	0 %	75 %	25 %	384255928
69	NC_017047	GCTC	2	8	26910	26917	0 %	25 %	25 %	50 %	384255928
70	NC_017047	CGGA	2	8	26963	26970	25 %	0 %	50 %	25 %	384255928
71	NC_017047	ACGG	2	8	26981	26988	25 %	0 %	50 %	25 %	384255928
72	NC_017047	CCGA	2	8	28375	28382	25 %	0 %	25 %	50 %	384255931
73	NC_017047	ACTT	2	8	28618	28625	25 %	50 %	0 %	25 %	384255931
74	NC_017047	CTGC	2	8	28906	28913	0 %	25 %	25 %	50 %	384255931
75	NC_017047	ACCG	2	8	30112	30119	25 %	0 %	25 %	50 %	384255932
76	NC_017047	ACCG	2	8	30199	30206	25 %	0 %	25 %	50 %	384255932
77	NC_017047	CTGG	2	8	30221	30228	0 %	25 %	50 %	25 %	384255932
78	NC_017047	GCAT	2	8	30344	30351	25 %	25 %	25 %	25 %	384255932
79	NC_017047	CTCC	2	8	31189	31196	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_017047	GCTG	2	8	31421	31428	0 %	25 %	50 %	25 %	384255933
81	NC_017047	CTGA	2	8	32112	32119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017047	ACGT	2	8	32666	32673	25 %	25 %	25 %	25 %	384255934
83	NC_017047	GAAA	2	8	32754	32761	75 %	0 %	25 %	0 %	384255934
84	NC_017047	GCAG	2	8	33045	33052	25 %	0 %	50 %	25 %	384255934
85	NC_017047	ATAA	2	8	34207	34214	75 %	25 %	0 %	0 %	384255936
86	NC_017047	CCAG	2	8	34280	34287	25 %	0 %	25 %	50 %	384255936
87	NC_017047	TTTC	2	8	35111	35118	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017047	GACG	2	8	35450	35457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017047	GCTG	2	8	36040	36047	0 %	25 %	50 %	25 %	384255937
90	NC_017047	ATCT	2	8	36193	36200	25 %	50 %	0 %	25 %	384255937
91	NC_017047	ATTT	2	8	36332	36339	25 %	75 %	0 %	0 %	384255937
92	NC_017047	GGCG	2	8	36667	36674	0 %	0 %	75 %	25 %	384255937
93	NC_017047	CGTA	2	8	36685	36692	25 %	25 %	25 %	25 %	384255937
94	NC_017047	CCTG	2	8	36814	36821	0 %	25 %	25 %	50 %	384255937
95	NC_017047	CTGA	2	8	36854	36861	25 %	25 %	25 %	25 %	384255937
96	NC_017047	AGCC	2	8	36967	36974	25 %	0 %	25 %	50 %	384255937
97	NC_017047	TGAC	2	8	37017	37024	25 %	25 %	25 %	25 %	384255937
98	NC_017047	CCAG	2	8	37985	37992	25 %	0 %	25 %	50 %	384255938
99	NC_017047	AAAG	2	8	38789	38796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017047	CGGG	2	8	38803	38810	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017047	AAAT	2	8	39434	39441	75 %	25 %	0 %	0 %	384255939
102	NC_017047	CCGT	2	8	40425	40432	0 %	25 %	25 %	50 %	384255941
103	NC_017047	GTCA	2	8	40454	40461	25 %	25 %	25 %	25 %	384255941
104	NC_017047	CGCC	2	8	40594	40601	0 %	0 %	25 %	75 %	384255941
105	NC_017047	CAGG	2	8	41969	41976	25 %	0 %	50 %	25 %	384255942
106	NC_017047	GAAA	2	8	42010	42017	75 %	0 %	25 %	0 %	384255942
107	NC_017047	AAGA	2	8	42116	42123	75 %	0 %	25 %	0 %	384255942
108	NC_017047	AAGA	2	8	42233	42240	75 %	0 %	25 %	0 %	384255942
109	NC_017047	TCAG	2	8	43085	43092	25 %	25 %	25 %	25 %	384255944
110	NC_017047	CTGC	2	8	43217	43224	0 %	25 %	25 %	50 %	384255944
111	NC_017047	CTGC	2	8	44705	44712	0 %	25 %	25 %	50 %	384255944
112	NC_017047	TTTG	2	8	44786	44793	0 %	75 %	25 %	0 %	384255944
113	NC_017047	CTGA	2	8	44895	44902	25 %	25 %	25 %	25 %	384255944
114	NC_017047	TTAA	2	8	45998	46005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017047	GCGG	2	8	46560	46567	0 %	0 %	75 %	25 %	384255946
116	NC_017047	GGCT	2	8	46908	46915	0 %	25 %	50 %	25 %	384255946
117	NC_017047	CGCC	2	8	47524	47531	0 %	0 %	25 %	75 %	384255947
118	NC_017047	GCTG	2	8	47595	47602	0 %	25 %	50 %	25 %	384255947
119	NC_017047	AAAG	2	8	48128	48135	75 %	0 %	25 %	0 %	384255947
120	NC_017047	GCTG	2	8	49017	49024	0 %	25 %	50 %	25 %	384255947
121	NC_017047	GCTG	2	8	49228	49235	0 %	25 %	50 %	25 %	384255947
122	NC_017047	CAAC	2	8	50223	50230	50 %	0 %	0 %	50 %	384255948
123	NC_017047	TGCA	2	8	50483	50490	25 %	25 %	25 %	25 %	384255948
124	NC_017047	TCAG	2	8	50569	50576	25 %	25 %	25 %	25 %	384255948
125	NC_017047	CAAC	2	8	50635	50642	50 %	0 %	0 %	50 %	384255948
126	NC_017047	GTGC	2	8	51697	51704	0 %	25 %	50 %	25 %	384255949
127	NC_017047	CGGG	2	8	52268	52275	0 %	0 %	75 %	25 %	384255950
128	NC_017047	GCAG	2	8	52538	52545	25 %	0 %	50 %	25 %	384255950
129	NC_017047	CTGC	2	8	54117	54124	0 %	25 %	25 %	50 %	384255952
130	NC_017047	GCGG	2	8	54150	54157	0 %	0 %	75 %	25 %	384255952
131	NC_017047	ACAA	2	8	54907	54914	75 %	0 %	0 %	25 %	384255952
132	NC_017047	GGGA	2	8	55062	55069	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017047	GCCA	2	8	55207	55214	25 %	0 %	25 %	50 %	384255953
134	NC_017047	CGCC	2	8	56120	56127	0 %	0 %	25 %	75 %	384255953
135	NC_017047	CGGG	2	8	56446	56453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017047	GATA	2	8	56640	56647	50 %	25 %	25 %	0 %	384255954
137	NC_017047	TGCG	2	8	56651	56658	0 %	25 %	50 %	25 %	384255954
138	NC_017047	CTGC	2	8	57094	57101	0 %	25 %	25 %	50 %	384255954
139	NC_017047	CAGC	2	8	57198	57205	25 %	0 %	25 %	50 %	384255954
140	NC_017047	GTAC	2	8	57281	57288	25 %	25 %	25 %	25 %	384255954
141	NC_017047	CAGC	2	8	57486	57493	25 %	0 %	25 %	50 %	384255954
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143	NC_017047	AAAT	2	8	57801	57808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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