MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 100835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017047	A	6	6	2	7	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017047	CTTTT	2	10	18	27	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017047	T	6	6	24	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017047	CCG	2	6	50	55	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255906
5	NC_017047	GCA	2	6	72	77	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255906
6	NC_017047	ATA	2	6	224	229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384255906
7	NC_017047	GCTT	2	8	236	243	0 %	50 %	25 %	25 %	384255906
8	NC_017047	TGC	2	6	272	277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255906
9	NC_017047	GCA	2	6	290	295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255906
10	NC_017047	CAGC	2	8	315	322	25 %	0 %	25 %	50 %	384255906
11	NC_017047	CG	3	6	493	498	0 %	0 %	50 %	50 %	384255906
12	NC_017047	GCG	3	9	496	504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255906
13	NC_017047	TGG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255906
14	NC_017047	CAT	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255906
15	NC_017047	GC	3	6	613	618	0 %	0 %	50 %	50 %	384255906
16	NC_017047	GTG	2	6	634	639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255906
17	NC_017047	AAC	2	6	688	693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255906
18	NC_017047	TTC	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255906
19	NC_017047	CTG	2	6	811	816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255906
20	NC_017047	CAG	2	6	826	831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255906
21	NC_017047	ATC	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255906
22	NC_017047	AGA	2	6	876	881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255906
23	NC_017047	GCC	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255906
24	NC_017047	TGA	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255906
25	NC_017047	CGA	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255906
26	NC_017047	CTT	2	6	1008	1013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255906
27	NC_017047	TTCG	2	8	1114	1121	0 %	50 %	25 %	25 %	384255906
28	NC_017047	ATA	2	6	1172	1177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384255906
29	NC_017047	GCCC	2	8	1252	1259	0 %	0 %	25 %	75 %	384255906
30	NC_017047	GATGGC	2	12	1266	1277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384255906
31	NC_017047	ACCA	2	8	1294	1301	50 %	0 %	0 %	50 %	384255906
32	NC_017047	GGT	2	6	1330	1335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255906
33	NC_017047	GAA	2	6	1387	1392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255906
34	NC_017047	AGA	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255906
35	NC_017047	TTG	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384255907
36	NC_017047	AGT	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255907
37	NC_017047	GAC	2	6	1518	1523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255907
38	NC_017047	TTA	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384255907
39	NC_017047	GC	3	6	1569	1574	0 %	0 %	50 %	50 %	384255907
40	NC_017047	TGG	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255907
41	NC_017047	CCA	2	6	1650	1655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255907
42	NC_017047	CGA	2	6	1807	1812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255907
43	NC_017047	CGTT	2	8	1900	1907	0 %	50 %	25 %	25 %	384255907
44	NC_017047	ATT	2	6	1908	1913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384255907
45	NC_017047	GAA	2	6	1943	1948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255907
46	NC_017047	CGAC	2	8	1962	1969	25 %	0 %	25 %	50 %	384255907
47	NC_017047	GCA	2	6	2106	2111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255907
48	NC_017047	CGC	2	6	2183	2188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255907
49	NC_017047	GCAG	2	8	2218	2225	25 %	0 %	50 %	25 %	384255907
50	NC_017047	AGA	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255907
51	NC_017047	CAGT	2	8	2509	2516	25 %	25 %	25 %	25 %	384255907
52	NC_017047	CGG	2	6	2517	2522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255907
53	NC_017047	ACTG	2	8	2642	2649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017047	CGA	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017047	TAG	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017047	GGC	2	6	2723	2728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255908
57	NC_017047	GGTC	2	8	2762	2769	0 %	25 %	50 %	25 %	384255908
58	NC_017047	CGG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255908
59	NC_017047	TGC	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255908
60	NC_017047	CGG	2	6	3059	3064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255908
61	NC_017047	CGG	2	6	3075	3080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255908
62	NC_017047	GTT	2	6	3097	3102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384255908
63	NC_017047	TCA	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255908
64	NC_017047	T	7	7	3119	3125	0 %	100 %	0 %	0 %	384255908
65	NC_017047	AGC	2	6	3157	3162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255908
66	NC_017047	CGC	2	6	3167	3172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255908
67	NC_017047	GC	3	6	3301	3306	0 %	0 %	50 %	50 %	384255908
68	NC_017047	TTTC	2	8	3334	3341	0 %	75 %	0 %	25 %	384255908
69	NC_017047	TG	3	6	3514	3519	0 %	50 %	50 %	0 %	384255908
70	NC_017047	GCGG	2	8	3559	3566	0 %	0 %	75 %	25 %	384255908
71	NC_017047	TCT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255908
72	NC_017047	CCGA	2	8	3610	3617	25 %	0 %	25 %	50 %	384255908
73	NC_017047	GCTG	2	8	3626	3633	0 %	25 %	50 %	25 %	384255908
74	NC_017047	ATG	2	6	3699	3704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255908
75	NC_017047	CTC	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384255909
76	NC_017047	CAC	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255909
77	NC_017047	CGA	2	6	3930	3935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255909
78	NC_017047	GAT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255909
79	NC_017047	GAA	2	6	4036	4041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255909
80	NC_017047	CTG	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
81	NC_017047	TTC	2	6	4076	4081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255909
82	NC_017047	TGG	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255909
83	NC_017047	CGA	2	6	4098	4103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255909
84	NC_017047	CGG	2	6	4122	4127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255909
85	NC_017047	CGT	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
86	NC_017047	CCG	2	6	4188	4193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255909
87	NC_017047	CA	3	6	4321	4326	50 %	0 %	0 %	50 %	384255909
88	NC_017047	CTG	2	6	4399	4404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
89	NC_017047	AACAAA	2	12	4474	4485	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384255909
90	NC_017047	ATCC	2	8	4492	4499	25 %	25 %	0 %	50 %	384255909
91	NC_017047	GTTGC	2	10	4546	4555	0 %	40 %	40 %	20 %	384255909
92	NC_017047	ATG	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255909
93	NC_017047	CAA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255909
94	NC_017047	AAG	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255909
95	NC_017047	TCT	2	6	4810	4815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255909
96	NC_017047	TGA	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255909
97	NC_017047	TGG	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255909
98	NC_017047	ATC	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255909
99	NC_017047	GC	4	8	4921	4928	0 %	0 %	50 %	50 %	384255909
100	NC_017047	AGC	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255909
101	NC_017047	CCG	2	6	4962	4967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255909
102	NC_017047	CTGG	2	8	4984	4991	0 %	25 %	50 %	25 %	384255909
103	NC_017047	GCGG	2	8	5068	5075	0 %	0 %	75 %	25 %	384255909
104	NC_017047	CCGTAA	2	12	5091	5102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384255909
105	NC_017047	GC	3	6	5152	5157	0 %	0 %	50 %	50 %	384255909
106	NC_017047	CT	3	6	5170	5175	0 %	50 %	0 %	50 %	384255909
107	NC_017047	CAT	4	12	5262	5273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255909
108	NC_017047	CA	3	6	5297	5302	50 %	0 %	0 %	50 %	384255909
109	NC_017047	TTC	2	6	5323	5328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255909
110	NC_017047	A	6	6	5398	5403	100 %	0 %	0 %	0 %	384255909
111	NC_017047	GAT	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255909
112	NC_017047	TGG	2	6	5534	5539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255909
113	NC_017047	CGT	2	6	5581	5586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
114	NC_017047	GCT	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
115	NC_017047	CG	3	6	5688	5693	0 %	0 %	50 %	50 %	384255909
116	NC_017047	AGC	2	6	5708	5713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255909
117	NC_017047	CGTG	2	8	5736	5743	0 %	25 %	50 %	25 %	384255909
118	NC_017047	AC	3	6	5788	5793	50 %	0 %	0 %	50 %	384255909
119	NC_017047	TTCA	2	8	5827	5834	25 %	50 %	0 %	25 %	384255909
120	NC_017047	GAA	2	6	5890	5895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255909
121	NC_017047	CGT	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
122	NC_017047	ACC	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255909
123	NC_017047	AAC	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255909
124	NC_017047	GCT	2	6	6100	6105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255909
125	NC_017047	GTT	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384255909
126	NC_017047	T	9	9	6250	6258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017047	GGCT	2	8	6281	6288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017047	AATT	2	8	6355	6362	50 %	50 %	0 %	0 %	384255910
129	NC_017047	GCA	2	6	6395	6400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255910
130	NC_017047	A	6	6	6420	6425	100 %	0 %	0 %	0 %	384255910
131	NC_017047	CCGT	2	8	6476	6483	0 %	25 %	25 %	50 %	384255910
132	NC_017047	TCG	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255910
133	NC_017047	CAG	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255910
134	NC_017047	GTT	2	6	6532	6537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384255910
135	NC_017047	CAA	2	6	6548	6553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255910
136	NC_017047	GC	3	6	6556	6561	0 %	0 %	50 %	50 %	384255910
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269	NC_017047	TCAT	2	8	12693	12700	25 %	50 %	0 %	25 %	384255916
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