MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 100835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017047	GCC	3	9	23176	23184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255924
502	NC_017047	CTG	2	6	23204	23209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255924
503	NC_017047	GC	3	6	23231	23236	0 %	0 %	50 %	50 %	384255924
504	NC_017047	GGT	2	6	23244	23249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255924
505	NC_017047	GAG	2	6	23313	23318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384255925
506	NC_017047	TGA	2	6	23372	23377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255925
507	NC_017047	GGT	2	6	23462	23467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255925
508	NC_017047	GT	3	6	23466	23471	0 %	50 %	50 %	0 %	384255925
509	NC_017047	TGC	2	6	23529	23534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255925
510	NC_017047	GC	3	6	23551	23556	0 %	0 %	50 %	50 %	384255925
511	NC_017047	CGG	2	6	23593	23598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255925
512	NC_017047	TGC	2	6	23665	23670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255925
513	NC_017047	TAA	2	6	23790	23795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384255925
514	NC_017047	CCG	2	6	23802	23807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255925
515	NC_017047	GC	3	6	23839	23844	0 %	0 %	50 %	50 %	384255925
516	NC_017047	TAT	2	6	24049	24054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017047	GGA	2	6	24139	24144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017047	GCG	2	6	24155	24160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017047	GAT	2	6	24264	24269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255926
520	NC_017047	TTG	2	6	24370	24375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384255926
521	NC_017047	CAG	3	9	24385	24393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255926
522	NC_017047	TCC	2	6	24404	24409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384255926
523	NC_017047	GCC	3	9	24413	24421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255926
524	NC_017047	CTG	2	6	24484	24489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255926
525	NC_017047	TCA	2	6	24492	24497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255926
526	NC_017047	ATC	2	6	24520	24525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255926
527	NC_017047	TCG	2	6	24527	24532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255926
528	NC_017047	TCT	2	6	24566	24571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255926
529	NC_017047	CGG	2	6	24669	24674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255926
530	NC_017047	TGA	2	6	24730	24735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255927
531	NC_017047	CTGC	2	8	24752	24759	0 %	25 %	25 %	50 %	384255927
532	NC_017047	CTTT	2	8	24800	24807	0 %	75 %	0 %	25 %	384255927
533	NC_017047	GGT	2	6	24840	24845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255927
534	NC_017047	ATT	2	6	24873	24878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384255927
535	NC_017047	GCC	2	6	24891	24896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384255927
536	NC_017047	CGT	2	6	25031	25036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255927
537	NC_017047	TGA	2	6	25072	25077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255927
538	NC_017047	CTG	2	6	25134	25139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255927
539	NC_017047	GGT	2	6	25251	25256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384255927
540	NC_017047	GT	3	6	25302	25307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017047	AC	3	6	25341	25346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_017047	ATT	2	6	25432	25437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017047	GGCA	2	8	25456	25463	25 %	0 %	50 %	25 %	384255928
544	NC_017047	TCG	2	6	25469	25474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255928
545	NC_017047	CT	3	6	25484	25489	0 %	50 %	0 %	50 %	384255928
546	NC_017047	CAG	2	6	25612	25617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255928
547	NC_017047	AAC	2	6	25649	25654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255928
548	NC_017047	CTT	2	6	25674	25679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384255928
549	NC_017047	GGC	2	6	25685	25690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
550	NC_017047	CGG	2	6	25783	25788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
551	NC_017047	GGC	2	6	25826	25831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
552	NC_017047	GCG	2	6	25847	25852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
553	NC_017047	CGG	2	6	25872	25877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
554	NC_017047	CCA	2	6	25887	25892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255928
555	NC_017047	GGC	2	6	25906	25911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
556	NC_017047	TGC	2	6	26022	26027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255928
557	NC_017047	GCA	2	6	26032	26037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255928
558	NC_017047	GCG	2	6	26051	26056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
559	NC_017047	GATGCC	2	12	26087	26098	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384255928
560	NC_017047	GGC	2	6	26125	26130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
561	NC_017047	GCG	2	6	26135	26140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
562	NC_017047	GGC	2	6	26188	26193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
563	NC_017047	GGCG	2	8	26218	26225	0 %	0 %	75 %	25 %	384255928
564	NC_017047	ACA	2	6	26241	26246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384255928
565	NC_017047	CGG	2	6	26275	26280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
566	NC_017047	GC	3	6	26288	26293	0 %	0 %	50 %	50 %	384255928
567	NC_017047	CAG	2	6	26425	26430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255928
568	NC_017047	AT	3	6	26494	26499	50 %	50 %	0 %	0 %	384255928
569	NC_017047	CTGGCG	2	12	26552	26563	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384255928
570	NC_017047	CAG	2	6	26597	26602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255928
571	NC_017047	GAT	2	6	26764	26769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255928
572	NC_017047	GAT	2	6	26792	26797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384255928
573	NC_017047	CG	3	6	26832	26837	0 %	0 %	50 %	50 %	384255928
574	NC_017047	GCTC	2	8	26910	26917	0 %	25 %	25 %	50 %	384255928
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577	NC_017047	CGGA	2	8	26963	26970	25 %	0 %	50 %	25 %	384255928
578	NC_017047	ACGG	2	8	26981	26988	25 %	0 %	50 %	25 %	384255928
579	NC_017047	CGG	2	6	26998	27003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384255928
580	NC_017047	CAG	2	6	27082	27087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255928
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583	NC_017047	CAC	2	6	27301	27306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255928
584	NC_017047	GAC	3	9	27317	27325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255928
585	NC_017047	ACC	2	6	27398	27403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384255928
586	NC_017047	CCT	2	6	27426	27431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384255928
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588	NC_017047	ATG	2	6	27485	27490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017047	A	6	6	27522	27527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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596	NC_017047	AGA	2	6	27977	27982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255930
597	NC_017047	ATC	2	6	27990	27995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384255930
598	NC_017047	CT	3	6	28146	28151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_017047	ATT	2	6	28235	28240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384255931
600	NC_017047	GCA	2	6	28245	28250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255931
601	NC_017047	GC	3	6	28320	28325	0 %	0 %	50 %	50 %	384255931
602	NC_017047	CCGA	2	8	28375	28382	25 %	0 %	25 %	50 %	384255931
603	NC_017047	GCA	2	6	28413	28418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384255931
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610	NC_017047	AAG	2	6	28865	28870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255931
611	NC_017047	CTG	2	6	28879	28884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384255931
612	NC_017047	CTGC	2	8	28906	28913	0 %	25 %	25 %	50 %	384255931
613	NC_017047	CG	3	6	28959	28964	0 %	0 %	50 %	50 %	384255931
614	NC_017047	A	6	6	29114	29119	100 %	0 %	0 %	0 %	384255932
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626	NC_017047	GAA	2	6	29851	29856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384255932
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