MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 100835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017047	CAT	2	6	288319	288324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256149
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6004	NC_017047	AAT	2	6	288347	288352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384256149
6005	NC_017047	CCG	2	6	288354	288359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256149
6006	NC_017047	ACT	2	6	288381	288386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256149
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6010	NC_017047	GAT	2	6	288661	288666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256150
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6018	NC_017047	ATCG	2	8	289012	289019	25 %	25 %	25 %	25 %	384256150
6019	NC_017047	T	6	6	289083	289088	0 %	100 %	0 %	0 %	384256150
6020	NC_017047	TAAA	2	8	289143	289150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017047	TCA	2	6	289157	289162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_017047	TGGTT	2	10	289276	289285	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017047	ATTC	2	8	289287	289294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_017047	TGG	2	6	289306	289311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017047	AAATA	2	10	289330	289339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6248	NC_017047	ATC	2	6	300221	300226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256161
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6265	NC_017047	CGCA	2	8	300962	300969	25 %	0 %	25 %	50 %	384256161
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6288	NC_017047	GGC	2	6	302498	302503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256161
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6290	NC_017047	AATA	2	8	302535	302542	75 %	25 %	0 %	0 %	384256161
6291	NC_017047	CG	3	6	302602	302607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6292	NC_017047	GTA	2	6	302608	302613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6294	NC_017047	AGGT	2	8	302698	302705	25 %	25 %	50 %	0 %	384256162
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6318	NC_017047	TCGTT	2	10	303591	303600	0 %	60 %	20 %	20 %	384256163
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6322	NC_017047	CTGA	2	8	303758	303765	25 %	25 %	25 %	25 %	384256163
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6330	NC_017047	ATTC	2	8	304140	304147	25 %	50 %	0 %	25 %	384256164
6331	NC_017047	TGA	2	6	304163	304168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256164
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6333	NC_017047	GCCT	2	8	304349	304356	0 %	25 %	25 %	50 %	384256164
6334	NC_017047	AGTTGC	2	12	304451	304462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384256164
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6339	NC_017047	GTC	2	6	304624	304629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256164
6340	NC_017047	CGTG	2	8	304641	304648	0 %	25 %	50 %	25 %	384256164
6341	NC_017047	TGGC	2	8	304746	304753	0 %	25 %	50 %	25 %	384256164
6342	NC_017047	CAG	2	6	304833	304838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256164
6343	NC_017047	GGAAA	2	10	304925	304934	60 %	0 %	40 %	0 %	384256164
6344	NC_017047	TAAA	2	8	304948	304955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6345	NC_017047	CACCG	2	10	305096	305105	20 %	0 %	20 %	60 %	384256165
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6349	NC_017047	GAA	2	6	305229	305234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256165
6350	NC_017047	ACA	2	6	305249	305254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384256165
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6355	NC_017047	TGG	2	6	305458	305463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256165
6356	NC_017047	CAG	2	6	305496	305501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256165
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6360	NC_017047	GCGG	2	8	305680	305687	0 %	0 %	75 %	25 %	384256165
6361	NC_017047	ATT	2	6	305736	305741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256165
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6364	NC_017047	TCGA	2	8	305841	305848	25 %	25 %	25 %	25 %	384256165
6365	NC_017047	AAG	2	6	305854	305859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256165
6366	NC_017047	AGGCG	2	10	305966	305975	20 %	0 %	60 %	20 %	384256165
6367	NC_017047	CGAT	2	8	305980	305987	25 %	25 %	25 %	25 %	384256165
6368	NC_017047	A	6	6	306017	306022	100 %	0 %	0 %	0 %	384256165
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6370	NC_017047	A	6	6	306067	306072	100 %	0 %	0 %	0 %	384256165
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6496	NC_017047	AAT	2	6	312877	312882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384256173
6497	NC_017047	CAC	2	6	312940	312945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256173
6498	NC_017047	GTT	2	6	312948	312953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256173
6499	NC_017047	GCTG	2	8	312954	312961	0 %	25 %	50 %	25 %	384256173
6500	NC_017047	CTG	2	6	312993	312998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256173

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