MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 100835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017047	CTAA	2	8	238586	238593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_017047	TCT	2	6	238618	238623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256108
5003	NC_017047	ACG	2	6	238697	238702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256108
5004	NC_017047	CAT	2	6	238711	238716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256108
5005	NC_017047	CCA	2	6	238741	238746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256108
5006	NC_017047	CGTA	2	8	238843	238850	25 %	25 %	25 %	25 %	384256108
5007	NC_017047	GCA	2	6	238948	238953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256108
5008	NC_017047	GCCGG	2	10	238971	238980	0 %	0 %	60 %	40 %	384256108
5009	NC_017047	GGT	2	6	239036	239041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256108
5010	NC_017047	GCC	2	6	239048	239053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256108
5011	NC_017047	AGC	2	6	239064	239069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256108
5012	NC_017047	GGT	2	6	239189	239194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256108
5013	NC_017047	CAG	2	6	239228	239233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256108
5014	NC_017047	GGT	2	6	239294	239299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256108
5015	NC_017047	GAT	2	6	239303	239308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256108
5016	NC_017047	CATC	2	8	239317	239324	25 %	25 %	0 %	50 %	384256108
5017	NC_017047	GAT	2	6	239347	239352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256108
5018	NC_017047	TG	3	6	239386	239391	0 %	50 %	50 %	0 %	384256108
5019	NC_017047	CAC	2	6	239399	239404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256108
5020	NC_017047	CGT	2	6	239458	239463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256108
5021	NC_017047	GAA	2	6	239465	239470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256108
5022	NC_017047	GC	3	6	239511	239516	0 %	0 %	50 %	50 %	384256108
5023	NC_017047	CCA	2	6	239554	239559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256108
5024	NC_017047	CGC	2	6	239614	239619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256108
5025	NC_017047	TTC	2	6	239624	239629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256108
5026	NC_017047	GAC	2	6	239645	239650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256108
5027	NC_017047	TCG	2	6	239664	239669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256108
5028	NC_017047	ATC	2	6	239805	239810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256108
5029	NC_017047	CAGC	2	8	239899	239906	25 %	0 %	25 %	50 %	384256108
5030	NC_017047	AGC	2	6	240012	240017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256108
5031	NC_017047	ACAG	2	8	240021	240028	50 %	0 %	25 %	25 %	384256108
5032	NC_017047	CCA	2	6	240075	240080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256108
5033	NC_017047	TCC	2	6	240114	240119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_017047	ACAA	2	8	240178	240185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5035	NC_017047	TGA	2	6	240219	240224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017047	AGG	2	6	240262	240267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017047	GCT	2	6	240282	240287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017047	GGAG	2	8	240331	240338	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017047	CGT	2	6	240404	240409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256109
5040	NC_017047	GAT	2	6	240417	240422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256109
5041	NC_017047	CGG	2	6	240438	240443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256109
5042	NC_017047	CG	3	6	240561	240566	0 %	0 %	50 %	50 %	384256109
5043	NC_017047	AGC	2	6	240598	240603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256109
5044	NC_017047	GA	3	6	240659	240664	50 %	0 %	50 %	0 %	384256109
5045	NC_017047	ATG	2	6	240688	240693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256109
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5047	NC_017047	GC	3	6	240706	240711	0 %	0 %	50 %	50 %	384256109
5048	NC_017047	CAG	2	6	240756	240761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256109
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5053	NC_017047	CGG	2	6	241030	241035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256109
5054	NC_017047	CCA	2	6	241064	241069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256109
5055	NC_017047	CTG	2	6	241092	241097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256109
5056	NC_017047	CAT	2	6	241118	241123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256109
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5058	NC_017047	T	8	8	241159	241166	0 %	100 %	0 %	0 %	384256110
5059	NC_017047	CAA	2	6	241187	241192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384256110
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5062	NC_017047	GAC	2	6	241319	241324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256110
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5065	NC_017047	CTGG	2	8	241494	241501	0 %	25 %	50 %	25 %	384256110
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5069	NC_017047	TCA	2	6	241622	241627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256110
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5072	NC_017047	GCTT	2	8	241779	241786	0 %	50 %	25 %	25 %	384256110
5073	NC_017047	CCAG	2	8	241865	241872	25 %	0 %	25 %	50 %	384256110
5074	NC_017047	GTT	2	6	241959	241964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256110
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5081	NC_017047	TAA	2	6	242480	242485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384256111
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5103	NC_017047	A	6	6	243438	243443	100 %	0 %	0 %	0 %	384256112
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5110	NC_017047	AGACGA	2	12	243774	243785	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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5112	NC_017047	TAT	2	6	243880	243885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017047	AT	3	6	243890	243895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017047	ATA	2	6	243909	243914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5123	NC_017047	ACTG	2	8	244609	244616	25 %	25 %	25 %	25 %	384256113
5124	NC_017047	CGG	2	6	244620	244625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256113
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5233	NC_017047	GAT	2	6	249557	249562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256118
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5242	NC_017047	GAA	2	6	250042	250047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256119
5243	NC_017047	A	6	6	250084	250089	100 %	0 %	0 %	0 %	384256119
5244	NC_017047	TCA	2	6	250133	250138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256119
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5367	NC_017047	GGA	2	6	255835	255840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384256124
5368	NC_017047	TGG	2	6	255869	255874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256124
5369	NC_017047	CG	3	6	255888	255893	0 %	0 %	50 %	50 %	384256124
5370	NC_017047	GCA	2	6	255912	255917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256124
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5372	NC_017047	CTGGC	2	10	255971	255980	0 %	20 %	40 %	40 %	384256124
5373	NC_017047	TCG	2	6	256035	256040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256124
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5394	NC_017047	CTT	2	6	256952	256957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256124
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5396	NC_017047	CGC	2	6	257025	257030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256124
5397	NC_017047	CTGG	2	8	257101	257108	0 %	25 %	50 %	25 %	384256124
5398	NC_017047	GGC	2	6	257160	257165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256124
5399	NC_017047	GGA	2	6	257185	257190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384256124
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5402	NC_017047	GCAG	2	8	257241	257248	25 %	0 %	50 %	25 %	384256124
5403	NC_017047	A	7	7	257253	257259	100 %	0 %	0 %	0 %	384256124
5404	NC_017047	CTGA	2	8	257289	257296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5405	NC_017047	CAG	2	6	257298	257303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5410	NC_017047	ATCA	2	8	257416	257423	50 %	25 %	0 %	25 %	384256125
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5423	NC_017047	AGC	2	6	257969	257974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5437	NC_017047	TGC	2	6	258766	258771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256127
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5439	NC_017047	TGG	2	6	258973	258978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256127
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5441	NC_017047	CAT	2	6	259033	259038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256127
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5447	NC_017047	GAT	2	6	259552	259557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5490	NC_017047	TGG	2	6	261822	261827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256129
5491	NC_017047	CCG	2	6	261850	261855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256129
5492	NC_017047	GGC	2	6	261880	261885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256129
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