MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 chromosome

Total Repeats: 100835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017047	GCA	2	6	214014	214019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256089
4502	NC_017047	CAG	2	6	214219	214224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256089
4503	NC_017047	AG	3	6	214229	214234	50 %	0 %	50 %	0 %	384256089
4504	NC_017047	AAT	2	6	214299	214304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384256089
4505	NC_017047	CCG	2	6	214306	214311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256089
4506	NC_017047	ACC	2	6	214319	214324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256089
4507	NC_017047	CGG	2	6	214347	214352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256089
4508	NC_017047	TCT	2	6	214407	214412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_017047	T	6	6	214513	214518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017047	GACTA	2	10	214563	214572	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4511	NC_017047	GAG	2	6	214584	214589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017047	GGCT	2	8	214643	214650	0 %	25 %	50 %	25 %	384256090
4513	NC_017047	ATT	2	6	214680	214685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256090
4514	NC_017047	AC	3	6	214895	214900	50 %	0 %	0 %	50 %	384256090
4515	NC_017047	A	6	6	215099	215104	100 %	0 %	0 %	0 %	384256090
4516	NC_017047	CCG	2	6	215137	215142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256090
4517	NC_017047	GGT	2	6	215155	215160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256090
4518	NC_017047	CTG	2	6	215267	215272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256090
4519	NC_017047	GCC	2	6	215281	215286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256090
4520	NC_017047	CAAAAG	2	12	215306	215317	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4521	NC_017047	T	7	7	215337	215343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017047	CAT	2	6	215345	215350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_017047	TGC	2	6	215528	215533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256091
4524	NC_017047	CGG	2	6	215543	215548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256091
4525	NC_017047	TGA	2	6	215620	215625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256091
4526	NC_017047	CCG	2	6	215638	215643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256091
4527	NC_017047	TGT	2	6	215657	215662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256091
4528	NC_017047	CGG	2	6	215663	215668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256091
4529	NC_017047	CGA	2	6	215867	215872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256091
4530	NC_017047	CGC	2	6	215885	215890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256091
4531	NC_017047	GCC	2	6	215913	215918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256091
4532	NC_017047	GCT	2	6	215991	215996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256091
4533	NC_017047	ATC	2	6	216019	216024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256091
4534	NC_017047	ATT	2	6	216039	216044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256091
4535	NC_017047	CG	3	6	216047	216052	0 %	0 %	50 %	50 %	384256091
4536	NC_017047	CAT	2	6	216125	216130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256091
4537	NC_017047	CCG	2	6	216145	216150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256091
4538	NC_017047	AAGG	2	8	216243	216250	50 %	0 %	50 %	0 %	384256091
4539	NC_017047	TCCG	2	8	216274	216281	0 %	25 %	25 %	50 %	384256091
4540	NC_017047	GGGTC	2	10	216344	216353	0 %	20 %	60 %	20 %	384256091
4541	NC_017047	CGG	3	9	216372	216380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256091
4542	NC_017047	GCC	2	6	216429	216434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256091
4543	NC_017047	ATA	2	6	216444	216449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384256091
4544	NC_017047	CGA	2	6	216489	216494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256091
4545	NC_017047	GTC	2	6	216538	216543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256091
4546	NC_017047	GT	3	6	216695	216700	0 %	50 %	50 %	0 %	384256091
4547	NC_017047	CTG	2	6	216711	216716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256091
4548	NC_017047	TCA	2	6	216731	216736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256091
4549	NC_017047	ATT	2	6	216798	216803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256091
4550	NC_017047	CGT	2	6	216876	216881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256091
4551	NC_017047	ATA	2	6	216889	216894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384256091
4552	NC_017047	GCGG	2	8	216981	216988	0 %	0 %	75 %	25 %	384256091
4553	NC_017047	GAT	2	6	216996	217001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256091
4554	NC_017047	GTT	2	6	217176	217181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256091
4555	NC_017047	CCG	2	6	217234	217239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256091
4556	NC_017047	TGA	2	6	217370	217375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256091
4557	NC_017047	TTG	2	6	217486	217491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256091
4558	NC_017047	CTG	2	6	217507	217512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256091
4559	NC_017047	GAT	2	6	217526	217531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256091
4560	NC_017047	CAGC	2	8	217535	217542	25 %	0 %	25 %	50 %	384256091
4561	NC_017047	ATT	2	6	217566	217571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256091
4562	NC_017047	ATT	2	6	217593	217598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256091
4563	NC_017047	TTA	3	9	217636	217644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256091
4564	NC_017047	CAC	2	6	217647	217652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256091
4565	NC_017047	CGT	2	6	217679	217684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256091
4566	NC_017047	CTGC	2	8	217699	217706	0 %	25 %	25 %	50 %	384256091
4567	NC_017047	TGT	2	6	217748	217753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256091
4568	NC_017047	GAG	2	6	217810	217815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384256091
4569	NC_017047	GCTG	2	8	217820	217827	0 %	25 %	50 %	25 %	384256091
4570	NC_017047	TGG	2	6	217934	217939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256091
4571	NC_017047	CAG	3	9	217965	217973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256091
4572	NC_017047	GGCA	2	8	218020	218027	25 %	0 %	50 %	25 %	384256091
4573	NC_017047	CAG	2	6	218034	218039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256091
4574	NC_017047	ATA	2	6	218095	218100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017047	CTG	2	6	218229	218234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_017047	ATC	2	6	218458	218463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_017047	TGT	2	6	218497	218502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256092
4578	NC_017047	CGG	2	6	218504	218509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256092
4579	NC_017047	TTG	2	6	218524	218529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384256092
4580	NC_017047	GGC	2	6	218550	218555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256092
4581	NC_017047	TGA	2	6	218604	218609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256092
4582	NC_017047	GGT	2	6	218628	218633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256092
4583	NC_017047	ATG	2	6	218719	218724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256092
4584	NC_017047	GCG	2	6	218741	218746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256092
4585	NC_017047	AGGA	2	8	218783	218790	50 %	0 %	50 %	0 %	384256092
4586	NC_017047	CAG	2	6	218871	218876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256093
4587	NC_017047	CGCTG	2	10	218909	218918	0 %	20 %	40 %	40 %	384256093
4588	NC_017047	ACC	2	6	218979	218984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256093
4589	NC_017047	GC	3	6	218994	218999	0 %	0 %	50 %	50 %	384256093
4590	NC_017047	AGC	2	6	219031	219036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256093
4591	NC_017047	TGA	2	6	219067	219072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384256093
4592	NC_017047	T	6	6	219075	219080	0 %	100 %	0 %	0 %	384256093
4593	NC_017047	CTG	2	6	219165	219170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256093
4594	NC_017047	ACAA	2	8	219190	219197	75 %	0 %	0 %	25 %	384256093
4595	NC_017047	GCC	2	6	219258	219263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384256093
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4598	NC_017047	AAG	2	6	219313	219318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384256093
4599	NC_017047	GC	3	6	219333	219338	0 %	0 %	50 %	50 %	384256093
4600	NC_017047	GGT	2	6	219359	219364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256093
4601	NC_017047	CCA	2	6	219409	219414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384256093
4602	NC_017047	CAT	2	6	219437	219442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256093
4603	NC_017047	GC	3	6	219541	219546	0 %	0 %	50 %	50 %	384256093
4604	NC_017047	CAT	2	6	219560	219565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384256093
4605	NC_017047	CA	3	6	219631	219636	50 %	0 %	0 %	50 %	384256093
4606	NC_017047	GGC	2	6	219675	219680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256093
4607	NC_017047	GCA	2	6	219718	219723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256093
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4609	NC_017047	CTT	2	6	219770	219775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256093
4610	NC_017047	TTC	2	6	219828	219833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384256093
4611	NC_017047	GGT	2	6	219908	219913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256093
4612	NC_017047	ACGT	2	8	220052	220059	25 %	25 %	25 %	25 %	384256093
4613	NC_017047	CGG	2	6	220096	220101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256093
4614	NC_017047	TGCCG	2	10	220106	220115	0 %	20 %	40 %	40 %	384256093
4615	NC_017047	AAT	2	6	220135	220140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_017047	TGG	2	6	220208	220213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
4617	NC_017047	GCT	2	6	220378	220383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256094
4618	NC_017047	GTG	2	6	220449	220454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
4619	NC_017047	CGA	2	6	220495	220500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256094
4620	NC_017047	CGG	2	6	220573	220578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384256094
4621	NC_017047	CGT	2	6	220594	220599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256094
4622	NC_017047	GGT	2	6	220681	220686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
4623	NC_017047	GTG	2	6	220730	220735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
4624	NC_017047	ATT	2	6	220835	220840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384256094
4625	NC_017047	TGG	2	6	220968	220973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
4626	NC_017047	CAG	2	6	221009	221014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256094
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4628	NC_017047	GTG	2	6	221042	221047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384256094
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4642	NC_017047	GCA	2	6	222013	222018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384256095
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4654	NC_017047	GCT	2	6	222425	222430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384256095
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4690	NC_017047	GTG	2	6	223633	223638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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