MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 1055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017045	CACAGC	2	12	31	42	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017045	GAAACA	2	12	1483	1494	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383484661
3	NC_017045	AATAAA	2	12	2531	2542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383484662
4	NC_017045	CTTTTT	2	12	3327	3338	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383484664
5	NC_017045	TGAATT	2	12	6799	6810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383484668
6	NC_017045	CGACAA	2	12	7152	7163	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383484669
7	NC_017045	TAATTA	2	12	7798	7809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017045	TAAAGA	2	12	9123	9134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017045	TAAAGA	2	12	11213	11224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017045	CAAAAA	2	12	12627	12638	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383484673
11	NC_017045	CCCAAG	2	12	14529	14540	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383484675
12	NC_017045	AGAAAA	2	12	15069	15080	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383484675
13	NC_017045	GAAATG	2	12	16701	16712	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017045	TGGAGT	2	12	17076	17087	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017045	TGAAAA	2	12	17708	17719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017045	AATTGC	2	12	18231	18242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383484679
17	NC_017045	TAAAGA	2	12	25841	25852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017045	AATATG	2	12	29593	29604	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484693
19	NC_017045	TTTTGT	2	12	44001	44012	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383484711
20	NC_017045	ATAAAT	2	12	45414	45425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484713
21	NC_017045	TCAAAT	2	12	46539	46550	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017045	AATAGC	2	12	48972	48983	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383484716
23	NC_017045	GTTGAT	2	12	49718	49729	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017045	TTTTAT	3	18	54251	54268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017045	GGCGTT	2	12	56529	56540	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017045	GTTTTG	2	12	58950	58961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484725
27	NC_017045	TAGAAA	2	12	64554	64565	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017045	GTAATG	2	12	65400	65411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484732
29	NC_017045	CGATGG	2	12	66677	66688	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383484733
30	NC_017045	AGGAGA	2	12	69543	69554	50 %	0 %	50 %	0 %	383484734
31	NC_017045	TAAAGT	2	12	73656	73667	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017045	CTTTAG	2	12	77980	77991	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484742
33	NC_017045	TAAAAC	2	12	78456	78467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383484743
34	NC_017045	AAAAAG	2	12	79834	79845	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383484744
35	NC_017045	AACCTA	2	12	80360	80371	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383484745
36	NC_017045	TTTAGT	2	12	88082	88093	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017045	TGTTTC	2	12	88588	88599	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383484751
38	NC_017045	GCCACC	2	12	92134	92145	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383484753
39	NC_017045	GTTTCA	2	12	93938	93949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484754
40	NC_017045	TTTATT	2	12	99055	99066	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383484759
41	NC_017045	AAAAAG	2	12	99256	99267	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017045	AAATAT	2	12	99393	99404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017045	CTGTTG	2	12	100722	100733	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383484762
44	NC_017045	TGCTTC	2	12	104684	104695	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383484767
45	NC_017045	CTTTTG	2	12	109656	109667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383484771
46	NC_017045	TAGCTT	2	12	111026	111037	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484771
47	NC_017045	GTCTTT	2	12	111147	111158	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383484771
48	NC_017045	GCTTCT	2	12	118680	118691	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383484781
49	NC_017045	AGGGTT	2	12	120902	120913	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383484785
50	NC_017045	TTTACT	2	12	121628	121639	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383484787
51	NC_017045	ATTCCT	2	12	121757	121768	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383484787
52	NC_017045	TTTAAC	2	12	121925	121936	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017045	TTTTTG	2	12	124649	124660	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383484791
54	NC_017045	CATATA	2	12	128056	128067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383484795
55	NC_017045	GATTTT	2	12	129342	129353	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017045	TGCTTG	2	12	131900	131911	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383484802
57	NC_017045	ATTTTC	2	12	132309	132320	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383484803
58	NC_017045	TCGTAT	2	12	135147	135158	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484810
59	NC_017045	TACCTT	2	12	139078	139089	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383484818
60	NC_017045	TTTTTC	2	12	139184	139195	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383484818
61	NC_017045	ACATTG	2	12	139533	139544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383484820
62	NC_017045	AATGTT	2	12	144100	144111	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383484830
63	NC_017045	AGACAA	2	12	146133	146144	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383484832
64	NC_017045	GAAAGA	2	12	147997	148008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484834
65	NC_017045	TTTTAT	2	12	148019	148030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383484834
66	NC_017045	ATATTG	2	12	148365	148376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383484834
67	NC_017045	TTCCGC	2	12	149546	149557	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383484836
68	NC_017045	AACCAG	2	12	153872	153883	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383484842
69	NC_017045	GCATAG	2	12	155189	155200	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383484842
70	NC_017045	ATCAAA	2	12	158295	158306	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383484843
71	NC_017045	AGACCC	2	12	159622	159633	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383484844
72	NC_017045	TAGTCC	2	12	163259	163270	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383484849
73	NC_017045	GATTAA	2	12	166766	166777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484852
74	NC_017045	TCTAAA	2	12	167221	167232	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383484852
75	NC_017045	TGCATT	2	12	169911	169922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484853
76	NC_017045	CAAACT	2	12	170805	170816	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383484854
77	NC_017045	CTAAAA	2	12	171572	171583	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383484855
78	NC_017045	ACTCCA	2	12	172324	172335	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383484857
79	NC_017045	ATAAGA	2	12	173029	173040	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383484857
80	NC_017045	GGATAC	2	12	174685	174696	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017045	GTAAAT	2	12	176443	176454	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484859
82	NC_017045	CTTTTT	2	12	180818	180829	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383484865
83	NC_017045	CCAAAA	2	12	183035	183046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484867
84	NC_017045	TCTAAC	2	12	184114	184125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484867
85	NC_017045	AATGCT	2	12	185338	185349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383484867
86	NC_017045	TACAGA	2	12	186908	186919	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383484868
87	NC_017045	AGAATA	2	12	187756	187767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383484869
88	NC_017045	GTAAAT	2	12	190587	190598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484870
89	NC_017045	ATCTAA	2	12	198106	198117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383484876
90	NC_017045	GTAATG	2	12	200365	200376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484877
91	NC_017045	AGCATT	2	12	202887	202898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383484881
92	NC_017045	AGCTCC	2	12	204656	204667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383484882
93	NC_017045	GGACAG	2	12	208345	208356	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017045	TGTCTG	2	12	210185	210196	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017045	ATAGCC	2	12	211182	211193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017045	CCTGTG	2	12	216673	216684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017045	TGGTGC	2	12	218144	218155	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383484891
98	NC_017045	TATAGA	2	12	220818	220829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484895
99	NC_017045	GTTAAA	2	12	224364	224375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484897
100	NC_017045	TATGGG	2	12	228406	228417	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383484900
101	NC_017045	CAAAAA	2	12	229157	229168	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383484901
102	NC_017045	TTAGAG	2	12	231475	231486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017045	GTTTGG	2	12	231850	231861	0 %	50 %	50 %	0 %	383484903
104	NC_017045	AATGTA	2	12	232889	232900	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383484904
105	NC_017045	CGTCAG	2	12	233290	233301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383484905
106	NC_017045	TTTGTT	2	12	233561	233572	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383484905
107	NC_017045	TTGGCT	2	12	235419	235430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017045	CATTTC	2	12	240349	240360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383484910
109	NC_017045	TTCTTT	2	12	242292	242303	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383484912
110	NC_017045	ATAAAA	2	12	244506	244517	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017045	AAACTG	2	12	245427	245438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383484915
112	NC_017045	ATGAAA	2	12	247143	247154	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383484916
113	NC_017045	GCTAGA	2	12	249483	249494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383484917
114	NC_017045	TGAAAG	2	12	257775	257786	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383484924
115	NC_017045	TTAGGA	2	12	259805	259816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484925
116	NC_017045	TTAGCA	2	12	259832	259843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383484925
117	NC_017045	ATGCTT	2	12	261211	261222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383484926
118	NC_017045	TCCTTA	2	12	265250	265261	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383484929
119	NC_017045	TTTATT	2	12	267449	267460	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383484930
120	NC_017045	AAGAAA	2	12	269275	269286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017045	TCTTTT	2	12	270160	270171	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017045	TGAAAA	2	12	270567	270578	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383484932
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239	NC_017045	GTCCTA	2	12	483856	483867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383485116
240	NC_017045	AATAAA	2	12	484518	484529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_017045	CTCACG	2	12	485631	485642	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383485118
242	NC_017045	AATGTT	2	12	488278	488289	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383485121
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247	NC_017045	GATTAG	2	12	499591	499602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383485132
248	NC_017045	GCGCTA	2	12	500176	500187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383485132
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265	NC_017045	TAGTTG	2	12	558939	558950	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383485197
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343	NC_017045	AGATTA	2	12	726614	726625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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351	NC_017045	AGGCGA	2	12	739939	739950	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383485352
352	NC_017045	AGCTAT	2	12	740065	740076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383485353
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471	NC_017045	CATAAT	2	12	975444	975455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383485560
472	NC_017045	AGTTGT	2	12	976535	976546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383485560
473	NC_017045	CTAGCT	2	12	976565	976576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383485560
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476	NC_017045	ATTGTT	2	12	977543	977554	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383485560
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