MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 28520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017045	ATT	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017045	GAC	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484661
3	NC_017045	TGA	2	6	123	128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
4	NC_017045	TAT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484661
5	NC_017045	TAT	2	6	334	339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484661
6	NC_017045	GGT	2	6	424	429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484661
7	NC_017045	ATG	2	6	485	490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
8	NC_017045	ATG	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
9	NC_017045	TGT	2	6	507	512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484661
10	NC_017045	ATG	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
11	NC_017045	GAT	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
12	NC_017045	ATG	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
13	NC_017045	CAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484661
14	NC_017045	ACA	2	6	1067	1072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484661
15	NC_017045	GAT	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
16	NC_017045	ATG	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
17	NC_017045	TTG	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484661
18	NC_017045	CAA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484661
19	NC_017045	ATG	2	6	1400	1405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
20	NC_017045	ATT	2	6	1874	1879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484661
21	NC_017045	AAC	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017045	TTG	2	6	2331	2336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484662
23	NC_017045	TGG	2	6	2417	2422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484662
24	NC_017045	GTT	2	6	2466	2471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484662
25	NC_017045	GGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383484663
26	NC_017045	AAG	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484663
27	NC_017045	AAT	2	6	2767	2772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484663
28	NC_017045	TGA	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484663
29	NC_017045	ATT	2	6	2806	2811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484663
30	NC_017045	CAA	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017045	GAC	2	6	3014	3019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017045	GAA	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484664
33	NC_017045	CAA	2	6	3269	3274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484664
34	NC_017045	ACA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484664
35	NC_017045	TGG	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484664
36	NC_017045	TTG	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484664
37	NC_017045	ATT	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484664
38	NC_017045	AAG	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484664
39	NC_017045	GAC	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484664
40	NC_017045	AGA	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017045	ACT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017045	TAG	2	6	4026	4031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017045	AAC	2	6	4122	4127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017045	TTG	2	6	4142	4147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017045	AAG	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484665
46	NC_017045	CAA	2	6	4454	4459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484665
47	NC_017045	AAG	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484665
48	NC_017045	ATA	2	6	4546	4551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484665
49	NC_017045	TGA	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484665
50	NC_017045	CAA	2	6	4868	4873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484665
51	NC_017045	TGT	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484665
52	NC_017045	TTG	2	6	5331	5336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017045	AAC	2	6	5350	5355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017045	AGA	2	6	5385	5390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484666
55	NC_017045	TGA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484666
56	NC_017045	CAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484666
57	NC_017045	CTT	2	6	5548	5553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484666
58	NC_017045	CAA	2	6	5633	5638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484666
59	NC_017045	TAA	2	6	5682	5687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484666
60	NC_017045	TTG	2	6	5883	5888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484667
61	NC_017045	AGT	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484667
62	NC_017045	GAA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484667
63	NC_017045	CAA	2	6	6048	6053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017045	TAA	2	6	6138	6143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017045	CAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017045	TAA	2	6	6232	6237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017045	AAT	2	6	6248	6253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017045	ATT	2	6	6377	6382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484668
69	NC_017045	TTA	2	6	6616	6621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484668
70	NC_017045	GAA	2	6	6671	6676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
71	NC_017045	TAC	2	6	6775	6780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484668
72	NC_017045	AAG	2	6	6783	6788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
73	NC_017045	AGA	2	6	6820	6825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
74	NC_017045	GAA	2	6	6866	6871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
75	NC_017045	ATT	2	6	7078	7083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484669
76	NC_017045	GAC	2	6	7085	7090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484669
77	NC_017045	TGG	2	6	7117	7122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484669
78	NC_017045	GAC	2	6	7415	7420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484669
79	NC_017045	TTC	2	6	7704	7709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017045	ATT	2	6	7834	7839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484670
81	NC_017045	TTA	2	6	7953	7958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484670
82	NC_017045	GAA	2	6	7985	7990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484670
83	NC_017045	GTT	2	6	8026	8031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484670
84	NC_017045	GAA	2	6	8048	8053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484670
85	NC_017045	ATG	2	6	8274	8279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484670
86	NC_017045	CGT	2	6	8375	8380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017045	ACA	2	6	8381	8386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017045	GTT	2	6	8670	8675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017045	ATT	3	9	8787	8795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017045	CCT	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017045	ATA	2	6	8851	8856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017045	GAA	2	6	8874	8879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017045	AGG	2	6	8943	8948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017045	ATA	2	6	8951	8956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017045	ACA	2	6	9024	9029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017045	ATT	2	6	9047	9052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017045	ACA	2	6	9149	9154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017045	AAG	2	6	9241	9246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017045	AAC	2	6	9388	9393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017045	ACA	2	6	9451	9456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484671
101	NC_017045	ACA	2	6	9464	9469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484671
102	NC_017045	TAC	2	6	9603	9608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484671
103	NC_017045	GAA	2	6	9760	9765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484671
104	NC_017045	CAA	2	6	9851	9856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484671
105	NC_017045	AAT	2	6	10130	10135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017045	GAC	2	6	10202	10207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017045	GTT	2	6	10760	10765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017045	ATT	3	9	10877	10885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017045	CCT	2	6	10917	10922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017045	ATA	2	6	10941	10946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017045	GAA	2	6	10964	10969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017045	ATA	2	6	11041	11046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017045	ACA	2	6	11114	11119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017045	ATT	2	6	11137	11142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017045	ACA	2	6	11246	11251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017045	TAA	2	6	11337	11342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017045	CAA	2	6	11575	11580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484672
118	NC_017045	AGA	2	6	11590	11595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484672
119	NC_017045	CAA	2	6	11651	11656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484672
120	NC_017045	AAT	2	6	11762	11767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484672
121	NC_017045	GAA	2	6	11799	11804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484672
122	NC_017045	AAG	2	6	11805	11810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484672
123	NC_017045	TAC	2	6	11820	11825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484672
124	NC_017045	GCC	2	6	11874	11879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383484672
125	NC_017045	CCA	2	6	12099	12104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383484672
126	NC_017045	CAA	2	6	12194	12199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484672
127	NC_017045	AAG	3	9	12317	12325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484672
128	NC_017045	TTA	2	6	12366	12371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484672
129	NC_017045	GAA	2	6	12393	12398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484672
130	NC_017045	ATT	2	6	12458	12463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484673
131	NC_017045	ATT	2	6	12527	12532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484673
132	NC_017045	AAG	2	6	12554	12559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484673
133	NC_017045	GAA	2	6	12577	12582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484673
134	NC_017045	CAA	3	9	12651	12659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484673
135	NC_017045	GAA	2	6	12721	12726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484673
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265	NC_017045	ACA	2	6	25867	25872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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