MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 1167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017044	TGATA	2	10	557	566	40 %	40 %	20 %	0 %	383483342
2	NC_017044	CTACT	2	10	1006	1015	20 %	40 %	0 %	40 %	383483343
3	NC_017044	ATAGA	2	10	1610	1619	60 %	20 %	20 %	0 %	383483343
4	NC_017044	TTCTT	2	10	1687	1696	0 %	80 %	0 %	20 %	383483343
5	NC_017044	CTTTC	2	10	1785	1794	0 %	60 %	0 %	40 %	383483344
6	NC_017044	CACTC	2	10	1889	1898	20 %	20 %	0 %	60 %	383483344
7	NC_017044	TATTT	2	10	2205	2214	20 %	80 %	0 %	0 %	383483344
8	NC_017044	TTGCT	2	10	2558	2567	0 %	60 %	20 %	20 %	383483344
9	NC_017044	TTTTA	2	10	5598	5607	20 %	80 %	0 %	0 %	383483348
10	NC_017044	ATTTA	2	10	5951	5960	40 %	60 %	0 %	0 %	383483348
11	NC_017044	GGTCA	2	10	7198	7207	20 %	20 %	40 %	20 %	383483349
12	NC_017044	TAAAT	2	10	7907	7916	60 %	40 %	0 %	0 %	383483349
13	NC_017044	TCAAT	2	10	8177	8186	40 %	40 %	0 %	20 %	383483349
14	NC_017044	GTAGT	2	10	8233	8242	20 %	40 %	40 %	0 %	383483349
15	NC_017044	ACTTT	2	10	9890	9899	20 %	60 %	0 %	20 %	383483352
16	NC_017044	AATAC	2	10	10431	10440	60 %	20 %	0 %	20 %	383483352
17	NC_017044	ATCCA	2	10	10928	10937	40 %	20 %	0 %	40 %	383483353
18	NC_017044	AATTA	2	10	12504	12513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017044	CGCTC	2	10	12856	12865	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017044	AGCAG	2	10	13832	13841	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017044	TTAAT	2	10	13975	13984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017044	TAACT	2	10	15185	15194	40 %	40 %	0 %	20 %	383483356
23	NC_017044	ATTTA	2	10	16842	16851	40 %	60 %	0 %	0 %	383483358
24	NC_017044	TTTTA	2	10	17610	17619	20 %	80 %	0 %	0 %	383483358
25	NC_017044	TTTAA	2	10	20375	20384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017044	TCAAG	2	10	21409	21418	40 %	20 %	20 %	20 %	383483363
27	NC_017044	ATAAA	2	10	21463	21472	80 %	20 %	0 %	0 %	383483363
28	NC_017044	AGAAA	2	10	21725	21734	80 %	0 %	20 %	0 %	383483363
29	NC_017044	AAAGC	2	10	21957	21966	60 %	0 %	20 %	20 %	383483363
30	NC_017044	TAATA	2	10	22877	22886	60 %	40 %	0 %	0 %	383483363
31	NC_017044	CAAAG	2	10	22969	22978	60 %	0 %	20 %	20 %	383483363
32	NC_017044	AGCAG	2	10	23295	23304	40 %	0 %	40 %	20 %	383483363
33	NC_017044	TACCT	2	10	24845	24854	20 %	40 %	0 %	40 %	383483363
34	NC_017044	TATAA	2	10	26333	26342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017044	ATATT	2	10	27911	27920	40 %	60 %	0 %	0 %	383483366
36	NC_017044	ATATT	2	10	27949	27958	40 %	60 %	0 %	0 %	383483366
37	NC_017044	AAATA	2	10	28398	28407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017044	ATGTT	2	10	29100	29109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017044	TTTGT	2	10	30053	30062	0 %	80 %	20 %	0 %	383483369
40	NC_017044	TCATT	2	10	31830	31839	20 %	60 %	0 %	20 %	383483374
41	NC_017044	TGCTA	2	10	32748	32757	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017044	AAGTG	2	10	35288	35297	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017044	ATTTT	2	10	35300	35309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017044	TTAAT	2	10	37004	37013	40 %	60 %	0 %	0 %	383483380
45	NC_017044	TGAGT	2	10	37031	37040	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017044	TTAGT	2	10	39571	39580	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017044	ATTTA	2	10	41577	41586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017044	CTTTT	2	10	41640	41649	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017044	TTATT	2	10	42046	42055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017044	TTTTA	2	10	42150	42159	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017044	TAAGT	2	10	45365	45374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017044	GAGAG	2	10	46053	46062	40 %	0 %	60 %	0 %	383483395
53	NC_017044	CAAAC	2	10	46105	46114	60 %	0 %	0 %	40 %	383483395
54	NC_017044	ACGTA	2	10	46269	46278	40 %	20 %	20 %	20 %	383483395
55	NC_017044	TAACT	2	10	46540	46549	40 %	40 %	0 %	20 %	383483396
56	NC_017044	AGAAA	2	10	47152	47161	80 %	0 %	20 %	0 %	383483397
57	NC_017044	GTTTC	2	10	47592	47601	0 %	60 %	20 %	20 %	383483397
58	NC_017044	ATTTT	2	10	48141	48150	20 %	80 %	0 %	0 %	383483397
59	NC_017044	TTTAA	2	10	50269	50278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017044	TTTCT	2	10	51349	51358	0 %	80 %	0 %	20 %	383483402
61	NC_017044	CATTA	2	10	52413	52422	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017044	TAGTT	2	10	53099	53108	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017044	TTGAT	2	10	54322	54331	20 %	60 %	20 %	0 %	383483404
64	NC_017044	TAAAG	2	10	55349	55358	60 %	20 %	20 %	0 %	383483404
65	NC_017044	ATTAT	2	10	55422	55431	40 %	60 %	0 %	0 %	383483404
66	NC_017044	ATTAT	2	10	58975	58984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017044	TCGGT	2	10	60827	60836	0 %	40 %	40 %	20 %	383483411
68	NC_017044	GCTTT	2	10	62209	62218	0 %	60 %	20 %	20 %	383483412
69	NC_017044	TAAAA	2	10	66435	66444	80 %	20 %	0 %	0 %	383483416
70	NC_017044	ACTTT	2	10	69489	69498	20 %	60 %	0 %	20 %	383483420
71	NC_017044	GCTTA	2	10	69678	69687	20 %	40 %	20 %	20 %	383483420
72	NC_017044	CATTT	2	10	70381	70390	20 %	60 %	0 %	20 %	383483420
73	NC_017044	TTAAA	2	10	70406	70415	60 %	40 %	0 %	0 %	383483420
74	NC_017044	TAAAT	2	10	70476	70485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017044	ACATA	2	10	73200	73209	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017044	GATTA	2	10	74830	74839	40 %	40 %	20 %	0 %	383483425
77	NC_017044	TTTCT	2	10	76539	76548	0 %	80 %	0 %	20 %	383483428
78	NC_017044	ATTTA	2	10	76953	76962	40 %	60 %	0 %	0 %	383483429
79	NC_017044	AAAAG	2	10	77729	77738	80 %	0 %	20 %	0 %	383483429
80	NC_017044	GGGTT	2	10	77939	77948	0 %	40 %	60 %	0 %	383483429
81	NC_017044	TTTAT	2	10	78315	78324	20 %	80 %	0 %	0 %	383483429
82	NC_017044	GCTTA	2	10	79597	79606	20 %	40 %	20 %	20 %	383483430
83	NC_017044	ACAAT	2	10	79961	79970	60 %	20 %	0 %	20 %	383483431
84	NC_017044	GTTAT	2	10	80586	80595	20 %	60 %	20 %	0 %	383483432
85	NC_017044	GTAGA	2	10	80892	80901	40 %	20 %	40 %	0 %	383483432
86	NC_017044	CAATG	2	10	83244	83253	40 %	20 %	20 %	20 %	383483434
87	NC_017044	ATAAA	2	10	83707	83716	80 %	20 %	0 %	0 %	383483435
88	NC_017044	ATTAT	2	10	84142	84151	40 %	60 %	0 %	0 %	383483435
89	NC_017044	ATTAA	2	10	84413	84422	60 %	40 %	0 %	0 %	383483435
90	NC_017044	ATACA	2	10	84617	84626	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017044	GAAAA	2	10	84966	84975	80 %	0 %	20 %	0 %	383483436
92	NC_017044	TAAAT	2	10	88104	88113	60 %	40 %	0 %	0 %	383483439
93	NC_017044	CGCAT	2	10	92356	92365	20 %	20 %	20 %	40 %	383483443
94	NC_017044	TGAAA	2	10	95586	95595	60 %	20 %	20 %	0 %	383483445
95	NC_017044	AGAAA	2	10	96361	96370	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017044	TTGAT	2	10	97264	97273	20 %	60 %	20 %	0 %	383483447
97	NC_017044	TATAA	2	10	97898	97907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017044	TTGTA	2	10	98038	98047	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017044	ATTTA	2	10	98977	98986	40 %	60 %	0 %	0 %	383483449
100	NC_017044	AATTA	2	10	99346	99355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017044	TCAAA	2	10	100634	100643	60 %	20 %	0 %	20 %	383483451
102	NC_017044	TTAAT	2	10	101340	101349	40 %	60 %	0 %	0 %	383483452
103	NC_017044	AAACT	2	10	103916	103925	60 %	20 %	0 %	20 %	383483454
104	NC_017044	TTAGT	2	10	104267	104276	20 %	60 %	20 %	0 %	383483455
105	NC_017044	CCAAA	2	10	106705	106714	60 %	0 %	0 %	40 %	383483457
106	NC_017044	ATTTT	2	10	108257	108266	20 %	80 %	0 %	0 %	383483459
107	NC_017044	TTGAT	2	10	108707	108716	20 %	60 %	20 %	0 %	383483460
108	NC_017044	ATTAT	2	10	108888	108897	40 %	60 %	0 %	0 %	383483460
109	NC_017044	TCTAG	2	10	110103	110112	20 %	40 %	20 %	20 %	383483460
110	NC_017044	ATTTA	2	10	110702	110711	40 %	60 %	0 %	0 %	383483460
111	NC_017044	TTTGA	2	10	112684	112693	20 %	60 %	20 %	0 %	383483460
112	NC_017044	GCAAA	2	10	114655	114664	60 %	0 %	20 %	20 %	383483461
113	NC_017044	TTAGT	2	10	119222	119231	20 %	60 %	20 %	0 %	383483464
114	NC_017044	ATAAA	2	10	120439	120448	80 %	20 %	0 %	0 %	383483464
115	NC_017044	AAGTA	2	10	121045	121054	60 %	20 %	20 %	0 %	383483465
116	NC_017044	ATTCG	2	10	122795	122804	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017044	TAAAA	2	10	123143	123152	80 %	20 %	0 %	0 %	383483467
118	NC_017044	AAAAC	2	10	123842	123851	80 %	0 %	0 %	20 %	383483467
119	NC_017044	TTTAA	2	10	123918	123927	40 %	60 %	0 %	0 %	383483467
120	NC_017044	GTTAC	2	10	125007	125016	20 %	40 %	20 %	20 %	383483469
121	NC_017044	TGAAA	2	10	125368	125377	60 %	20 %	20 %	0 %	383483469
122	NC_017044	GCAAG	2	10	126022	126031	40 %	0 %	40 %	20 %	383483470
123	NC_017044	TTAAA	2	10	127958	127967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017044	CTTGT	2	10	128448	128457	0 %	60 %	20 %	20 %	383483473
125	NC_017044	TTTGA	2	10	128771	128780	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017044	ATGAT	2	10	129512	129521	40 %	40 %	20 %	0 %	383483474
127	NC_017044	CTTGT	2	10	129850	129859	0 %	60 %	20 %	20 %	383483475
128	NC_017044	TATTT	2	10	130276	130285	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017044	TCTTT	2	10	131426	131435	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017044	AACCT	2	10	132449	132458	40 %	20 %	0 %	40 %	383483478
131	NC_017044	TGGTT	2	10	133243	133252	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017044	AAATC	2	10	133587	133596	60 %	20 %	0 %	20 %	383483480
133	NC_017044	TTAAC	2	10	134724	134733	40 %	40 %	0 %	20 %	383483481
134	NC_017044	TATAA	2	10	134816	134825	60 %	40 %	0 %	0 %	383483481
135	NC_017044	TTATA	2	10	135190	135199	40 %	60 %	0 %	0 %	383483482
136	NC_017044	TTTTA	2	10	136717	136726	20 %	80 %	0 %	0 %	383483483
137	NC_017044	GCTTT	2	10	138293	138302	0 %	60 %	20 %	20 %	383483484
138	NC_017044	TATGT	2	10	138943	138952	20 %	60 %	20 %	0 %	383483484
139	NC_017044	GTTTT	2	10	141109	141118	0 %	80 %	20 %	0 %	383483485
140	NC_017044	ACAAG	2	10	145640	145649	60 %	0 %	20 %	20 %	383483486
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263	NC_017044	TAATA	2	10	292907	292916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017044	AGATA	2	10	294042	294051	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_017044	AATTT	2	10	304056	304065	40 %	60 %	0 %	0 %	383483638
272	NC_017044	TTTCC	2	10	304631	304640	0 %	60 %	0 %	40 %	383483639
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