MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 3867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017044	TAAT	2	8	44	51	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017044	CCAA	2	8	69	76	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017044	AAAT	2	8	458	465	75 %	25 %	0 %	0 %	383483342
4	NC_017044	TAAA	2	8	582	589	75 %	25 %	0 %	0 %	383483342
5	NC_017044	ATAG	2	8	641	648	50 %	25 %	25 %	0 %	383483342
6	NC_017044	TAAT	2	8	1183	1190	50 %	50 %	0 %	0 %	383483343
7	NC_017044	ATTA	2	8	1592	1599	50 %	50 %	0 %	0 %	383483343
8	NC_017044	GATT	2	8	2384	2391	25 %	50 %	25 %	0 %	383483344
9	NC_017044	TATT	2	8	2977	2984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017044	TTTA	2	8	3969	3976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017044	ATTT	2	8	4462	4469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017044	TTAT	2	8	5759	5766	25 %	75 %	0 %	0 %	383483348
13	NC_017044	TTAT	2	8	5981	5988	25 %	75 %	0 %	0 %	383483348
14	NC_017044	AACT	2	8	6364	6371	50 %	25 %	0 %	25 %	383483349
15	NC_017044	CAAA	2	8	6410	6417	75 %	0 %	0 %	25 %	383483349
16	NC_017044	TATT	2	8	6677	6684	25 %	75 %	0 %	0 %	383483349
17	NC_017044	TCGC	2	8	6807	6814	0 %	25 %	25 %	50 %	383483349
18	NC_017044	AATA	2	8	8378	8385	75 %	25 %	0 %	0 %	383483349
19	NC_017044	ATTC	2	8	8415	8422	25 %	50 %	0 %	25 %	383483349
20	NC_017044	TTAA	2	8	8547	8554	50 %	50 %	0 %	0 %	383483349
21	NC_017044	ATTT	2	8	9619	9626	25 %	75 %	0 %	0 %	383483351
22	NC_017044	TAAA	2	8	9714	9721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017044	ATAA	2	8	10171	10178	75 %	25 %	0 %	0 %	383483352
24	NC_017044	ACTT	2	8	10554	10561	25 %	50 %	0 %	25 %	383483353
25	NC_017044	ATTT	2	8	10961	10968	25 %	75 %	0 %	0 %	383483353
26	NC_017044	TTAA	2	8	12621	12628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017044	ATGA	2	8	13317	13324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017044	TAAA	2	8	14352	14359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017044	TAAA	2	8	14517	14524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017044	TCAT	2	8	14561	14568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017044	CTTT	2	8	14695	14702	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017044	TTAG	2	8	14940	14947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017044	GCAA	2	8	15039	15046	50 %	0 %	25 %	25 %	383483355
34	NC_017044	TCTT	2	8	15116	15123	0 %	75 %	0 %	25 %	383483355
35	NC_017044	AAAT	2	8	15144	15151	75 %	25 %	0 %	0 %	383483355
36	NC_017044	AGTA	2	8	15368	15375	50 %	25 %	25 %	0 %	383483356
37	NC_017044	GCTT	2	8	15897	15904	0 %	50 %	25 %	25 %	383483357
38	NC_017044	AATT	2	8	16246	16253	50 %	50 %	0 %	0 %	383483357
39	NC_017044	GCTT	2	8	16517	16524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017044	AATA	2	8	16870	16877	75 %	25 %	0 %	0 %	383483358
41	NC_017044	TCTA	2	8	17337	17344	25 %	50 %	0 %	25 %	383483358
42	NC_017044	ACGT	2	8	17760	17767	25 %	25 %	25 %	25 %	383483358
43	NC_017044	CTTG	2	8	17875	17882	0 %	50 %	25 %	25 %	383483358
44	NC_017044	GTAT	2	8	18546	18553	25 %	50 %	25 %	0 %	383483359
45	NC_017044	AGTA	2	8	18942	18949	50 %	25 %	25 %	0 %	383483360
46	NC_017044	ATTA	2	8	18967	18974	50 %	50 %	0 %	0 %	383483360
47	NC_017044	AATA	2	8	19011	19018	75 %	25 %	0 %	0 %	383483360
48	NC_017044	CTTT	2	8	19056	19063	0 %	75 %	0 %	25 %	383483360
49	NC_017044	TGAA	2	8	19204	19211	50 %	25 %	25 %	0 %	383483360
50	NC_017044	TAAA	2	8	19247	19254	75 %	25 %	0 %	0 %	383483360
51	NC_017044	AGAT	2	8	19436	19443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017044	TAAA	2	8	19602	19609	75 %	25 %	0 %	0 %	383483361
53	NC_017044	GATA	2	8	19683	19690	50 %	25 %	25 %	0 %	383483361
54	NC_017044	AGCA	2	8	19751	19758	50 %	0 %	25 %	25 %	383483361
55	NC_017044	AGTA	2	8	20015	20022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017044	AAAC	2	8	20065	20072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017044	TAAA	2	8	20140	20147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017044	TTAT	2	8	20338	20345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017044	GTAA	2	8	21258	21265	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
60	NC_017044	AGAT	2	8	21512	21519	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
61	NC_017044	AGCA	2	8	21631	21638	50 %	0 %	25 %	25 %	383483363
62	NC_017044	AAAT	2	8	21674	21681	75 %	25 %	0 %	0 %	383483363
63	NC_017044	ATTA	2	8	22134	22141	50 %	50 %	0 %	0 %	383483363
64	NC_017044	ATAG	2	8	22182	22189	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
65	NC_017044	ATAG	2	8	22194	22201	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
66	NC_017044	CGTT	2	8	22603	22610	0 %	50 %	25 %	25 %	383483363
67	NC_017044	CAAA	2	8	22920	22927	75 %	0 %	0 %	25 %	383483363
68	NC_017044	TAGT	2	8	23050	23057	25 %	50 %	25 %	0 %	383483363
69	NC_017044	AGTT	2	8	23150	23157	25 %	50 %	25 %	0 %	383483363
70	NC_017044	GTTA	2	8	23595	23602	25 %	50 %	25 %	0 %	383483363
71	NC_017044	AAGC	2	8	23790	23797	50 %	0 %	25 %	25 %	383483363
72	NC_017044	AAGC	2	8	23994	24001	50 %	0 %	25 %	25 %	383483363
73	NC_017044	TAAA	2	8	24355	24362	75 %	25 %	0 %	0 %	383483363
74	NC_017044	AAGT	2	8	24883	24890	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
75	NC_017044	TTCA	2	8	25441	25448	25 %	50 %	0 %	25 %	383483363
76	NC_017044	AATA	2	8	25934	25941	75 %	25 %	0 %	0 %	383483363
77	NC_017044	TAAA	2	8	26080	26087	75 %	25 %	0 %	0 %	383483363
78	NC_017044	ACTA	2	8	26216	26223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017044	TTAT	2	8	26931	26938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017044	AAGT	2	8	27458	27465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017044	TAAT	2	8	27836	27843	50 %	50 %	0 %	0 %	383483366
82	NC_017044	AAGA	2	8	27988	27995	75 %	0 %	25 %	0 %	383483366
83	NC_017044	AAAT	2	8	28080	28087	75 %	25 %	0 %	0 %	383483366
84	NC_017044	ATTA	2	8	28109	28116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017044	TAAA	2	8	28946	28953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017044	GATA	2	8	29034	29041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017044	TAAA	2	8	29278	29285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017044	GCTA	2	8	29288	29295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017044	TCTA	2	8	30037	30044	25 %	50 %	0 %	25 %	383483369
90	NC_017044	ATTT	2	8	30081	30088	25 %	75 %	0 %	0 %	383483369
91	NC_017044	TGTC	2	8	30145	30152	0 %	50 %	25 %	25 %	383483369
92	NC_017044	TAAT	2	8	30535	30542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017044	ATAA	2	8	31166	31173	75 %	25 %	0 %	0 %	383483372
94	NC_017044	CACT	2	8	31260	31267	25 %	25 %	0 %	50 %	383483372
95	NC_017044	TATT	2	8	32084	32091	25 %	75 %	0 %	0 %	383483374
96	NC_017044	AATT	2	8	33718	33725	50 %	50 %	0 %	0 %	383483377
97	NC_017044	TACC	2	8	33808	33815	25 %	25 %	0 %	50 %	383483377
98	NC_017044	GTTA	2	8	34190	34197	25 %	50 %	25 %	0 %	383483377
99	NC_017044	AAAC	2	8	35610	35617	75 %	0 %	0 %	25 %	383483379
100	NC_017044	TTAG	2	8	35786	35793	25 %	50 %	25 %	0 %	383483379
101	NC_017044	TTGC	2	8	36081	36088	0 %	50 %	25 %	25 %	383483379
102	NC_017044	ACTA	2	8	36235	36242	50 %	25 %	0 %	25 %	383483379
103	NC_017044	TTCC	2	8	36321	36328	0 %	50 %	0 %	50 %	383483379
104	NC_017044	TGTT	2	8	36789	36796	0 %	75 %	25 %	0 %	383483380
105	NC_017044	TTGT	2	8	37400	37407	0 %	75 %	25 %	0 %	383483381
106	NC_017044	TATT	2	8	37479	37486	25 %	75 %	0 %	0 %	383483381
107	NC_017044	GTAA	2	8	37490	37497	50 %	25 %	25 %	0 %	383483381
108	NC_017044	AATG	2	8	38264	38271	50 %	25 %	25 %	0 %	383483383
109	NC_017044	GTTT	2	8	38803	38810	0 %	75 %	25 %	0 %	383483384
110	NC_017044	GCTT	2	8	39050	39057	0 %	50 %	25 %	25 %	383483385
111	NC_017044	ATAA	2	8	39276	39283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017044	AACA	2	8	39373	39380	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017044	CTGA	2	8	41341	41348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017044	ATTG	2	8	41511	41518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017044	TAAA	2	8	41668	41675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017044	ATTT	2	8	41775	41782	25 %	75 %	0 %	0 %	383483389
117	NC_017044	ATTA	2	8	41993	42000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017044	TGCT	2	8	42116	42123	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017044	ATTA	2	8	42654	42661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017044	TAAT	2	8	42949	42956	50 %	50 %	0 %	0 %	383483391
121	NC_017044	ATTA	2	8	43020	43027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017044	AAAT	2	8	43123	43130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017044	GAAA	2	8	43334	43341	75 %	0 %	25 %	0 %	383483392
124	NC_017044	ATTT	2	8	43378	43385	25 %	75 %	0 %	0 %	383483392
125	NC_017044	ACAA	2	8	43645	43652	75 %	0 %	0 %	25 %	383483392
126	NC_017044	AAAT	2	8	43849	43856	75 %	25 %	0 %	0 %	383483393
127	NC_017044	TACC	2	8	45203	45210	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017044	AAAC	2	8	45211	45218	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017044	TAAT	2	8	45287	45294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017044	ATTA	2	8	45322	45329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017044	TAAA	2	8	45340	45347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017044	ATGA	2	8	45547	45554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017044	TAAC	2	8	45737	45744	50 %	25 %	0 %	25 %	383483395
134	NC_017044	ATAC	2	8	45964	45971	50 %	25 %	0 %	25 %	383483395
135	NC_017044	ATTC	2	8	46168	46175	25 %	50 %	0 %	25 %	383483395
136	NC_017044	ATGT	2	8	46517	46524	25 %	50 %	25 %	0 %	383483396
137	NC_017044	ATTT	2	8	46675	46682	25 %	75 %	0 %	0 %	383483396
138	NC_017044	TTAC	2	8	46754	46761	25 %	50 %	0 %	25 %	383483396
139	NC_017044	ATCA	2	8	47431	47438	50 %	25 %	0 %	25 %	383483397
140	NC_017044	TGCC	2	8	47741	47748	0 %	25 %	25 %	50 %	383483397
141	NC_017044	TATC	2	8	48300	48307	25 %	50 %	0 %	25 %	383483397
142	NC_017044	TTAA	2	8	48323	48330	50 %	50 %	0 %	0 %	383483397
143	NC_017044	AGTA	2	8	49445	49452	50 %	25 %	25 %	0 %	383483399
144	NC_017044	ATAC	2	8	49663	49670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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146	NC_017044	TGTT	2	8	50182	50189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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