MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017044	GAG	2	6	158480	158485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483496
4003	NC_017044	TAG	2	6	158552	158557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483496
4004	NC_017044	CGA	2	6	158565	158570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483496
4005	NC_017044	AT	3	6	158600	158605	50 %	50 %	0 %	0 %	383483496
4006	NC_017044	TTGC	3	12	158637	158648	0 %	50 %	25 %	25 %	383483496
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4010	NC_017044	GAA	2	6	158836	158841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483496
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4012	NC_017044	GCC	2	6	158892	158897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483496
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4015	NC_017044	AGT	2	6	158961	158966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483496
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4017	NC_017044	ATTG	2	8	159108	159115	25 %	50 %	25 %	0 %	383483496
4018	NC_017044	GTG	2	6	159128	159133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483496
4019	NC_017044	GTG	2	6	159137	159142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483496
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4023	NC_017044	TAT	2	6	159270	159275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483496
4024	NC_017044	CATG	2	8	159333	159340	25 %	25 %	25 %	25 %	383483496
4025	NC_017044	ATG	2	6	159397	159402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483496
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4027	NC_017044	GAAA	2	8	159459	159466	75 %	0 %	25 %	0 %	383483496
4028	NC_017044	GAG	2	6	159600	159605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017044	GCGA	2	8	159637	159644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_017044	ATA	2	6	159679	159684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017044	AAT	2	6	159751	159756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017044	ATA	2	6	159776	159781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483497
4033	NC_017044	TAA	2	6	159795	159800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483497
4034	NC_017044	CTTTTG	2	12	159824	159835	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383483497
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4041	NC_017044	ATTG	2	8	160122	160129	25 %	50 %	25 %	0 %	383483497
4042	NC_017044	AT	4	8	160138	160145	50 %	50 %	0 %	0 %	383483497
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4056	NC_017044	ACTT	2	8	160841	160848	25 %	50 %	0 %	25 %	383483498
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4097	NC_017044	AAT	2	6	162372	162377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4108	NC_017044	TTA	2	6	162846	162851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483500
4109	NC_017044	AAT	2	6	162862	162867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017044	AAT	3	9	162880	162888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483501
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4112	NC_017044	AGCA	2	8	162999	163006	50 %	0 %	25 %	25 %	383483501
4113	NC_017044	GTA	2	6	163008	163013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483501
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4123	NC_017044	T	6	6	163396	163401	0 %	100 %	0 %	0 %	383483501
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4125	NC_017044	A	7	7	163454	163460	100 %	0 %	0 %	0 %	383483501
4126	NC_017044	CAA	2	6	163469	163474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483501
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4131	NC_017044	TCA	2	6	163618	163623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483502
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4133	NC_017044	TCA	2	6	163693	163698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483502
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4138	NC_017044	AT	3	6	163933	163938	50 %	50 %	0 %	0 %	383483502
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4140	NC_017044	AT	3	6	163955	163960	50 %	50 %	0 %	0 %	383483502
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4142	NC_017044	AT	4	8	164178	164185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4154	NC_017044	TTCG	2	8	164507	164514	0 %	50 %	25 %	25 %	383483503
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4208	NC_017044	AT	4	8	166268	166275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4232	NC_017044	AAG	2	6	167152	167157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483505
4233	NC_017044	AGAT	2	8	167258	167265	50 %	25 %	25 %	0 %	383483505
4234	NC_017044	AGT	2	6	167276	167281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483505
4235	NC_017044	ATT	2	6	167313	167318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483505
4236	NC_017044	AAT	2	6	167319	167324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483505
4237	NC_017044	ACT	2	6	167327	167332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483505
4238	NC_017044	ACA	2	6	167434	167439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4239	NC_017044	CAA	2	6	167454	167459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483506
4240	NC_017044	TAT	2	6	167466	167471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483506
4241	NC_017044	ACTGAT	2	12	167495	167506	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383483506
4242	NC_017044	AGT	2	6	167546	167551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483506
4243	NC_017044	T	6	6	167631	167636	0 %	100 %	0 %	0 %	383483506
4244	NC_017044	GTTGAG	2	12	167655	167666	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383483506
4245	NC_017044	GCT	2	6	167682	167687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483506
4246	NC_017044	TTG	2	6	167704	167709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483506
4247	NC_017044	TAA	2	6	167732	167737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483506
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4497	NC_017044	AGT	2	6	177604	177609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483516
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4499	NC_017044	ATT	2	6	177737	177742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483516
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