MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017044	AT	3	6	137586	137591	50 %	50 %	0 %	0 %	383483483
3502	NC_017044	TTAA	2	8	137593	137600	50 %	50 %	0 %	0 %	383483483
3503	NC_017044	CTA	2	6	137612	137617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483483
3504	NC_017044	T	6	6	137625	137630	0 %	100 %	0 %	0 %	383483483
3505	NC_017044	AG	3	6	137743	137748	50 %	0 %	50 %	0 %	383483483
3506	NC_017044	GCA	2	6	137791	137796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483483
3507	NC_017044	CTGT	2	8	137816	137823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3508	NC_017044	ATT	2	6	137934	137939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483484
3509	NC_017044	GTA	2	6	137945	137950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483484
3510	NC_017044	TGC	2	6	138083	138088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483484
3511	NC_017044	TTG	2	6	138113	138118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483484
3512	NC_017044	TC	3	6	138152	138157	0 %	50 %	0 %	50 %	383483484
3513	NC_017044	ATTT	2	8	138206	138213	25 %	75 %	0 %	0 %	383483484
3514	NC_017044	GCTTT	2	10	138293	138302	0 %	60 %	20 %	20 %	383483484
3515	NC_017044	TAA	2	6	138306	138311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483484
3516	NC_017044	AATT	2	8	138317	138324	50 %	50 %	0 %	0 %	383483484
3517	NC_017044	TTGCTA	2	12	138359	138370	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383483484
3518	NC_017044	GAT	2	6	138400	138405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483484
3519	NC_017044	A	8	8	138427	138434	100 %	0 %	0 %	0 %	383483484
3520	NC_017044	AT	3	6	138505	138510	50 %	50 %	0 %	0 %	383483484
3521	NC_017044	AAGATA	2	12	138524	138535	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383483484
3522	NC_017044	AT	3	6	138588	138593	50 %	50 %	0 %	0 %	383483484
3523	NC_017044	CTTTAG	2	12	138686	138697	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383483484
3524	NC_017044	GATG	2	8	138718	138725	25 %	25 %	50 %	0 %	383483484
3525	NC_017044	AGT	2	6	138759	138764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483484
3526	NC_017044	TATGT	2	10	138943	138952	20 %	60 %	20 %	0 %	383483484
3527	NC_017044	T	6	6	138952	138957	0 %	100 %	0 %	0 %	383483484
3528	NC_017044	GCC	2	6	138987	138992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483484
3529	NC_017044	TA	3	6	139003	139008	50 %	50 %	0 %	0 %	383483484
3530	NC_017044	TGC	2	6	139167	139172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483484
3531	NC_017044	TCCG	2	8	139173	139180	0 %	25 %	25 %	50 %	383483484
3532	NC_017044	TCTT	2	8	139200	139207	0 %	75 %	0 %	25 %	383483484
3533	NC_017044	ATT	2	6	139265	139270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483484
3534	NC_017044	AT	3	6	139280	139285	50 %	50 %	0 %	0 %	383483484
3535	NC_017044	T	6	6	139326	139331	0 %	100 %	0 %	0 %	383483484
3536	NC_017044	TTTAGT	2	12	139345	139356	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383483484
3537	NC_017044	CCA	2	6	139360	139365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383483484
3538	NC_017044	TATT	2	8	139368	139375	25 %	75 %	0 %	0 %	383483484
3539	NC_017044	ATG	2	6	139405	139410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483484
3540	NC_017044	TGC	2	6	139455	139460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483484
3541	NC_017044	CTC	2	6	139520	139525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483484
3542	NC_017044	ATT	2	6	139562	139567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483484
3543	NC_017044	TGG	2	6	139613	139618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483484
3544	NC_017044	AGA	2	6	139710	139715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483484
3545	NC_017044	TAA	2	6	139767	139772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483484
3546	NC_017044	GAT	2	6	139780	139785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483484
3547	NC_017044	AAT	2	6	139849	139854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483484
3548	NC_017044	AGT	2	6	139968	139973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483484
3549	NC_017044	GTTA	2	8	140043	140050	25 %	50 %	25 %	0 %	383483484
3550	NC_017044	TAG	2	6	140085	140090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483484
3551	NC_017044	AGCT	2	8	140093	140100	25 %	25 %	25 %	25 %	383483484
3552	NC_017044	TGC	2	6	140106	140111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483484
3553	NC_017044	TAA	2	6	140136	140141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483484
3554	NC_017044	GCAA	2	8	140157	140164	50 %	0 %	25 %	25 %	383483484
3555	NC_017044	TGC	2	6	140202	140207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483484
3556	NC_017044	G	6	6	140214	140219	0 %	0 %	100 %	0 %	383483484
3557	NC_017044	AGG	2	6	140238	140243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483484
3558	NC_017044	GGA	2	6	140272	140277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483484
3559	NC_017044	ATA	2	6	140318	140323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483484
3560	NC_017044	TGC	2	6	140325	140330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483484
3561	NC_017044	AAC	2	6	140358	140363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483484
3562	NC_017044	TCT	2	6	140377	140382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483484
3563	NC_017044	AGT	2	6	140410	140415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483484
3564	NC_017044	TGT	2	6	140430	140435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483484
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3567	NC_017044	CAC	2	6	140507	140512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383483484
3568	NC_017044	ATA	2	6	140534	140539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483484
3569	NC_017044	A	6	6	140551	140556	100 %	0 %	0 %	0 %	383483484
3570	NC_017044	ATA	2	6	140564	140569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483484
3571	NC_017044	TAG	2	6	140762	140767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483484
3572	NC_017044	GGA	3	9	140773	140781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483484
3573	NC_017044	AAG	2	6	140795	140800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483484
3574	NC_017044	GAG	2	6	140801	140806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483484
3575	NC_017044	ACG	2	6	140817	140822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483484
3576	NC_017044	GTA	2	6	140866	140871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483484
3577	NC_017044	A	8	8	140876	140883	100 %	0 %	0 %	0 %	383483484
3578	NC_017044	ATA	2	6	140885	140890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483484
3579	NC_017044	TTA	2	6	140925	140930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483485
3580	NC_017044	TAGC	2	8	140955	140962	25 %	25 %	25 %	25 %	383483485
3581	NC_017044	ACT	2	6	140999	141004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483485
3582	NC_017044	TA	3	6	141041	141046	50 %	50 %	0 %	0 %	383483485
3583	NC_017044	GTTTT	2	10	141109	141118	0 %	80 %	20 %	0 %	383483485
3584	NC_017044	GTA	3	9	141132	141140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483485
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3588	NC_017044	TTAA	2	8	141422	141429	50 %	50 %	0 %	0 %	383483485
3589	NC_017044	TAA	2	6	141469	141474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483485
3590	NC_017044	T	6	6	141479	141484	0 %	100 %	0 %	0 %	383483485
3591	NC_017044	TGC	2	6	141535	141540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483485
3592	NC_017044	T	6	6	141605	141610	0 %	100 %	0 %	0 %	383483485
3593	NC_017044	A	6	6	141651	141656	100 %	0 %	0 %	0 %	383483485
3594	NC_017044	TAA	2	6	141669	141674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483485
3595	NC_017044	TTG	2	6	141684	141689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483485
3596	NC_017044	GCG	2	6	141726	141731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483485
3597	NC_017044	AGC	2	6	141787	141792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483485
3598	NC_017044	GAT	2	6	141808	141813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483485
3599	NC_017044	GCA	2	6	141821	141826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483485
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3601	NC_017044	TTA	2	6	141919	141924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483485
3602	NC_017044	TAA	2	6	142000	142005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483485
3603	NC_017044	T	6	6	142082	142087	0 %	100 %	0 %	0 %	383483485
3604	NC_017044	TTA	2	6	142122	142127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483485
3605	NC_017044	GCA	2	6	142133	142138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483485
3606	NC_017044	TTA	2	6	142182	142187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483485
3607	NC_017044	ATT	2	6	142191	142196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483485
3608	NC_017044	AT	3	6	142228	142233	50 %	50 %	0 %	0 %	383483485
3609	NC_017044	ATTC	2	8	142243	142250	25 %	50 %	0 %	25 %	383483485
3610	NC_017044	GTAT	2	8	142301	142308	25 %	50 %	25 %	0 %	383483485
3611	NC_017044	AGT	2	6	142330	142335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483485
3612	NC_017044	TAA	2	6	142356	142361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483485
3613	NC_017044	TATG	2	8	142363	142370	25 %	50 %	25 %	0 %	383483485
3614	NC_017044	TGT	2	6	142579	142584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483485
3615	NC_017044	T	6	6	142629	142634	0 %	100 %	0 %	0 %	383483485
3616	NC_017044	AAAG	2	8	142735	142742	75 %	0 %	25 %	0 %	383483485
3617	NC_017044	AGC	2	6	142744	142749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483485
3618	NC_017044	TGC	2	6	142762	142767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483485
3619	NC_017044	AGC	2	6	142836	142841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483485
3620	NC_017044	TTA	2	6	142901	142906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483486
3621	NC_017044	TAG	2	6	142929	142934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483486
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