MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017044	ATG	2	6	116859	116864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483463
3003	NC_017044	A	6	6	116871	116876	100 %	0 %	0 %	0 %	383483463
3004	NC_017044	GAA	2	6	116904	116909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483463
3005	NC_017044	TTC	2	6	116920	116925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483463
3006	NC_017044	GCT	3	9	116940	116948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483463
3007	NC_017044	AAAG	2	8	116951	116958	75 %	0 %	25 %	0 %	383483463
3008	NC_017044	TTG	2	6	117046	117051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483463
3009	NC_017044	GAA	3	9	117162	117170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483463
3010	NC_017044	CGT	2	6	117213	117218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483463
3011	NC_017044	AT	3	6	117223	117228	50 %	50 %	0 %	0 %	383483463
3012	NC_017044	TAG	2	6	117304	117309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483463
3013	NC_017044	GAT	2	6	117402	117407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483463
3014	NC_017044	GA	3	6	117438	117443	50 %	0 %	50 %	0 %	383483463
3015	NC_017044	T	6	6	117450	117455	0 %	100 %	0 %	0 %	383483463
3016	NC_017044	AGA	2	6	117467	117472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483463
3017	NC_017044	ATA	2	6	117484	117489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483463
3018	NC_017044	TTC	2	6	117525	117530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483463
3019	NC_017044	TTA	2	6	117643	117648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483463
3020	NC_017044	GAA	2	6	117678	117683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483463
3021	NC_017044	A	7	7	117682	117688	100 %	0 %	0 %	0 %	383483463
3022	NC_017044	GTT	2	6	117790	117795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017044	AAT	2	6	117937	117942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017044	A	6	6	117976	117981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017044	ACTC	2	8	117991	117998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_017044	CAAA	2	8	118013	118020	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_017044	TC	3	6	118066	118071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_017044	CTAT	2	8	118083	118090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_017044	TAA	2	6	118091	118096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017044	T	6	6	118108	118113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017044	TAA	2	6	118120	118125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017044	TA	3	6	118314	118319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017044	A	7	7	118451	118457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017044	GTC	2	6	118530	118535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_017044	CTA	2	6	118592	118597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_017044	GTT	2	6	118606	118611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017044	TAC	2	6	118749	118754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017044	AGA	2	6	118755	118760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017044	T	6	6	118836	118841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017044	TAT	2	6	118978	118983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017044	TAA	2	6	119153	119158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483464
3042	NC_017044	ATT	2	6	119199	119204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483464
3043	NC_017044	TTAGT	2	10	119222	119231	20 %	60 %	20 %	0 %	383483464
3044	NC_017044	GCT	2	6	119263	119268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483464
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3046	NC_017044	GCT	2	6	119347	119352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483464
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3048	NC_017044	A	7	7	119414	119420	100 %	0 %	0 %	0 %	383483464
3049	NC_017044	TA	3	6	119448	119453	50 %	50 %	0 %	0 %	383483464
3050	NC_017044	ATC	2	6	119457	119462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483464
3051	NC_017044	TAGCGG	2	12	119492	119503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383483464
3052	NC_017044	ATA	2	6	119569	119574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483464
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3054	NC_017044	A	6	6	119844	119849	100 %	0 %	0 %	0 %	383483464
3055	NC_017044	TAG	2	6	119904	119909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483464
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3057	NC_017044	TATC	2	8	120023	120030	25 %	50 %	0 %	25 %	383483464
3058	NC_017044	AACG	2	8	120113	120120	50 %	0 %	25 %	25 %	383483464
3059	NC_017044	TAT	2	6	120140	120145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483464
3060	NC_017044	TGCT	2	8	120179	120186	0 %	50 %	25 %	25 %	383483464
3061	NC_017044	TTA	2	6	120319	120324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483464
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3064	NC_017044	ATAAA	2	10	120439	120448	80 %	20 %	0 %	0 %	383483464
3065	NC_017044	TAA	2	6	120453	120458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483464
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3068	NC_017044	CAT	2	6	120486	120491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483464
3069	NC_017044	TAT	2	6	120614	120619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483465
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3071	NC_017044	TA	3	6	120727	120732	50 %	50 %	0 %	0 %	383483465
3072	NC_017044	TAT	2	6	120761	120766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483465
3073	NC_017044	TAG	2	6	120826	120831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483465
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3075	NC_017044	CTA	2	6	120862	120867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483465
3076	NC_017044	AAGTA	2	10	121045	121054	60 %	20 %	20 %	0 %	383483465
3077	NC_017044	AGT	2	6	121082	121087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483465
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3081	NC_017044	ATT	2	6	121143	121148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483465
3082	NC_017044	T	7	7	121147	121153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017044	AAGT	2	8	121203	121210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017044	GCT	2	6	121258	121263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3090	NC_017044	TA	3	6	121628	121633	50 %	50 %	0 %	0 %	383483466
3091	NC_017044	AGC	2	6	121661	121666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483466
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3094	NC_017044	ATC	2	6	121859	121864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483466
3095	NC_017044	ATC	2	6	121886	121891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483466
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3098	NC_017044	AAT	2	6	122141	122146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483466
3099	NC_017044	TA	4	8	122185	122192	50 %	50 %	0 %	0 %	383483466
3100	NC_017044	CCG	2	6	122202	122207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483466
3101	NC_017044	TAT	2	6	122216	122221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483466
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3103	NC_017044	TAT	2	6	122242	122247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483466
3104	NC_017044	TTGC	2	8	122272	122279	0 %	50 %	25 %	25 %	383483466
3105	NC_017044	CGC	2	6	122342	122347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483466
3106	NC_017044	ATA	2	6	122400	122405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483466
3107	NC_017044	T	6	6	122417	122422	0 %	100 %	0 %	0 %	383483466
3108	NC_017044	T	7	7	122434	122440	0 %	100 %	0 %	0 %	383483466
3109	NC_017044	AAT	2	6	122489	122494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483466
3110	NC_017044	TA	3	6	122533	122538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017044	AT	3	6	122564	122569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017044	ATA	2	6	122611	122616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017044	CTT	2	6	122659	122664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_017044	T	6	6	122670	122675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017044	T	6	6	122685	122690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017044	TCC	2	6	122704	122709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_017044	GCT	2	6	122710	122715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017044	CTCAAT	2	12	122727	122738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_017044	T	7	7	122788	122794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017044	ATTCG	2	10	122795	122804	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3121	NC_017044	ATA	2	6	122822	122827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017044	TTC	3	9	122856	122864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_017044	AAT	2	6	122874	122879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017044	TTCT	2	8	122890	122897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_017044	TTAA	2	8	122899	122906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017044	T	6	6	122954	122959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3379	NC_017044	AT	3	6	132561	132566	50 %	50 %	0 %	0 %	383483478
3380	NC_017044	GAT	2	6	132577	132582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483478
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