MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017044	ATAA	2	8	58399	58406	75 %	25 %	0 %	0 %	383483407
1502	NC_017044	GCT	2	6	58429	58434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483407
1503	NC_017044	AAT	2	6	58442	58447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483407
1504	NC_017044	TAA	2	6	58464	58469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483407
1505	NC_017044	CATC	2	8	58536	58543	25 %	25 %	0 %	50 %	383483407
1506	NC_017044	TAT	2	6	58574	58579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483407
1507	NC_017044	ATG	2	6	58626	58631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483407
1508	NC_017044	ATTT	3	12	58712	58723	25 %	75 %	0 %	0 %	383483407
1509	NC_017044	ATT	2	6	58773	58778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483407
1510	NC_017044	ATA	2	6	58782	58787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483407
1511	NC_017044	ATA	2	6	58858	58863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483407
1512	NC_017044	AT	3	6	58945	58950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017044	ATTAT	2	10	58975	58984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017044	TTTA	2	8	59062	59069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017044	AACG	2	8	59084	59091	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_017044	TAA	2	6	59096	59101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017044	TAT	2	6	59195	59200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483408
1518	NC_017044	A	8	8	59234	59241	100 %	0 %	0 %	0 %	383483408
1519	NC_017044	TAA	2	6	59338	59343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483408
1520	NC_017044	TAT	2	6	59344	59349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483408
1521	NC_017044	CTA	2	6	59395	59400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017044	AAG	2	6	59412	59417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017044	A	7	7	59425	59431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017044	GTTA	2	8	59449	59456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017044	TTA	2	6	59464	59469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017044	TAA	2	6	59494	59499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017044	ATA	2	6	59502	59507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017044	AGC	2	6	59511	59516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_017044	A	8	8	59522	59529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017044	CT	4	8	59579	59586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_017044	TAT	2	6	59589	59594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017044	T	6	6	59616	59621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017044	T	7	7	59623	59629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017044	AAT	2	6	59697	59702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017044	TAA	2	6	59715	59720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017044	TTA	2	6	59730	59735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017044	ATA	2	6	59774	59779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017044	T	6	6	59781	59786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017044	ATA	2	6	59791	59796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017044	GTTT	2	8	59842	59849	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017044	TA	3	6	59862	59867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017044	TAT	2	6	59893	59898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483409
1543	NC_017044	TGA	2	6	59938	59943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483409
1544	NC_017044	ATT	2	6	59954	59959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483409
1545	NC_017044	ATA	2	6	59964	59969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483409
1546	NC_017044	A	7	7	59983	59989	100 %	0 %	0 %	0 %	383483409
1547	NC_017044	TAA	2	6	60028	60033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483409
1548	NC_017044	A	6	6	60035	60040	100 %	0 %	0 %	0 %	383483409
1549	NC_017044	ATT	3	9	60045	60053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483409
1550	NC_017044	T	6	6	60052	60057	0 %	100 %	0 %	0 %	383483409
1551	NC_017044	AGA	2	6	60085	60090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483409
1552	NC_017044	AGAA	2	8	60094	60101	75 %	0 %	25 %	0 %	383483409
1553	NC_017044	TAG	2	6	60157	60162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483409
1554	NC_017044	A	6	6	60181	60186	100 %	0 %	0 %	0 %	383483409
1555	NC_017044	TAA	2	6	60226	60231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483409
1556	NC_017044	TAA	2	6	60271	60276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483410
1557	NC_017044	GCT	2	6	60290	60295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483410
1558	NC_017044	A	6	6	60320	60325	100 %	0 %	0 %	0 %	383483410
1559	NC_017044	T	6	6	60329	60334	0 %	100 %	0 %	0 %	383483410
1560	NC_017044	AGA	2	6	60335	60340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483410
1561	NC_017044	TAA	2	6	60405	60410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483410
1562	NC_017044	AAAG	2	8	60474	60481	75 %	0 %	25 %	0 %	383483410
1563	NC_017044	AAT	2	6	60485	60490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483410
1564	NC_017044	TTA	2	6	60518	60523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483410
1565	NC_017044	TAAA	2	8	60541	60548	75 %	25 %	0 %	0 %	383483410
1566	NC_017044	TAA	2	6	60572	60577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483411
1567	NC_017044	TAA	2	6	60684	60689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483411
1568	NC_017044	AGA	2	6	60744	60749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483411
1569	NC_017044	A	6	6	60755	60760	100 %	0 %	0 %	0 %	383483411
1570	NC_017044	TTA	2	6	60770	60775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483411
1571	NC_017044	CAA	2	6	60781	60786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483411
1572	NC_017044	TCGGT	2	10	60827	60836	0 %	40 %	40 %	20 %	383483411
1573	NC_017044	TAA	2	6	60840	60845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483411
1574	NC_017044	AT	3	6	60872	60877	50 %	50 %	0 %	0 %	383483411
1575	NC_017044	ATT	2	6	60901	60906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483411
1576	NC_017044	TTG	2	6	60989	60994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483411
1577	NC_017044	ATCAGA	2	12	60999	61010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383483411
1578	NC_017044	ATT	2	6	61019	61024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483411
1579	NC_017044	AGA	2	6	61050	61055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483411
1580	NC_017044	T	8	8	61076	61083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017044	ATC	2	6	61084	61089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_017044	T	6	6	61101	61106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017044	TTG	2	6	61130	61135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017044	T	7	7	61240	61246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017044	TAC	2	6	61275	61280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_017044	AAT	2	6	61362	61367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483412
1587	NC_017044	TGG	2	6	61412	61417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483412
1588	NC_017044	CTT	2	6	61434	61439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483412
1589	NC_017044	ATA	2	6	61468	61473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483412
1590	NC_017044	ATT	2	6	61478	61483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483412
1591	NC_017044	AAT	2	6	61599	61604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483412
1592	NC_017044	AAGA	2	8	61618	61625	75 %	0 %	25 %	0 %	383483412
1593	NC_017044	TGA	2	6	61648	61653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483412
1594	NC_017044	AT	3	6	61675	61680	50 %	50 %	0 %	0 %	383483412
1595	NC_017044	GAT	2	6	61707	61712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483412
1596	NC_017044	TAG	2	6	61766	61771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483412
1597	NC_017044	TAA	2	6	61790	61795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483412
1598	NC_017044	AAT	2	6	61802	61807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483412
1599	NC_017044	TA	3	6	61816	61821	50 %	50 %	0 %	0 %	383483412
1600	NC_017044	TAG	2	6	61840	61845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483412
1601	NC_017044	ATA	2	6	61861	61866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483412
1602	NC_017044	TTA	2	6	61918	61923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483412
1603	NC_017044	AG	3	6	61980	61985	50 %	0 %	50 %	0 %	383483412
1604	NC_017044	GCA	2	6	62008	62013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483412
1605	NC_017044	AAT	2	6	62108	62113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483412
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1607	NC_017044	CAA	2	6	62132	62137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483412
1608	NC_017044	GCTTT	2	10	62209	62218	0 %	60 %	20 %	20 %	383483412
1609	NC_017044	TAAT	2	8	62269	62276	50 %	50 %	0 %	0 %	383483412
1610	NC_017044	T	6	6	62276	62281	0 %	100 %	0 %	0 %	383483412
1611	NC_017044	ATA	2	6	62286	62291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483412
1612	NC_017044	AGC	2	6	62309	62314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483412
1613	NC_017044	ATTA	2	8	62345	62352	50 %	50 %	0 %	0 %	383483412
1614	NC_017044	TA	3	6	62420	62425	50 %	50 %	0 %	0 %	383483412
1615	NC_017044	A	6	6	62439	62444	100 %	0 %	0 %	0 %	383483412
1616	NC_017044	ATA	2	6	62488	62493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483412
1617	NC_017044	A	6	6	62507	62512	100 %	0 %	0 %	0 %	383483412
1618	NC_017044	ATA	2	6	62565	62570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483412
1619	NC_017044	AT	3	6	62683	62688	50 %	50 %	0 %	0 %	383483412
1620	NC_017044	TAAA	2	8	62793	62800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017044	ATTT	2	8	62814	62821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017044	CT	3	6	62828	62833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_017044	TTA	2	6	62851	62856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017044	AAT	2	6	62872	62877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483413
1625	NC_017044	GCA	2	6	62902	62907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483413
1626	NC_017044	TGG	2	6	62961	62966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483413
1627	NC_017044	ATA	2	6	62972	62977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483413
1628	NC_017044	T	6	6	62991	62996	0 %	100 %	0 %	0 %	383483413
1629	NC_017044	TGA	2	6	63006	63011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483413
1630	NC_017044	AGT	2	6	63147	63152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483413
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