MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017044	ATT	2	6	19498	19503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017044	ATT	2	6	19574	19579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483361
503	NC_017044	TAAA	2	8	19602	19609	75 %	25 %	0 %	0 %	383483361
504	NC_017044	GATA	2	8	19683	19690	50 %	25 %	25 %	0 %	383483361
505	NC_017044	GTA	2	6	19720	19725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483361
506	NC_017044	AGCA	2	8	19751	19758	50 %	0 %	25 %	25 %	383483361
507	NC_017044	TA	3	6	19790	19795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017044	T	6	6	19796	19801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017044	T	6	6	19841	19846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017044	TAA	2	6	19863	19868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017044	TCC	2	6	19875	19880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383483362
512	NC_017044	TGA	2	6	19925	19930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483362
513	NC_017044	AAT	2	6	20004	20009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483362
514	NC_017044	AGTA	2	8	20015	20022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017044	AT	3	6	20033	20038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017044	AAAC	2	8	20065	20072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_017044	A	6	6	20075	20080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017044	A	7	7	20083	20089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017044	TTG	2	6	20090	20095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017044	AAT	2	6	20130	20135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017044	TAAA	2	8	20140	20147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017044	ATT	2	6	20172	20177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017044	AAT	2	6	20267	20272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017044	TA	3	6	20317	20322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017044	TTAT	2	8	20338	20345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017044	TTTAA	2	10	20375	20384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017044	AAC	2	6	20416	20421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483363
528	NC_017044	A	7	7	20429	20435	100 %	0 %	0 %	0 %	383483363
529	NC_017044	AAG	2	6	20515	20520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483363
530	NC_017044	AGT	2	6	20538	20543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483363
531	NC_017044	TTG	2	6	20547	20552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483363
532	NC_017044	GTA	2	6	20749	20754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483363
533	NC_017044	A	6	6	20821	20826	100 %	0 %	0 %	0 %	383483363
534	NC_017044	TAA	2	6	20893	20898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483363
535	NC_017044	TAC	2	6	20963	20968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483363
536	NC_017044	TAC	2	6	20990	20995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483363
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541	NC_017044	TTC	2	6	21190	21195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483363
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543	NC_017044	GTAA	2	8	21258	21265	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
544	NC_017044	GAT	2	6	21284	21289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483363
545	NC_017044	A	6	6	21339	21344	100 %	0 %	0 %	0 %	383483363
546	NC_017044	A	6	6	21348	21353	100 %	0 %	0 %	0 %	383483363
547	NC_017044	A	6	6	21391	21396	100 %	0 %	0 %	0 %	383483363
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550	NC_017044	AGAT	2	8	21512	21519	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
551	NC_017044	A	6	6	21535	21540	100 %	0 %	0 %	0 %	383483363
552	NC_017044	AGCA	2	8	21631	21638	50 %	0 %	25 %	25 %	383483363
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555	NC_017044	AGT	2	6	21705	21710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483363
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557	NC_017044	A	6	6	21732	21737	100 %	0 %	0 %	0 %	383483363
558	NC_017044	AAG	2	6	21739	21744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483363
559	NC_017044	TTA	2	6	21756	21761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483363
560	NC_017044	GCT	2	6	21819	21824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483363
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562	NC_017044	TTA	2	6	21900	21905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483363
563	NC_017044	TGT	2	6	21911	21916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483363
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565	NC_017044	AAC	2	6	22009	22014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483363
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568	NC_017044	ATTA	2	8	22134	22141	50 %	50 %	0 %	0 %	383483363
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570	NC_017044	ATAG	2	8	22194	22201	50 %	25 %	25 %	0 %	383483363
571	NC_017044	A	6	6	22245	22250	100 %	0 %	0 %	0 %	383483363
572	NC_017044	TAT	2	6	22423	22428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483363
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581	NC_017044	ACA	2	6	22739	22744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483363
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603	NC_017044	CAA	2	6	23466	23471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483363
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610	NC_017044	TA	3	6	23626	23631	50 %	50 %	0 %	0 %	383483363
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