MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017044	ATT	2	6	238760	238765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483574
6003	NC_017044	TA	3	6	238772	238777	50 %	50 %	0 %	0 %	383483574
6004	NC_017044	GTA	2	6	238779	238784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483574
6005	NC_017044	AGCT	2	8	238892	238899	25 %	25 %	25 %	25 %	383483574
6006	NC_017044	CAAT	2	8	238914	238921	50 %	25 %	0 %	25 %	383483574
6007	NC_017044	T	7	7	239035	239041	0 %	100 %	0 %	0 %	383483574
6008	NC_017044	GTACGA	2	12	239067	239078	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383483574
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6010	NC_017044	TTC	2	6	239168	239173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483574
6011	NC_017044	ATT	2	6	239192	239197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483574
6012	NC_017044	GTTT	2	8	239251	239258	0 %	75 %	25 %	0 %	383483574
6013	NC_017044	CTA	2	6	239341	239346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483574
6014	NC_017044	TGG	2	6	239389	239394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383483574
6015	NC_017044	CTA	2	6	239475	239480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483574
6016	NC_017044	ATT	2	6	239519	239524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483574
6017	NC_017044	CCG	2	6	239544	239549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383483574
6018	NC_017044	AGC	2	6	239558	239563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483574
6019	NC_017044	AGC	2	6	239612	239617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483574
6020	NC_017044	TGC	2	6	239647	239652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483574
6021	NC_017044	TTGCT	2	10	239675	239684	0 %	60 %	20 %	20 %	383483574
6022	NC_017044	TCA	2	6	239826	239831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483574
6023	NC_017044	CTA	2	6	239884	239889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483574
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6027	NC_017044	CTTCTA	2	12	240064	240075	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383483574
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6030	NC_017044	TTA	2	6	240135	240140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483574
6031	NC_017044	TA	3	6	240139	240144	50 %	50 %	0 %	0 %	383483574
6032	NC_017044	T	6	6	240150	240155	0 %	100 %	0 %	0 %	383483574
6033	NC_017044	TCT	2	6	240285	240290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483574
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6035	NC_017044	AGA	2	6	240449	240454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483574
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6041	NC_017044	TAT	3	9	240529	240537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483574
6042	NC_017044	A	6	6	240551	240556	100 %	0 %	0 %	0 %	383483574
6043	NC_017044	TA	3	6	240604	240609	50 %	50 %	0 %	0 %	383483574
6044	NC_017044	CAA	2	6	240616	240621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383483574
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6046	NC_017044	TGT	2	6	240650	240655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483574
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6048	NC_017044	ATT	2	6	240674	240679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_017044	GTT	2	6	240694	240699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017044	TTC	2	6	240751	240756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_017044	TTA	2	6	240801	240806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_017044	TA	3	6	240834	240839	50 %	50 %	0 %	0 %	383483575
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6054	NC_017044	TAA	2	6	240879	240884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483575
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6056	NC_017044	ATT	2	6	240936	240941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483575
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6058	NC_017044	T	6	6	241002	241007	0 %	100 %	0 %	0 %	383483575
6059	NC_017044	TA	3	6	241292	241297	50 %	50 %	0 %	0 %	383483575
6060	NC_017044	TGC	2	6	241302	241307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483575
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6068	NC_017044	T	6	6	241761	241766	0 %	100 %	0 %	0 %	383483575
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6081	NC_017044	T	6	6	242359	242364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_017044	TTAA	2	8	242378	242385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6109	NC_017044	TTC	2	6	243229	243234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483576
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6113	NC_017044	CCTTG	2	10	243356	243365	0 %	40 %	20 %	40 %	383483576
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