MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 33207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017044	TTTC	2	8	198474	198481	0 %	75 %	0 %	25 %	383483530
5002	NC_017044	TTG	2	6	198508	198513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483530
5003	NC_017044	T	6	6	198529	198534	0 %	100 %	0 %	0 %	383483530
5004	NC_017044	ATT	2	6	198562	198567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483530
5005	NC_017044	TTA	2	6	198611	198616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483530
5006	NC_017044	AACC	2	8	198668	198675	50 %	0 %	0 %	50 %	383483530
5007	NC_017044	CTT	2	6	198738	198743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483530
5008	NC_017044	ATC	2	6	198793	198798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483530
5009	NC_017044	ATA	2	6	198824	198829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483530
5010	NC_017044	T	6	6	198830	198835	0 %	100 %	0 %	0 %	383483530
5011	NC_017044	TCA	2	6	198860	198865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483530
5012	NC_017044	T	6	6	198867	198872	0 %	100 %	0 %	0 %	383483530
5013	NC_017044	TCA	2	6	198899	198904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483530
5014	NC_017044	AGC	2	6	198976	198981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483530
5015	NC_017044	TTGA	2	8	199020	199027	25 %	50 %	25 %	0 %	383483530
5016	NC_017044	A	6	6	199058	199063	100 %	0 %	0 %	0 %	383483530
5017	NC_017044	AGC	2	6	199153	199158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483530
5018	NC_017044	T	6	6	199184	199189	0 %	100 %	0 %	0 %	383483530
5019	NC_017044	A	6	6	199264	199269	100 %	0 %	0 %	0 %	383483530
5020	NC_017044	GTT	2	6	199299	199304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483530
5021	NC_017044	CTT	2	6	199323	199328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483530
5022	NC_017044	TAA	2	6	199345	199350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483530
5023	NC_017044	T	6	6	199437	199442	0 %	100 %	0 %	0 %	383483530
5024	NC_017044	GCA	2	6	199448	199453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483530
5025	NC_017044	TAAAA	2	10	199474	199483	80 %	20 %	0 %	0 %	383483530
5026	NC_017044	CTG	2	6	199527	199532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483530
5027	NC_017044	T	6	6	199535	199540	0 %	100 %	0 %	0 %	383483530
5028	NC_017044	TAGCA	2	10	199585	199594	40 %	20 %	20 %	20 %	383483530
5029	NC_017044	T	6	6	199603	199608	0 %	100 %	0 %	0 %	383483530
5030	NC_017044	TTC	2	6	199630	199635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483530
5031	NC_017044	ATC	2	6	199666	199671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483530
5032	NC_017044	ATT	2	6	199733	199738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483530
5033	NC_017044	T	6	6	199775	199780	0 %	100 %	0 %	0 %	383483530
5034	NC_017044	ATT	2	6	199781	199786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483530
5035	NC_017044	AT	3	6	199841	199846	50 %	50 %	0 %	0 %	383483530
5036	NC_017044	CAG	2	6	199854	199859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383483530
5037	NC_017044	TAA	3	9	199978	199986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483530
5038	NC_017044	TTG	2	6	199990	199995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383483530
5039	NC_017044	GTT	2	6	200053	200058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017044	TCA	2	6	200075	200080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017044	T	7	7	200129	200135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017044	ATT	2	6	200136	200141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017044	T	6	6	200140	200145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017044	ATG	2	6	200178	200183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017044	CAA	2	6	200198	200203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_017044	CAA	2	6	200245	200250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_017044	A	6	6	200334	200339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017044	TCT	2	6	200391	200396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483531
5049	NC_017044	TAAAG	2	10	200448	200457	60 %	20 %	20 %	0 %	383483531
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5053	NC_017044	AAAG	2	8	200736	200743	75 %	0 %	25 %	0 %	383483531
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5056	NC_017044	TA	3	6	201008	201013	50 %	50 %	0 %	0 %	383483531
5057	NC_017044	TCA	2	6	201040	201045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483531
5058	NC_017044	T	6	6	201055	201060	0 %	100 %	0 %	0 %	383483531
5059	NC_017044	ATA	2	6	201123	201128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017044	T	6	6	201150	201155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017044	ATTA	2	8	201164	201171	50 %	50 %	0 %	0 %	383483532
5062	NC_017044	ATT	2	6	201290	201295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483532
5063	NC_017044	CCA	2	6	201341	201346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383483532
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5065	NC_017044	T	6	6	201418	201423	0 %	100 %	0 %	0 %	383483532
5066	NC_017044	AGCA	2	8	201439	201446	50 %	0 %	25 %	25 %	383483532
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5069	NC_017044	ATC	2	6	201514	201519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483532
5070	NC_017044	CTT	2	6	201534	201539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483532
5071	NC_017044	GCT	2	6	201608	201613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483532
5072	NC_017044	TAT	2	6	201672	201677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483532
5073	NC_017044	TAAT	3	12	201689	201700	50 %	50 %	0 %	0 %	383483532
5074	NC_017044	GAT	2	6	201730	201735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383483532
5075	NC_017044	ATC	2	6	201766	201771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483532
5076	NC_017044	ATT	2	6	201775	201780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483532
5077	NC_017044	TGC	2	6	201796	201801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483532
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5079	NC_017044	TAA	2	6	201907	201912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017044	AGTA	2	8	201919	201926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017044	TA	3	6	201979	201984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017044	TTA	2	6	202010	202015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017044	ACG	2	6	202017	202022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017044	ATTG	2	8	202063	202070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017044	T	6	6	202085	202090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017044	TAA	2	6	202100	202105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_017044	A	6	6	202158	202163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_017044	TATT	2	8	202235	202242	25 %	75 %	0 %	0 %	383483533
5092	NC_017044	AAG	2	6	202280	202285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483533
5093	NC_017044	TTA	2	6	202291	202296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483533
5094	NC_017044	TTA	2	6	202322	202327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483533
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5096	NC_017044	TTA	2	6	202375	202380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483533
5097	NC_017044	T	6	6	202454	202459	0 %	100 %	0 %	0 %	383483533
5098	NC_017044	TTA	2	6	202486	202491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483533
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5103	NC_017044	T	7	7	202682	202688	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
5104	NC_017044	ATTA	2	8	202715	202722	50 %	50 %	0 %	0 %	383483534
5105	NC_017044	TTC	2	6	202766	202771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483534
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5108	NC_017044	ATA	2	6	202836	202841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483534
5109	NC_017044	TTC	2	6	202865	202870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383483534
5110	NC_017044	T	8	8	202937	202944	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
5111	NC_017044	CTA	2	6	202969	202974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483534
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5113	NC_017044	TA	3	6	203020	203025	50 %	50 %	0 %	0 %	383483534
5114	NC_017044	ATT	2	6	203051	203056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483534
5115	NC_017044	AT	3	6	203067	203072	50 %	50 %	0 %	0 %	383483534
5116	NC_017044	T	6	6	203163	203168	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
5117	NC_017044	T	6	6	203177	203182	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
5118	NC_017044	ATA	2	6	203208	203213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383483534
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5121	NC_017044	AGG	2	6	203258	203263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383483534
5122	NC_017044	T	6	6	203293	203298	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
5123	NC_017044	T	8	8	203306	203313	0 %	100 %	0 %	0 %	383483534
5124	NC_017044	AAT	2	6	203366	203371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017044	TTG	2	6	203418	203423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017044	GTA	2	6	203459	203464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017044	GCT	2	6	203515	203520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_017044	CAA	2	6	203547	203552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_017044	GCT	2	6	203561	203566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5236	NC_017044	T	6	6	208374	208379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5237	NC_017044	ATT	2	6	208380	208385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5238	NC_017044	T	6	6	208384	208389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_017044	GCT	2	6	208412	208417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5240	NC_017044	CAA	2	6	208442	208447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5241	NC_017044	ACA	2	6	208477	208482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5242	NC_017044	AT	3	6	208495	208500	50 %	50 %	0 %	0 %	383483540
5243	NC_017044	ATTT	2	8	208589	208596	25 %	75 %	0 %	0 %	383483540
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5251	NC_017044	GCG	2	6	208866	208871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383483540
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5253	NC_017044	TA	3	6	208989	208994	50 %	50 %	0 %	0 %	383483540
5254	NC_017044	TGC	2	6	209025	209030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483540
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5319	NC_017044	TAAAA	2	10	211156	211165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5321	NC_017044	TTAA	2	8	211189	211196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5322	NC_017044	AGACA	2	10	211218	211227	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5323	NC_017044	AT	3	6	211230	211235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5324	NC_017044	TATTTA	2	12	211247	211258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5365	NC_017044	TTA	2	6	212760	212765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5366	NC_017044	TGT	2	6	212783	212788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5368	NC_017044	TC	4	8	212814	212821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5369	NC_017044	TAT	2	6	212863	212868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5370	NC_017044	T	6	6	212889	212894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5371	NC_017044	T	6	6	212943	212948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_017044	ATA	2	6	213005	213010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_017044	T	7	7	213032	213038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_017044	ATT	2	6	213087	213092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5375	NC_017044	AGA	2	6	213144	213149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5376	NC_017044	ATTAT	2	10	213235	213244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5377	NC_017044	GCGA	2	8	213283	213290	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5378	NC_017044	A	6	6	213319	213324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5379	NC_017044	TGC	2	6	213429	213434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383483546
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