MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 2789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017043	AT	3	6	2395	2400	50 %	50 %	0 %	0 %	383482126
2	NC_017043	GA	3	6	2682	2687	50 %	0 %	50 %	0 %	383482126
3	NC_017043	AG	3	6	2906	2911	50 %	0 %	50 %	0 %	383482126
4	NC_017043	AG	3	6	3739	3744	50 %	0 %	50 %	0 %	383482126
5	NC_017043	AG	3	6	3785	3790	50 %	0 %	50 %	0 %	383482126
6	NC_017043	AT	3	6	4495	4500	50 %	50 %	0 %	0 %	383482126
7	NC_017043	AT	3	6	5870	5875	50 %	50 %	0 %	0 %	383482128
8	NC_017043	AT	3	6	6556	6561	50 %	50 %	0 %	0 %	383482129
9	NC_017043	AT	5	10	6706	6715	50 %	50 %	0 %	0 %	383482129
10	NC_017043	TA	3	6	6841	6846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017043	AG	3	6	7207	7212	50 %	0 %	50 %	0 %	383482130
12	NC_017043	AT	3	6	8412	8417	50 %	50 %	0 %	0 %	383482130
13	NC_017043	TA	3	6	9131	9136	50 %	50 %	0 %	0 %	383482130
14	NC_017043	AT	3	6	9740	9745	50 %	50 %	0 %	0 %	383482132
15	NC_017043	TG	3	6	11014	11019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017043	AT	3	6	11341	11346	50 %	50 %	0 %	0 %	383482134
17	NC_017043	AT	4	8	11436	11443	50 %	50 %	0 %	0 %	383482135
18	NC_017043	AT	3	6	12063	12068	50 %	50 %	0 %	0 %	383482135
19	NC_017043	TA	3	6	12600	12605	50 %	50 %	0 %	0 %	383482136
20	NC_017043	TA	3	6	12610	12615	50 %	50 %	0 %	0 %	383482136
21	NC_017043	GT	3	6	13115	13120	0 %	50 %	50 %	0 %	383482137
22	NC_017043	AT	3	6	13441	13446	50 %	50 %	0 %	0 %	383482137
23	NC_017043	AT	4	8	13783	13790	50 %	50 %	0 %	0 %	383482137
24	NC_017043	AT	3	6	13827	13832	50 %	50 %	0 %	0 %	383482137
25	NC_017043	TC	3	6	14035	14040	0 %	50 %	0 %	50 %	383482137
26	NC_017043	TC	3	6	14695	14700	0 %	50 %	0 %	50 %	383482138
27	NC_017043	TA	3	6	14718	14723	50 %	50 %	0 %	0 %	383482138
28	NC_017043	GA	3	6	15374	15379	50 %	0 %	50 %	0 %	383482139
29	NC_017043	AT	3	6	15529	15534	50 %	50 %	0 %	0 %	383482139
30	NC_017043	TA	3	6	15852	15857	50 %	50 %	0 %	0 %	383482139
31	NC_017043	AG	3	6	16380	16385	50 %	0 %	50 %	0 %	383482140
32	NC_017043	GT	3	6	16681	16686	0 %	50 %	50 %	0 %	383482140
33	NC_017043	AT	3	6	16943	16948	50 %	50 %	0 %	0 %	383482140
34	NC_017043	TA	3	6	17024	17029	50 %	50 %	0 %	0 %	383482140
35	NC_017043	AG	3	6	17580	17585	50 %	0 %	50 %	0 %	383482141
36	NC_017043	TA	3	6	18422	18427	50 %	50 %	0 %	0 %	383482142
37	NC_017043	AC	3	6	19093	19098	50 %	0 %	0 %	50 %	383482143
38	NC_017043	AT	3	6	19404	19409	50 %	50 %	0 %	0 %	383482143
39	NC_017043	TG	3	6	19712	19717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017043	AT	3	6	21113	21118	50 %	50 %	0 %	0 %	383482145
41	NC_017043	TA	3	6	21349	21354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017043	TA	3	6	21447	21452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017043	TA	4	8	22604	22611	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
44	NC_017043	AT	3	6	23506	23511	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
45	NC_017043	AT	3	6	23778	23783	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
46	NC_017043	TA	3	6	23924	23929	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
47	NC_017043	AT	3	6	24070	24075	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
48	NC_017043	CT	3	6	24329	24334	0 %	50 %	0 %	50 %	383482148
49	NC_017043	AT	3	6	26797	26802	50 %	50 %	0 %	0 %	383482151
50	NC_017043	AT	3	6	27225	27230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017043	AT	3	6	27602	27607	50 %	50 %	0 %	0 %	383482152
52	NC_017043	AT	3	6	27637	27642	50 %	50 %	0 %	0 %	383482152
53	NC_017043	TA	3	6	27931	27936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017043	AT	3	6	28970	28975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017043	AT	3	6	29201	29206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017043	TA	3	6	29319	29324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017043	AT	3	6	29444	29449	50 %	50 %	0 %	0 %	383482154
58	NC_017043	TC	3	6	30959	30964	0 %	50 %	0 %	50 %	383482158
59	NC_017043	TA	3	6	31045	31050	50 %	50 %	0 %	0 %	383482158
60	NC_017043	AT	3	6	31389	31394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017043	AT	3	6	32504	32509	50 %	50 %	0 %	0 %	383482159
62	NC_017043	GT	3	6	34322	34327	0 %	50 %	50 %	0 %	383482160
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64	NC_017043	TA	3	6	34840	34845	50 %	50 %	0 %	0 %	383482162
65	NC_017043	AT	3	6	35141	35146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017043	TA	4	8	35733	35740	50 %	50 %	0 %	0 %	383482163
67	NC_017043	TA	4	8	36057	36064	50 %	50 %	0 %	0 %	383482163
68	NC_017043	AT	3	6	36217	36222	50 %	50 %	0 %	0 %	383482164
69	NC_017043	TG	3	6	37039	37044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017043	AT	3	6	38589	38594	50 %	50 %	0 %	0 %	383482167
71	NC_017043	TA	3	6	38626	38631	50 %	50 %	0 %	0 %	383482167
72	NC_017043	AT	3	6	38855	38860	50 %	50 %	0 %	0 %	383482167
73	NC_017043	TA	3	6	39480	39485	50 %	50 %	0 %	0 %	383482167
74	NC_017043	AT	3	6	39999	40004	50 %	50 %	0 %	0 %	383482167
75	NC_017043	AT	3	6	40446	40451	50 %	50 %	0 %	0 %	383482168
76	NC_017043	TA	3	6	40903	40908	50 %	50 %	0 %	0 %	383482169
77	NC_017043	TA	3	6	41011	41016	50 %	50 %	0 %	0 %	383482169
78	NC_017043	AT	3	6	41231	41236	50 %	50 %	0 %	0 %	383482169
79	NC_017043	TA	3	6	41269	41274	50 %	50 %	0 %	0 %	383482169
80	NC_017043	AT	3	6	42225	42230	50 %	50 %	0 %	0 %	383482170
81	NC_017043	TA	3	6	42296	42301	50 %	50 %	0 %	0 %	383482170
82	NC_017043	AT	3	6	42368	42373	50 %	50 %	0 %	0 %	383482170
83	NC_017043	AT	3	6	42573	42578	50 %	50 %	0 %	0 %	383482170
84	NC_017043	TA	3	6	43615	43620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017043	TA	4	8	43815	43822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017043	AG	3	6	44068	44073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017043	AG	4	8	44676	44683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017043	AG	3	6	45424	45429	50 %	0 %	50 %	0 %	383482171
89	NC_017043	AT	3	6	45781	45786	50 %	50 %	0 %	0 %	383482171
90	NC_017043	GA	3	6	47467	47472	50 %	0 %	50 %	0 %	383482173
91	NC_017043	CT	3	6	47537	47542	0 %	50 %	0 %	50 %	383482173
92	NC_017043	AT	3	6	47575	47580	50 %	50 %	0 %	0 %	383482173
93	NC_017043	AC	3	6	47624	47629	50 %	0 %	0 %	50 %	383482173
94	NC_017043	AT	3	6	47943	47948	50 %	50 %	0 %	0 %	383482173
95	NC_017043	TA	3	6	48896	48901	50 %	50 %	0 %	0 %	383482174
96	NC_017043	AT	3	6	49795	49800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017043	TA	3	6	52613	52618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017043	AT	4	8	52756	52763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017043	TA	3	6	53368	53373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017043	AG	3	6	53465	53470	50 %	0 %	50 %	0 %	383482177
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102	NC_017043	AT	3	6	53747	53752	50 %	50 %	0 %	0 %	383482177
103	NC_017043	AT	3	6	54031	54036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017043	TC	4	8	54160	54167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017043	AT	3	6	54364	54369	50 %	50 %	0 %	0 %	383482178
106	NC_017043	TA	3	6	54459	54464	50 %	50 %	0 %	0 %	383482178
107	NC_017043	AT	3	6	54545	54550	50 %	50 %	0 %	0 %	383482178
108	NC_017043	TG	3	6	54729	54734	0 %	50 %	50 %	0 %	383482179
109	NC_017043	CT	3	6	55417	55422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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111	NC_017043	AT	3	6	56229	56234	50 %	50 %	0 %	0 %	383482180
112	NC_017043	AT	3	6	56654	56659	50 %	50 %	0 %	0 %	383482181
113	NC_017043	CA	3	6	57848	57853	50 %	0 %	0 %	50 %	383482184
114	NC_017043	AT	3	6	58279	58284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017043	AT	3	6	58403	58408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017043	TA	3	6	58656	58661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017043	AG	3	6	58945	58950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017043	AT	3	6	59575	59580	50 %	50 %	0 %	0 %	383482185
119	NC_017043	AT	4	8	60547	60554	50 %	50 %	0 %	0 %	383482185
120	NC_017043	AT	3	6	61350	61355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017043	TA	3	6	61745	61750	50 %	50 %	0 %	0 %	383482186
122	NC_017043	AT	3	6	62833	62838	50 %	50 %	0 %	0 %	383482187
123	NC_017043	AT	3	6	63376	63381	50 %	50 %	0 %	0 %	383482188
124	NC_017043	TA	3	6	63757	63762	50 %	50 %	0 %	0 %	383482188
125	NC_017043	AT	3	6	64391	64396	50 %	50 %	0 %	0 %	383482188
126	NC_017043	TA	3	6	64757	64762	50 %	50 %	0 %	0 %	383482188
127	NC_017043	TA	4	8	64854	64861	50 %	50 %	0 %	0 %	383482188
128	NC_017043	AT	3	6	66144	66149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017043	AT	4	8	66378	66385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017043	TA	3	6	66749	66754	50 %	50 %	0 %	0 %	383482189
131	NC_017043	AT	3	6	66767	66772	50 %	50 %	0 %	0 %	383482189
132	NC_017043	AT	3	6	66796	66801	50 %	50 %	0 %	0 %	383482189
133	NC_017043	AT	3	6	67390	67395	50 %	50 %	0 %	0 %	383482190
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135	NC_017043	TA	3	6	68123	68128	50 %	50 %	0 %	0 %	383482192
136	NC_017043	TA	3	6	68433	68438	50 %	50 %	0 %	0 %	383482192
137	NC_017043	AT	3	6	68694	68699	50 %	50 %	0 %	0 %	383482192
138	NC_017043	AT	3	6	68735	68740	50 %	50 %	0 %	0 %	383482192
139	NC_017043	TA	3	6	68859	68864	50 %	50 %	0 %	0 %	383482192
140	NC_017043	AT	3	6	70157	70162	50 %	50 %	0 %	0 %	383482194
141	NC_017043	GA	3	6	70561	70566	50 %	0 %	50 %	0 %	383482194
142	NC_017043	TG	3	6	70841	70846	0 %	50 %	50 %	0 %	383482194
143	NC_017043	TA	3	6	71288	71293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017043	TC	3	6	72067	72072	0 %	50 %	0 %	50 %	383482195
145	NC_017043	AT	3	6	72091	72096	50 %	50 %	0 %	0 %	383482195
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