MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017043	CAAAAA	2	12	1187	1198	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017043	TCGGAT	2	12	1806	1817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383482125
3	NC_017043	AGGAAT	2	12	2797	2808	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383482126
4	NC_017043	TCCTAT	2	12	8121	8132	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383482130
5	NC_017043	CAAGCC	2	12	13039	13050	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383482137
6	NC_017043	AATATA	2	12	15228	15239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017043	TCCGAT	2	12	17052	17063	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383482140
8	NC_017043	TAGAAT	2	12	17468	17479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482141
9	NC_017043	AAAGTT	2	12	18134	18145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482142
10	NC_017043	TTTTGC	2	12	19431	19442	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383482143
11	NC_017043	ACTATA	2	12	21942	21953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482146
12	NC_017043	ATTACG	2	12	23484	23495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383482147
13	NC_017043	TTAAAT	2	12	23654	23665	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
14	NC_017043	ATGATA	2	12	28040	28051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482153
15	NC_017043	GCTTGT	2	12	29144	29155	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017043	AATCTT	2	12	31534	31545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383482159
17	NC_017043	TAGATA	2	12	33856	33867	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482160
18	NC_017043	ATGGTG	2	12	35770	35781	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383482163
19	NC_017043	TAAAAA	2	12	36262	36273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383482164
20	NC_017043	ACAAAA	2	12	38308	38319	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383482166
21	NC_017043	TGCAAA	2	12	39906	39917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383482167
22	NC_017043	ATAAAG	2	12	45894	45905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383482171
23	NC_017043	CCTGCT	2	12	46874	46885	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383482172
24	NC_017043	GTATAT	2	12	46970	46981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482172
25	NC_017043	ATTCAC	2	12	49423	49434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482174
26	NC_017043	TGAGGT	2	12	50607	50618	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017043	AGGTAT	2	12	50856	50867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017043	GATAAT	2	12	53793	53804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482177
29	NC_017043	AGCTTA	2	12	55582	55593	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383482180
30	NC_017043	CCTGCT	2	12	56116	56127	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383482180
31	NC_017043	GAACAG	2	12	57434	57445	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383482183
32	NC_017043	TCTAAA	2	12	65773	65784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482188
33	NC_017043	TCACCG	2	12	70411	70422	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383482194
34	NC_017043	ATGAAT	2	12	73523	73534	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482198
35	NC_017043	TCATTG	2	12	74077	74088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482198
36	NC_017043	TTTATC	2	12	74807	74818	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383482199
37	NC_017043	AAATAA	2	12	79691	79702	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383482202
38	NC_017043	AGGACA	2	12	81244	81255	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383482203
39	NC_017043	TAACAA	2	12	84189	84200	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017043	TTTAAT	2	12	84750	84761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482205
41	NC_017043	CTTTTT	2	12	85800	85811	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383482206
42	NC_017043	ATTTTA	2	12	86192	86203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482207
43	NC_017043	ATTTAA	2	12	87762	87773	50 %	50 %	0 %	0 %	383482209
44	NC_017043	AATTAT	2	12	88780	88791	50 %	50 %	0 %	0 %	383482212
45	NC_017043	AAATAT	2	12	89854	89865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482213
46	NC_017043	AATTTT	2	12	95277	95288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482216
47	NC_017043	GATATT	2	12	95298	95309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482216
48	NC_017043	AGATTT	2	12	95702	95713	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482216
49	NC_017043	CATATG	2	12	97935	97946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383482218
50	NC_017043	TAAAAC	2	12	101187	101198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482220
51	NC_017043	TAAATT	2	12	102236	102247	50 %	50 %	0 %	0 %	383482221
52	NC_017043	ATATAA	2	12	102509	102520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482222
53	NC_017043	CAATCT	2	12	103416	103427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017043	TTATAT	2	12	103678	103689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482224
55	NC_017043	TACTAA	2	12	104648	104659	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482227
56	NC_017043	CTATTA	2	12	104689	104700	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383482227
57	NC_017043	GATCTT	2	12	107266	107277	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482231
58	NC_017043	TCACCG	2	12	110357	110368	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383482239
59	NC_017043	GTAGCG	2	12	110903	110914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383482239
60	NC_017043	TTATCC	2	12	114413	114424	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383482242
61	NC_017043	TTAAAG	2	12	118248	118259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383482244
62	NC_017043	CGCAAA	2	12	118616	118627	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383482245
63	NC_017043	CTTCAA	2	12	120849	120860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017043	ATTTAA	2	12	120955	120966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017043	GGATAT	2	12	122894	122905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017043	GATCTT	2	12	125092	125103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482251
67	NC_017043	ATGATT	2	12	125708	125719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482251
68	NC_017043	AGAAAA	2	12	127810	127821	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383482255
69	NC_017043	AAACTA	2	12	128485	128496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482257
70	NC_017043	CCGGTA	2	12	129202	129213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482257
71	NC_017043	TCTTGA	2	12	138432	138443	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482263
72	NC_017043	TACCGG	2	12	139528	139539	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482263
73	NC_017043	ATCTTG	2	12	140994	141005	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017043	TTAATA	2	12	141837	141848	50 %	50 %	0 %	0 %	383482265
75	NC_017043	GTATTT	2	12	141967	141978	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383482265
76	NC_017043	TATCAA	2	12	147468	147479	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017043	TTGATT	2	12	148409	148420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383482269
78	NC_017043	TAAAAC	2	12	153370	153381	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482276
79	NC_017043	ATTTTA	2	12	157605	157616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017043	AATATA	2	12	161212	161223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017043	TTAGTA	2	12	162464	162475	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482287
82	NC_017043	TTTTAT	2	12	162756	162767	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383482287
83	NC_017043	AGTAAA	2	12	166492	166503	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383482292
84	NC_017043	GCTTAC	2	12	167772	167783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383482294
85	NC_017043	TGATGG	2	12	168841	168852	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017043	ATAAAG	2	12	170588	170599	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383482300
87	NC_017043	TACAAA	2	12	176353	176364	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017043	TAAAGA	2	12	184131	184142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383482313
89	NC_017043	CATCCT	2	12	185564	185575	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	383482316
90	NC_017043	TTTTTA	2	12	189461	189472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383482321
91	NC_017043	TATTTT	2	12	191130	191141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383482322
92	NC_017043	TAATTT	2	12	195057	195068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482325
93	NC_017043	CGGCAT	2	12	199741	199752	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482328
94	NC_017043	GCCGCA	2	12	201278	201289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383482331
95	NC_017043	TTAAAT	2	12	202448	202459	50 %	50 %	0 %	0 %	383482333
96	NC_017043	CTTCCC	2	12	203585	203596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482334
97	NC_017043	ATACCG	2	12	206540	206551	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017043	TTATAT	2	12	207011	207022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017043	TGCTAC	2	12	211822	211833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383482343
100	NC_017043	TATTGT	2	12	212546	212557	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383482343
101	NC_017043	TAAAGC	2	12	216855	216866	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383482346
102	NC_017043	ATTTAA	2	12	218748	218759	50 %	50 %	0 %	0 %	383482347
103	NC_017043	GATTAT	2	12	223959	223970	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482351
104	NC_017043	ATGCCG	2	12	224944	224955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482351
105	NC_017043	CGGTAG	2	12	226668	226679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383482352
106	NC_017043	ATTGAT	2	12	226726	226737	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482352
107	NC_017043	TAGCAG	2	12	228464	228475	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383482353
108	NC_017043	CTTTTT	2	12	233123	233134	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383482359
109	NC_017043	TCAATA	2	12	233890	233901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482359
110	NC_017043	AAAGGA	2	12	238314	238325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482363
111	NC_017043	TTTTTC	2	12	238577	238588	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383482364
112	NC_017043	CGGTTA	2	12	242698	242709	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383482369
113	NC_017043	CATTTA	2	12	245149	245160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017043	ATAATT	2	12	249550	249561	50 %	50 %	0 %	0 %	383482379
115	NC_017043	AAATTT	2	12	250149	250160	50 %	50 %	0 %	0 %	383482379
116	NC_017043	ATAAAC	2	12	250954	250965	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482379
117	NC_017043	AGCGAT	2	12	251353	251364	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383482379
118	NC_017043	TAAACA	2	12	252012	252023	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383482379
119	NC_017043	TAAATC	2	12	256531	256542	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017043	ATTCCT	2	12	261883	261894	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383482387
121	NC_017043	AAATTA	2	12	262501	262512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482387
122	NC_017043	TATTTT	2	12	268885	268896	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017043	CAAAGC	2	12	269184	269195	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383482392
124	NC_017043	GCCGTA	2	12	269572	269583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482392
125	NC_017043	ATCTTC	2	12	273436	273447	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383482396
126	NC_017043	ATTAAT	2	12	274137	274148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017043	TAAGCG	2	12	274879	274890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383482399
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132	NC_017043	GCAAAG	2	12	297656	297667	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383482419
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137	NC_017043	TGAACA	2	12	304882	304893	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383482427
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139	NC_017043	CTAAAC	2	12	307819	307830	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017043	TTGATA	2	12	310141	310152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482430
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143	NC_017043	TTTATC	2	12	315265	315276	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383482435
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154	NC_017043	ATTTTA	2	12	347255	347266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482465
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161	NC_017043	ATTAAT	2	12	362617	362628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_017043	ATCTGT	2	12	515112	515123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482629
231	NC_017043	ATTTAA	2	12	523258	523269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_017043	AAACGC	2	12	527665	527676	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383482644
233	NC_017043	TCTTGC	2	12	530442	530453	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383482644
234	NC_017043	ATAAAT	2	12	531796	531807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482645
235	NC_017043	ATTTAG	2	12	533320	533331	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482646
236	NC_017043	AGCTTA	2	12	533999	534010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
237	NC_017043	AGTTTA	2	12	534102	534113	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383482647
238	NC_017043	TAAAGA	2	12	536854	536865	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383482652
239	NC_017043	GGACTT	2	12	538410	538421	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383482655
240	NC_017043	ACCACT	2	12	541365	541376	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383482656
241	NC_017043	GAAAAA	2	12	541971	541982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383482657
242	NC_017043	GGAAAA	2	12	542105	542116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482657
243	NC_017043	CATAAG	2	12	547494	547505	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383482663
244	NC_017043	ACCTAA	2	12	549543	549554	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383482665
245	NC_017043	TGTTCT	2	12	551171	551182	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383482667
246	NC_017043	AACACC	2	12	552227	552238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
247	NC_017043	ACGGAT	2	12	553367	553378	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383482671
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270	NC_017043	CCGGTA	2	12	612877	612888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_017043	ATTTAA	2	12	631582	631593	50 %	50 %	0 %	0 %	383482726
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341	NC_017043	AGAAAA	2	12	746599	746610	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_017043	AAAGCT	2	12	763696	763707	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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352	NC_017043	TTTTTA	2	12	766654	766665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383482865
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355	NC_017043	AGTATT	2	12	771248	771259	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
356	NC_017043	ATTGCT	2	12	775755	775766	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482872
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474	NC_017043	AGAGCT	2	12	1034462	1034473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383483100
475	NC_017043	TCTGCC	2	12	1034823	1034834	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383483100
476	NC_017043	CAAGAT	2	12	1035736	1035747	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383483101
477	NC_017043	TTAATA	2	12	1035791	1035802	50 %	50 %	0 %	0 %	383483101
478	NC_017043	CGGTAT	2	12	1036788	1036799	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383483101
479	NC_017043	AGGAAA	2	12	1040474	1040485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383483106
480	NC_017043	TAACTC	2	12	1042964	1042975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383483110
481	NC_017043	ACCGCT	2	12	1044648	1044659	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383483111
482	NC_017043	AAGTTT	2	12	1045911	1045922	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383483113
483	NC_017043	TTAGAT	2	12	1048478	1048489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383483116
484	NC_017043	CAGAAA	2	12	1049638	1049649	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
485	NC_017043	AAGAAT	2	12	1058239	1058250	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383483128
486	NC_017043	TAGCTG	2	12	1059150	1059161	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383483130
487	NC_017043	GATAAA	2	12	1059950	1059961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383483130
488	NC_017043	AATATT	2	12	1060943	1060954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_017043	AATTTA	2	12	1061862	1061873	50 %	50 %	0 %	0 %	383483132
490	NC_017043	TTAATT	2	12	1062125	1062136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383483132
491	NC_017043	AGTTTA	2	12	1065420	1065431	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383483134
492	NC_017043	TTATCG	2	12	1070226	1070237	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383483138
493	NC_017043	CACGCT	2	12	1073401	1073412	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383483140
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498	NC_017043	TTTCAT	2	12	1094223	1094234	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383483167
499	NC_017043	GTAATA	2	12	1094827	1094838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383483167
500	NC_017043	ATTCTC	2	12	1097076	1097087	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383483169

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