MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 32535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017043	TAAA	2	8	137504	137511	75 %	25 %	0 %	0 %	383482263
3502	NC_017043	ATA	2	6	137570	137575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482263
3503	NC_017043	CAT	2	6	137597	137602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482263
3504	NC_017043	ATT	2	6	137618	137623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482263
3505	NC_017043	T	7	7	137644	137650	0 %	100 %	0 %	0 %	383482263
3506	NC_017043	TAA	2	6	137666	137671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482263
3507	NC_017043	T	7	7	137675	137681	0 %	100 %	0 %	0 %	383482263
3508	NC_017043	TAT	2	6	137686	137691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482263
3509	NC_017043	CGT	2	6	137696	137701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482263
3510	NC_017043	TTC	2	6	137732	137737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482263
3511	NC_017043	CT	3	6	137740	137745	0 %	50 %	0 %	50 %	383482263
3512	NC_017043	TTG	2	6	137774	137779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482263
3513	NC_017043	TATCT	2	10	137816	137825	20 %	60 %	0 %	20 %	383482263
3514	NC_017043	TAA	2	6	137828	137833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482263
3515	NC_017043	ACCA	2	8	137852	137859	50 %	0 %	0 %	50 %	383482263
3516	NC_017043	T	7	7	137898	137904	0 %	100 %	0 %	0 %	383482263
3517	NC_017043	TAAA	2	8	137920	137927	75 %	25 %	0 %	0 %	383482263
3518	NC_017043	TCC	2	6	137930	137935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482263
3519	NC_017043	ACT	2	6	138026	138031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482263
3520	NC_017043	TTC	2	6	138074	138079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482263
3521	NC_017043	TTA	2	6	138123	138128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482263
3522	NC_017043	ATA	2	6	138159	138164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482263
3523	NC_017043	TTG	2	6	138187	138192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482263
3524	NC_017043	TTA	2	6	138201	138206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482263
3525	NC_017043	AAG	2	6	138223	138228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482263
3526	NC_017043	CTT	2	6	138241	138246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482263
3527	NC_017043	CTT	2	6	138282	138287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482263
3528	NC_017043	GAT	2	6	138309	138314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482263
3529	NC_017043	TCT	2	6	138372	138377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482263
3530	NC_017043	TCTTGA	2	12	138432	138443	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383482263
3531	NC_017043	CTA	2	6	138448	138453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482263
3532	NC_017043	TTC	2	6	138455	138460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482263
3533	NC_017043	TAT	2	6	138490	138495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482263
3534	NC_017043	TAT	2	6	138547	138552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482263
3535	NC_017043	TTTC	2	8	138721	138728	0 %	75 %	0 %	25 %	383482263
3536	NC_017043	TTAC	2	8	138759	138766	25 %	50 %	0 %	25 %	383482263
3537	NC_017043	GAT	2	6	138867	138872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482263
3538	NC_017043	GTAA	2	8	138897	138904	50 %	25 %	25 %	0 %	383482263
3539	NC_017043	ATT	2	6	138972	138977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482263
3540	NC_017043	ATTA	2	8	139016	139023	50 %	50 %	0 %	0 %	383482263
3541	NC_017043	TTC	2	6	139037	139042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482263
3542	NC_017043	CAT	2	6	139066	139071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482263
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3544	NC_017043	TCT	2	6	139154	139159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482263
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3546	NC_017043	TC	3	6	139238	139243	0 %	50 %	0 %	50 %	383482263
3547	NC_017043	CCAG	2	8	139248	139255	25 %	0 %	25 %	50 %	383482263
3548	NC_017043	AAT	2	6	139300	139305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482263
3549	NC_017043	TACC	2	8	139312	139319	25 %	25 %	0 %	50 %	383482263
3550	NC_017043	CTA	3	9	139333	139341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482263
3551	NC_017043	TA	3	6	139375	139380	50 %	50 %	0 %	0 %	383482263
3552	NC_017043	TAAA	2	8	139384	139391	75 %	25 %	0 %	0 %	383482263
3553	NC_017043	TGC	2	6	139442	139447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482263
3554	NC_017043	TACCGG	2	12	139528	139539	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383482263
3555	NC_017043	ATT	2	6	139568	139573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482263
3556	NC_017043	TAA	2	6	139648	139653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482263
3557	NC_017043	TAT	2	6	139654	139659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482263
3558	NC_017043	TTC	2	6	139709	139714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482263
3559	NC_017043	TAG	2	6	139729	139734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482263
3560	NC_017043	TA	3	6	139765	139770	50 %	50 %	0 %	0 %	383482263
3561	NC_017043	TTA	2	6	139804	139809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482263
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3563	NC_017043	TGA	2	6	139881	139886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482263
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3565	NC_017043	TAA	2	6	139921	139926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482263
3566	NC_017043	ATTTT	2	10	139950	139959	20 %	80 %	0 %	0 %	383482263
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3569	NC_017043	TGC	2	6	140007	140012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482263
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3571	NC_017043	CT	3	6	140089	140094	0 %	50 %	0 %	50 %	383482263
3572	NC_017043	TAT	2	6	140099	140104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482263
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3574	NC_017043	AATG	2	8	140120	140127	50 %	25 %	25 %	0 %	383482263
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3577	NC_017043	GTA	2	6	140211	140216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482263
3578	NC_017043	CAT	2	6	140248	140253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482263
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3586	NC_017043	TTCA	2	8	140429	140436	25 %	50 %	0 %	25 %	383482263
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3589	NC_017043	TC	3	6	140540	140545	0 %	50 %	0 %	50 %	383482263
3590	NC_017043	TAA	2	6	140551	140556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482263
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3593	NC_017043	ATT	2	6	140658	140663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_017043	CATTA	2	10	140673	140682	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3595	NC_017043	TCA	2	6	140696	140701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_017043	ATA	2	6	140728	140733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_017043	TA	3	6	140746	140751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_017043	TAA	2	6	140866	140871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017043	TTG	2	6	140918	140923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_017043	ATCTTG	2	12	140994	141005	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3601	NC_017043	T	6	6	141012	141017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017043	A	7	7	141080	141086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017043	TGA	2	6	141140	141145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017043	ATG	2	6	141149	141154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017043	A	6	6	141166	141171	100 %	0 %	0 %	0 %	383482264
3606	NC_017043	CTAT	2	8	141178	141185	25 %	50 %	0 %	25 %	383482264
3607	NC_017043	A	9	9	141223	141231	100 %	0 %	0 %	0 %	383482264
3608	NC_017043	ATT	2	6	141237	141242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482264
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3610	NC_017043	AAGA	2	8	141268	141275	75 %	0 %	25 %	0 %	383482264
3611	NC_017043	TCG	2	6	141287	141292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482264
3612	NC_017043	CGG	2	6	141305	141310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482264
3613	NC_017043	GTT	2	6	141315	141320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482264
3614	NC_017043	TGA	2	6	141332	141337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482264
3615	NC_017043	AAT	2	6	141456	141461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482264
3616	NC_017043	AAAT	2	8	141525	141532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017043	TA	3	6	141545	141550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017043	TTAT	2	8	141554	141561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017043	ACAA	2	8	141581	141588	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_017043	ATG	2	6	141743	141748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482265
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3622	NC_017043	TTAATA	2	12	141837	141848	50 %	50 %	0 %	0 %	383482265
3623	NC_017043	AG	3	6	141872	141877	50 %	0 %	50 %	0 %	383482265
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