MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 32535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017043	ATT	2	6	118548	118553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482245
3002	NC_017043	CGCAAA	2	12	118616	118627	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383482245
3003	NC_017043	TTA	2	6	118660	118665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482245
3004	NC_017043	ATTT	2	8	118680	118687	25 %	75 %	0 %	0 %	383482245
3005	NC_017043	ATA	2	6	118742	118747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017043	ATA	3	9	118764	118772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482246
3007	NC_017043	T	6	6	118773	118778	0 %	100 %	0 %	0 %	383482246
3008	NC_017043	A	7	7	118814	118820	100 %	0 %	0 %	0 %	383482246
3009	NC_017043	TAT	2	6	118821	118826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482246
3010	NC_017043	TA	3	6	118873	118878	50 %	50 %	0 %	0 %	383482246
3011	NC_017043	T	7	7	118912	118918	0 %	100 %	0 %	0 %	383482246
3012	NC_017043	ATTA	2	8	118929	118936	50 %	50 %	0 %	0 %	383482246
3013	NC_017043	CAA	2	6	118955	118960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_017043	AAGA	2	8	118982	118989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017043	TTG	2	6	119001	119006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017043	A	6	6	119034	119039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017043	CAT	2	6	119040	119045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_017043	AAT	2	6	119047	119052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482247
3019	NC_017043	AT	3	6	119054	119059	50 %	50 %	0 %	0 %	383482247
3020	NC_017043	GAA	2	6	119105	119110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482247
3021	NC_017043	ATT	2	6	119121	119126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482247
3022	NC_017043	A	6	6	119137	119142	100 %	0 %	0 %	0 %	383482247
3023	NC_017043	GAA	2	6	119231	119236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482247
3024	NC_017043	TAGGG	2	10	119262	119271	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017043	TAA	2	6	119272	119277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017043	TAA	2	6	119301	119306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017043	A	6	6	119405	119410	100 %	0 %	0 %	0 %	383482248
3028	NC_017043	AGT	2	6	119427	119432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482248
3029	NC_017043	ACT	2	6	119503	119508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482248
3030	NC_017043	TAGA	2	8	119532	119539	50 %	25 %	25 %	0 %	383482248
3031	NC_017043	TGCT	2	8	119542	119549	0 %	50 %	25 %	25 %	383482249
3032	NC_017043	ATT	2	6	119550	119555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482249
3033	NC_017043	GAC	2	6	119606	119611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482249
3034	NC_017043	ACT	2	6	119639	119644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482249
3035	NC_017043	AAT	2	6	119684	119689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482249
3036	NC_017043	ATAA	2	8	119715	119722	75 %	25 %	0 %	0 %	383482249
3037	NC_017043	AG	3	6	119750	119755	50 %	0 %	50 %	0 %	383482249
3038	NC_017043	TAA	2	6	119792	119797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482249
3039	NC_017043	TTA	2	6	119854	119859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482249
3040	NC_017043	CAA	2	6	119923	119928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482249
3041	NC_017043	AAAT	2	8	119938	119945	75 %	25 %	0 %	0 %	383482249
3042	NC_017043	TAA	2	6	119984	119989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482249
3043	NC_017043	AAAT	2	8	120008	120015	75 %	25 %	0 %	0 %	383482249
3044	NC_017043	TAA	2	6	120052	120057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482249
3045	NC_017043	CAA	2	6	120124	120129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482249
3046	NC_017043	A	6	6	120144	120149	100 %	0 %	0 %	0 %	383482249
3047	NC_017043	TGA	2	6	120160	120165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482249
3048	NC_017043	AAC	2	6	120180	120185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482249
3049	NC_017043	TTA	2	6	120274	120279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482249
3050	NC_017043	TTA	2	6	120325	120330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017043	TTAA	2	8	120334	120341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017043	ATGC	2	8	120383	120390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3053	NC_017043	TATT	2	8	120392	120399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017043	TATT	2	8	120406	120413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017043	A	6	6	120419	120424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017043	CAG	2	6	120436	120441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017043	CA	3	6	120469	120474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_017043	ATA	2	6	120480	120485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017043	A	6	6	120497	120502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017043	GAAT	2	8	120522	120529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017043	A	6	6	120536	120541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017043	CAA	2	6	120577	120582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017043	ACA	2	6	120609	120614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_017043	A	7	7	120614	120620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017043	AAG	2	6	120718	120723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017043	TAAA	2	8	120808	120815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017043	CTTCAA	2	12	120849	120860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_017043	GAT	2	6	120863	120868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017043	ATT	2	6	120920	120925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017043	AT	3	6	120931	120936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017043	ATTTAA	2	12	120955	120966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017043	ATT	2	6	121062	121067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017043	ATT	2	6	121093	121098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017043	TTAA	2	8	121128	121135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017043	TAA	3	9	121133	121141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017043	GCA	2	6	121173	121178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_017043	GAT	2	6	121197	121202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017043	GTT	2	6	121248	121253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017043	TAT	2	6	121254	121259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017043	ATAG	2	8	121305	121312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017043	GAA	2	6	121326	121331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017043	AT	3	6	121335	121340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017043	CTAT	2	8	121351	121358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_017043	A	6	6	121376	121381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017043	TAAA	2	8	121396	121403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017043	ATA	2	6	121453	121458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017043	TTACC	2	10	121500	121509	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3088	NC_017043	GA	3	6	121566	121571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017043	CA	3	6	121579	121584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_017043	AAT	2	6	121647	121652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017043	ATT	2	6	121668	121673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017043	AAC	2	6	121687	121692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_017043	TTAT	2	8	121700	121707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017043	AGC	2	6	121731	121736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_017043	A	7	7	121779	121785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017043	GAA	2	6	121786	121791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017043	AGA	2	6	121833	121838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017043	AGA	2	6	121899	121904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017043	GAA	2	6	121918	121923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017043	TGC	2	6	121944	121949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_017043	TAA	2	6	121956	121961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017043	ATAA	2	8	121966	121973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017043	TAAG	2	8	121997	122004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017043	AAG	2	6	122012	122017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017043	ATT	2	6	122070	122075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017043	ATG	2	6	122084	122089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017043	A	7	7	122091	122097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017043	TAT	2	6	122106	122111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017043	A	7	7	122118	122124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017043	AT	3	6	122135	122140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017043	TAT	2	6	122255	122260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017043	TGA	2	6	122261	122266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017043	A	6	6	122266	122271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017043	AAAG	2	8	122280	122287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017043	AAT	2	6	122334	122339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017043	CAT	2	6	122341	122346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_017043	TTA	2	6	122458	122463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017043	ACCA	2	8	122482	122489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_017043	AAG	2	6	122492	122497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017043	TATT	2	8	122504	122511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017043	TATC	2	8	122573	122580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_017043	TGC	2	6	122631	122636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_017043	GTGA	2	8	122683	122690	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017043	T	6	6	122806	122811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017043	TAC	2	6	122814	122819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_017043	TAG	2	6	122839	122844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017043	AAT	2	6	122851	122856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017043	A	6	6	122869	122874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_017043	GGATAT	2	12	122894	122905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017043	AAT	2	6	122983	122988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017043	ATT	2	6	122993	122998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017043	GTT	2	6	123000	123005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017043	TAA	2	6	123019	123024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017043	TAC	2	6	123078	123083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_017043	AT	4	8	123092	123099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_017043	GGTA	2	8	123114	123121	25 %	25 %	50 %	0 %	383482250
3137	NC_017043	AT	4	8	123197	123204	50 %	50 %	0 %	0 %	383482250
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3165	NC_017043	AGG	2	6	124304	124309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3166	NC_017043	AT	3	6	124314	124319	50 %	50 %	0 %	0 %	383482251
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3245	NC_017043	ATTA	2	8	127228	127235	50 %	50 %	0 %	0 %	383482254
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