MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 32535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017043	CTC	2	6	20566	20571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482144
502	NC_017043	AAT	2	6	20629	20634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482144
503	NC_017043	T	6	6	20744	20749	0 %	100 %	0 %	0 %	383482144
504	NC_017043	CTT	3	9	20752	20760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482144
505	NC_017043	AAC	2	6	20768	20773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482144
506	NC_017043	CCG	2	6	20799	20804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383482144
507	NC_017043	AAC	2	6	20882	20887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482144
508	NC_017043	ATTT	2	8	20965	20972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017043	TTA	2	6	21047	21052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482145
510	NC_017043	AAT	2	6	21076	21081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482145
511	NC_017043	AT	3	6	21113	21118	50 %	50 %	0 %	0 %	383482145
512	NC_017043	CAG	2	6	21123	21128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482145
513	NC_017043	ATT	2	6	21134	21139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482145
514	NC_017043	ATTA	2	8	21181	21188	50 %	50 %	0 %	0 %	383482145
515	NC_017043	ATTT	2	8	21216	21223	25 %	75 %	0 %	0 %	383482145
516	NC_017043	ATG	2	6	21258	21263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017043	TTA	2	6	21271	21276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017043	T	6	6	21286	21291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017043	GCT	2	6	21304	21309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017043	TCA	2	6	21322	21327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017043	TA	3	6	21349	21354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017043	ACT	3	9	21386	21394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017043	ATA	2	6	21410	21415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017043	TA	3	6	21447	21452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017043	TAT	2	6	21463	21468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017043	TAA	2	6	21530	21535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017043	TGA	2	6	21538	21543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017043	AAT	2	6	21567	21572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017043	AGC	2	6	21587	21592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017043	T	7	7	21604	21610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017043	TAAA	2	8	21655	21662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017043	A	7	7	21660	21666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017043	ATG	2	6	21672	21677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017043	TAA	2	6	21716	21721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017043	T	8	8	21761	21768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017043	TTA	3	9	21829	21837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482146
537	NC_017043	AAC	2	6	21848	21853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482146
538	NC_017043	ACA	2	6	21930	21935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482146
539	NC_017043	ACTATA	2	12	21942	21953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383482146
540	NC_017043	ATT	2	6	22038	22043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017043	ACTT	2	8	22048	22055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_017043	A	6	6	22103	22108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017043	A	6	6	22113	22118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017043	ATT	2	6	22126	22131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017043	TCT	2	6	22195	22200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482147
546	NC_017043	T	6	6	22226	22231	0 %	100 %	0 %	0 %	383482147
547	NC_017043	T	6	6	22250	22255	0 %	100 %	0 %	0 %	383482147
548	NC_017043	TGCTT	2	10	22429	22438	0 %	60 %	20 %	20 %	383482147
549	NC_017043	CTGC	2	8	22466	22473	0 %	25 %	25 %	50 %	383482147
550	NC_017043	TAAA	2	8	22505	22512	75 %	25 %	0 %	0 %	383482147
551	NC_017043	CAA	2	6	22529	22534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482147
552	NC_017043	TCT	2	6	22570	22575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482147
553	NC_017043	TA	4	8	22604	22611	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
554	NC_017043	TAA	2	6	22656	22661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482147
555	NC_017043	GCAA	2	8	22689	22696	50 %	0 %	25 %	25 %	383482147
556	NC_017043	ATA	2	6	22756	22761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482147
557	NC_017043	TAT	2	6	22784	22789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482147
558	NC_017043	ACC	2	6	22980	22985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482147
559	NC_017043	TAT	2	6	23024	23029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482147
560	NC_017043	CAT	2	6	23045	23050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482147
561	NC_017043	CTAA	2	8	23068	23075	50 %	25 %	0 %	25 %	383482147
562	NC_017043	ATC	2	6	23110	23115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482147
563	NC_017043	TAAA	2	8	23153	23160	75 %	25 %	0 %	0 %	383482147
564	NC_017043	T	6	6	23169	23174	0 %	100 %	0 %	0 %	383482147
565	NC_017043	CTA	2	6	23257	23262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482147
566	NC_017043	TAA	2	6	23264	23269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482147
567	NC_017043	ATC	2	6	23307	23312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482147
568	NC_017043	TTC	2	6	23439	23444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482147
569	NC_017043	ATTACG	2	12	23484	23495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383482147
570	NC_017043	AT	3	6	23506	23511	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
571	NC_017043	ATA	2	6	23610	23615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482147
572	NC_017043	TTAAAT	2	12	23654	23665	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
573	NC_017043	AT	3	6	23778	23783	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
574	NC_017043	CTT	2	6	23799	23804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482147
575	NC_017043	AGTA	2	8	23847	23854	50 %	25 %	25 %	0 %	383482147
576	NC_017043	TCA	2	6	23902	23907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482147
577	NC_017043	TA	3	6	23924	23929	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
578	NC_017043	TAT	3	9	23939	23947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482147
579	NC_017043	ATC	2	6	24012	24017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482147
580	NC_017043	AT	3	6	24070	24075	50 %	50 %	0 %	0 %	383482147
581	NC_017043	CGT	2	6	24080	24085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482147
582	NC_017043	ATT	2	6	24139	24144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482147
583	NC_017043	TTA	3	9	24194	24202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482147
584	NC_017043	CT	3	6	24329	24334	0 %	50 %	0 %	50 %	383482148
585	NC_017043	CTT	2	6	24359	24364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482148
586	NC_017043	TTC	2	6	24393	24398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482148
587	NC_017043	TAA	2	6	24449	24454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482148
588	NC_017043	TTA	2	6	24460	24465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482148
589	NC_017043	A	7	7	24513	24519	100 %	0 %	0 %	0 %	383482148
590	NC_017043	T	6	6	24539	24544	0 %	100 %	0 %	0 %	383482148
591	NC_017043	TTC	2	6	24549	24554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482148
592	NC_017043	TATC	2	8	24566	24573	25 %	50 %	0 %	25 %	383482148
593	NC_017043	T	6	6	24597	24602	0 %	100 %	0 %	0 %	383482148
594	NC_017043	AGC	2	6	24606	24611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482148
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596	NC_017043	TTCCA	2	10	24693	24702	20 %	40 %	0 %	40 %	383482148
597	NC_017043	TAT	2	6	24719	24724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482148
598	NC_017043	TAT	2	6	24732	24737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482148
599	NC_017043	T	7	7	24775	24781	0 %	100 %	0 %	0 %	383482148
600	NC_017043	CTT	2	6	24782	24787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482148
601	NC_017043	ACTGT	2	10	24799	24808	20 %	40 %	20 %	20 %	383482148
602	NC_017043	TAA	2	6	24821	24826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482148
603	NC_017043	TAAT	2	8	24890	24897	50 %	50 %	0 %	0 %	383482148
604	NC_017043	TTG	2	6	24898	24903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482148
605	NC_017043	TAA	2	6	24933	24938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482148
606	NC_017043	TAT	2	6	24942	24947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482148
607	NC_017043	GAG	2	6	24950	24955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383482148
608	NC_017043	TATT	2	8	24964	24971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017043	TTA	2	6	24973	24978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017043	ATT	2	6	24983	24988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017043	A	7	7	25004	25010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017043	TAA	2	6	25029	25034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017043	ATTT	2	8	25043	25050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017043	A	7	7	25075	25081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017043	ATT	2	6	25098	25103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017043	ATG	2	6	25124	25129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017043	ATT	2	6	25140	25145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017043	TGT	2	6	25187	25192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017043	ATT	2	6	25233	25238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017043	CTAT	3	12	25270	25281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_017043	ATG	2	6	25328	25333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017043	TAG	2	6	25339	25344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017043	A	6	6	25398	25403	100 %	0 %	0 %	0 %	383482149
624	NC_017043	TTTA	2	8	25482	25489	25 %	75 %	0 %	0 %	383482149
625	NC_017043	ATT	2	6	25516	25521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482149
626	NC_017043	CCA	2	6	25542	25547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482149
627	NC_017043	ATTA	2	8	25560	25567	50 %	50 %	0 %	0 %	383482149
628	NC_017043	TAA	2	6	25568	25573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482149
629	NC_017043	TAA	2	6	25607	25612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482149
630	NC_017043	ATAA	2	8	25617	25624	75 %	25 %	0 %	0 %	383482149
631	NC_017043	TAA	2	6	25658	25663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482149
632	NC_017043	A	6	6	25662	25667	100 %	0 %	0 %	0 %	383482149
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634	NC_017043	ATT	2	6	25702	25707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482149
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