MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 32535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017043	TTCT	2	8	213466	213473	0 %	75 %	0 %	25 %	383482344
5502	NC_017043	AGA	2	6	213484	213489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482344
5503	NC_017043	TTTC	2	8	213500	213507	0 %	75 %	0 %	25 %	383482344
5504	NC_017043	TTA	2	6	213543	213548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482344
5505	NC_017043	T	6	6	213553	213558	0 %	100 %	0 %	0 %	383482344
5506	NC_017043	TAG	2	6	213603	213608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482344
5507	NC_017043	TCC	2	6	213637	213642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482344
5508	NC_017043	T	7	7	213643	213649	0 %	100 %	0 %	0 %	383482344
5509	NC_017043	TTC	2	6	213652	213657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482344
5510	NC_017043	TCT	2	6	213669	213674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482344
5511	NC_017043	AAT	2	6	213678	213683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482344
5512	NC_017043	TAA	2	6	213731	213736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482344
5513	NC_017043	T	6	6	213748	213753	0 %	100 %	0 %	0 %	383482344
5514	NC_017043	T	7	7	213810	213816	0 %	100 %	0 %	0 %	383482344
5515	NC_017043	TTC	2	6	213844	213849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482344
5516	NC_017043	TAT	2	6	213873	213878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482344
5517	NC_017043	TCA	2	6	213947	213952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482344
5518	NC_017043	T	6	6	214022	214027	0 %	100 %	0 %	0 %	383482344
5519	NC_017043	AT	4	8	214105	214112	50 %	50 %	0 %	0 %	383482344
5520	NC_017043	T	7	7	214178	214184	0 %	100 %	0 %	0 %	383482344
5521	NC_017043	ATA	2	6	214250	214255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482344
5522	NC_017043	ATTT	2	8	214311	214318	25 %	75 %	0 %	0 %	383482344
5523	NC_017043	CCG	2	6	214343	214348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383482344
5524	NC_017043	CATA	2	8	214407	214414	50 %	25 %	0 %	25 %	383482344
5525	NC_017043	CTA	2	6	214418	214423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482344
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5527	NC_017043	AT	3	6	214450	214455	50 %	50 %	0 %	0 %	383482344
5528	NC_017043	ATC	2	6	214486	214491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482344
5529	NC_017043	AATTA	2	10	214498	214507	60 %	40 %	0 %	0 %	383482344
5530	NC_017043	T	6	6	214571	214576	0 %	100 %	0 %	0 %	383482344
5531	NC_017043	T	7	7	214591	214597	0 %	100 %	0 %	0 %	383482344
5532	NC_017043	ATC	2	6	214598	214603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482344
5533	NC_017043	CCT	2	6	214667	214672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482344
5534	NC_017043	A	6	6	214682	214687	100 %	0 %	0 %	0 %	383482344
5535	NC_017043	ATT	2	6	214785	214790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_017043	TAAT	2	8	214906	214913	50 %	50 %	0 %	0 %	383482345
5537	NC_017043	CT	3	6	214927	214932	0 %	50 %	0 %	50 %	383482345
5538	NC_017043	CAAT	2	8	214935	214942	50 %	25 %	0 %	25 %	383482345
5539	NC_017043	ATT	2	6	215018	215023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482345
5540	NC_017043	AAT	2	6	215164	215169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482345
5541	NC_017043	TTA	2	6	215175	215180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482345
5542	NC_017043	TTC	2	6	215296	215301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482345
5543	NC_017043	CATC	2	8	215302	215309	25 %	25 %	0 %	50 %	383482345
5544	NC_017043	CAA	2	6	215323	215328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482345
5545	NC_017043	GTA	2	6	215433	215438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482345
5546	NC_017043	AAT	2	6	215580	215585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482345
5547	NC_017043	CTG	2	6	215608	215613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482345
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5549	NC_017043	CTA	2	6	215629	215634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482345
5550	NC_017043	AT	3	6	215654	215659	50 %	50 %	0 %	0 %	383482345
5551	NC_017043	CAA	3	9	215701	215709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482345
5552	NC_017043	CT	3	6	215759	215764	0 %	50 %	0 %	50 %	383482345
5553	NC_017043	TCT	2	6	215786	215791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482345
5554	NC_017043	TAAT	2	8	215831	215838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017043	AT	3	6	215853	215858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017043	AT	3	6	215862	215867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017043	TTGC	2	8	215914	215921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_017043	A	6	6	215929	215934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017043	AAGC	2	8	215938	215945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5560	NC_017043	TAAA	2	8	215958	215965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_017043	TTA	2	6	215975	215980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017043	ATA	2	6	215993	215998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482346
5563	NC_017043	A	8	8	216035	216042	100 %	0 %	0 %	0 %	383482346
5564	NC_017043	A	6	6	216045	216050	100 %	0 %	0 %	0 %	383482346
5565	NC_017043	A	6	6	216069	216074	100 %	0 %	0 %	0 %	383482346
5566	NC_017043	TCC	2	6	216090	216095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482346
5567	NC_017043	A	6	6	216139	216144	100 %	0 %	0 %	0 %	383482346
5568	NC_017043	GACT	2	8	216147	216154	25 %	25 %	25 %	25 %	383482346
5569	NC_017043	AT	3	6	216173	216178	50 %	50 %	0 %	0 %	383482346
5570	NC_017043	TAT	2	6	216219	216224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482346
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5572	NC_017043	AACA	2	8	216245	216252	75 %	0 %	0 %	25 %	383482346
5573	NC_017043	GAA	2	6	216262	216267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482346
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5575	NC_017043	T	6	6	216316	216321	0 %	100 %	0 %	0 %	383482346
5576	NC_017043	ATA	2	6	216329	216334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482346
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5578	NC_017043	TTA	3	9	216416	216424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482346
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5580	NC_017043	GTTT	2	8	216483	216490	0 %	75 %	25 %	0 %	383482346
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5582	NC_017043	TAA	2	6	216509	216514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482346
5583	NC_017043	ATC	2	6	216518	216523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482346
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5585	NC_017043	A	6	6	216542	216547	100 %	0 %	0 %	0 %	383482346
5586	NC_017043	TCAA	2	8	216548	216555	50 %	25 %	0 %	25 %	383482346
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5590	NC_017043	ATA	2	6	216686	216691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482346
5591	NC_017043	ATG	2	6	216704	216709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482346
5592	NC_017043	ATA	2	6	216710	216715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482346
5593	NC_017043	GCT	2	6	216727	216732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482346
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5595	NC_017043	GAA	2	6	216778	216783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482346
5596	NC_017043	ATA	2	6	216797	216802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482346
5597	NC_017043	TAAAGC	2	12	216855	216866	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383482346
5598	NC_017043	A	6	6	216910	216915	100 %	0 %	0 %	0 %	383482346
5599	NC_017043	TCAT	2	8	216957	216964	25 %	50 %	0 %	25 %	383482346
5600	NC_017043	GAA	2	6	216981	216986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482346
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5603	NC_017043	AAATT	2	10	217099	217108	60 %	40 %	0 %	0 %	383482347
5604	NC_017043	TAA	2	6	217121	217126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482347
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5607	NC_017043	A	7	7	217332	217338	100 %	0 %	0 %	0 %	383482347
5608	NC_017043	TCA	2	6	217345	217350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482347
5609	NC_017043	TAT	2	6	217376	217381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482347
5610	NC_017043	ATA	2	6	217386	217391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482347
5611	NC_017043	TAC	2	6	217404	217409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482347
5612	NC_017043	ACC	2	6	217437	217442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482347
5613	NC_017043	GTA	2	6	217451	217456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482347
5614	NC_017043	ATT	2	6	217491	217496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482347
5615	NC_017043	TTA	2	6	217559	217564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482347
5616	NC_017043	TG	3	6	217567	217572	0 %	50 %	50 %	0 %	383482347
5617	NC_017043	T	6	6	217625	217630	0 %	100 %	0 %	0 %	383482347
5618	NC_017043	CTT	2	6	217694	217699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482347
5619	NC_017043	TC	3	6	217707	217712	0 %	50 %	0 %	50 %	383482347
5620	NC_017043	T	6	6	217809	217814	0 %	100 %	0 %	0 %	383482347
5621	NC_017043	TAC	2	6	217827	217832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482347
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