MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 2967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017042	TA	3	6	1193	1198	50 %	50 %	0 %	0 %	383480873
2	NC_017042	CA	3	6	1322	1327	50 %	0 %	0 %	50 %	383480873
3	NC_017042	AT	3	6	1601	1606	50 %	50 %	0 %	0 %	383480873
4	NC_017042	AT	4	8	1926	1933	50 %	50 %	0 %	0 %	383480874
5	NC_017042	AC	3	6	1964	1969	50 %	0 %	0 %	50 %	383480874
6	NC_017042	TA	3	6	2673	2678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017042	AG	3	6	2686	2691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017042	AG	3	6	2960	2965	50 %	0 %	50 %	0 %	383480875
9	NC_017042	AT	3	6	3503	3508	50 %	50 %	0 %	0 %	383480876
10	NC_017042	TC	3	6	4573	4578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017042	AT	3	6	5257	5262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017042	TC	3	6	5363	5368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017042	TA	3	6	5524	5529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017042	AT	3	6	6002	6007	50 %	50 %	0 %	0 %	383480878
15	NC_017042	TA	3	6	6219	6224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017042	TA	3	6	6419	6424	50 %	50 %	0 %	0 %	383480879
17	NC_017042	TA	3	6	6824	6829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017042	TA	3	6	7115	7120	50 %	50 %	0 %	0 %	383480881
19	NC_017042	GA	3	6	7188	7193	50 %	0 %	50 %	0 %	383480881
20	NC_017042	AT	3	6	7635	7640	50 %	50 %	0 %	0 %	383480881
21	NC_017042	CT	3	6	7655	7660	0 %	50 %	0 %	50 %	383480881
22	NC_017042	TA	3	6	7714	7719	50 %	50 %	0 %	0 %	383480881
23	NC_017042	AT	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	383480881
24	NC_017042	TC	3	6	8282	8287	0 %	50 %	0 %	50 %	383480881
25	NC_017042	CT	3	6	9042	9047	0 %	50 %	0 %	50 %	383480881
26	NC_017042	AT	3	6	9263	9268	50 %	50 %	0 %	0 %	383480881
27	NC_017042	AT	3	6	9699	9704	50 %	50 %	0 %	0 %	383480881
28	NC_017042	TA	3	6	10056	10061	50 %	50 %	0 %	0 %	383480882
29	NC_017042	TA	3	6	10606	10611	50 %	50 %	0 %	0 %	383480883
30	NC_017042	TC	3	6	10950	10955	0 %	50 %	0 %	50 %	383480883
31	NC_017042	GT	3	6	11022	11027	0 %	50 %	50 %	0 %	383480883
32	NC_017042	AT	3	6	11087	11092	50 %	50 %	0 %	0 %	383480883
33	NC_017042	AT	3	6	11871	11876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017042	AT	3	6	12126	12131	50 %	50 %	0 %	0 %	383480886
35	NC_017042	CT	3	6	13329	13334	0 %	50 %	0 %	50 %	383480888
36	NC_017042	AT	3	6	13882	13887	50 %	50 %	0 %	0 %	383480888
37	NC_017042	TA	4	8	14138	14145	50 %	50 %	0 %	0 %	383480888
38	NC_017042	AT	3	6	14487	14492	50 %	50 %	0 %	0 %	383480888
39	NC_017042	TA	3	6	14520	14525	50 %	50 %	0 %	0 %	383480888
40	NC_017042	GA	3	6	14893	14898	50 %	0 %	50 %	0 %	383480888
41	NC_017042	AT	5	10	15766	15775	50 %	50 %	0 %	0 %	383480889
42	NC_017042	CA	3	6	16797	16802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017042	TA	3	6	16998	17003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017042	AT	3	6	17635	17640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017042	TA	3	6	17873	17878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017042	AT	4	8	19135	19142	50 %	50 %	0 %	0 %	383480891
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49	NC_017042	TA	4	8	20338	20345	50 %	50 %	0 %	0 %	383480892
50	NC_017042	CT	3	6	20505	20510	0 %	50 %	0 %	50 %	383480893
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52	NC_017042	TA	4	8	20846	20853	50 %	50 %	0 %	0 %	383480893
53	NC_017042	AT	3	6	20908	20913	50 %	50 %	0 %	0 %	383480893
54	NC_017042	TA	3	6	21591	21596	50 %	50 %	0 %	0 %	383480893
55	NC_017042	AT	4	8	21787	21794	50 %	50 %	0 %	0 %	383480893
56	NC_017042	TA	4	8	22015	22022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59	NC_017042	AT	3	6	24731	24736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017042	TA	3	6	24820	24825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017042	AT	3	6	25099	25104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63	NC_017042	AT	3	6	25281	25286	50 %	50 %	0 %	0 %	383480897
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67	NC_017042	AG	3	6	26195	26200	50 %	0 %	50 %	0 %	383480899
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70	NC_017042	TA	3	6	28952	28957	50 %	50 %	0 %	0 %	383480901
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85	NC_017042	TA	3	6	35416	35421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_017042	TC	3	6	37775	37780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017042	TG	3	6	38443	38448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017042	TA	3	6	38694	38699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017042	AT	3	6	39016	39021	50 %	50 %	0 %	0 %	383480911
92	NC_017042	TA	3	6	39723	39728	50 %	50 %	0 %	0 %	383480912
93	NC_017042	TA	4	8	39891	39898	50 %	50 %	0 %	0 %	383480912
94	NC_017042	AT	3	6	39952	39957	50 %	50 %	0 %	0 %	383480912
95	NC_017042	TA	3	6	41290	41295	50 %	50 %	0 %	0 %	383480914
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97	NC_017042	TA	3	6	41995	42000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017042	AT	3	6	42667	42672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017042	TC	3	6	43294	43299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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108	NC_017042	TA	3	6	47018	47023	50 %	50 %	0 %	0 %	383480917
109	NC_017042	AT	4	8	47138	47145	50 %	50 %	0 %	0 %	383480917
110	NC_017042	TG	3	6	47521	47526	0 %	50 %	50 %	0 %	383480918
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112	NC_017042	GC	3	6	48058	48063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017042	TA	3	6	48321	48326	50 %	50 %	0 %	0 %	383480920
114	NC_017042	AC	3	6	48350	48355	50 %	0 %	0 %	50 %	383480920
115	NC_017042	AT	3	6	48603	48608	50 %	50 %	0 %	0 %	383480920
116	NC_017042	AT	4	8	48619	48626	50 %	50 %	0 %	0 %	383480920
117	NC_017042	AT	4	8	48893	48900	50 %	50 %	0 %	0 %	383480921
118	NC_017042	AC	3	6	49459	49464	50 %	0 %	0 %	50 %	383480921
119	NC_017042	TA	3	6	50803	50808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017042	TA	3	6	51357	51362	50 %	50 %	0 %	0 %	383480924
121	NC_017042	TA	3	6	51760	51765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017042	TA	3	6	51775	51780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017042	AT	3	6	51902	51907	50 %	50 %	0 %	0 %	383480926
124	NC_017042	TA	3	6	52596	52601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017042	CT	3	6	52641	52646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017042	TA	3	6	53388	53393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017042	TA	3	6	53671	53676	50 %	50 %	0 %	0 %	383480928
128	NC_017042	TA	3	6	53693	53698	50 %	50 %	0 %	0 %	383480928
129	NC_017042	AT	3	6	53811	53816	50 %	50 %	0 %	0 %	383480928
130	NC_017042	TA	3	6	53888	53893	50 %	50 %	0 %	0 %	383480928
131	NC_017042	AT	3	6	53967	53972	50 %	50 %	0 %	0 %	383480928
132	NC_017042	TC	3	6	54104	54109	0 %	50 %	0 %	50 %	383480928
133	NC_017042	TA	3	6	54324	54329	50 %	50 %	0 %	0 %	383480928
134	NC_017042	AG	3	6	54498	54503	50 %	0 %	50 %	0 %	383480928
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136	NC_017042	CT	3	6	55087	55092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017042	AT	3	6	55181	55186	50 %	50 %	0 %	0 %	383480929
138	NC_017042	AT	3	6	56202	56207	50 %	50 %	0 %	0 %	383480930
139	NC_017042	AT	3	6	57002	57007	50 %	50 %	0 %	0 %	383480930
140	NC_017042	TG	3	6	57188	57193	0 %	50 %	50 %	0 %	383480931
141	NC_017042	AT	3	6	57735	57740	50 %	50 %	0 %	0 %	383480932
142	NC_017042	AT	3	6	59381	59386	50 %	50 %	0 %	0 %	383480934
143	NC_017042	TA	3	6	60531	60536	50 %	50 %	0 %	0 %	383480934
144	NC_017042	AT	3	6	61581	61586	50 %	50 %	0 %	0 %	383480935
145	NC_017042	TA	3	6	61675	61680	50 %	50 %	0 %	0 %	383480935
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147	NC_017042	TA	5	10	62982	62991	50 %	50 %	0 %	0 %	383480936
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