MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 3879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017042	TATT	2	8	47	54	25 %	75 %	0 %	0 %	383480871
2	NC_017042	ACAT	2	8	903	910	50 %	25 %	0 %	25 %	383480872
3	NC_017042	TAAA	2	8	962	969	75 %	25 %	0 %	0 %	383480872
4	NC_017042	TAAA	2	8	1902	1909	75 %	25 %	0 %	0 %	383480874
5	NC_017042	TTAG	2	8	2012	2019	25 %	50 %	25 %	0 %	383480874
6	NC_017042	ATAC	3	12	2120	2131	50 %	25 %	0 %	25 %	383480874
7	NC_017042	GATT	2	8	2377	2384	25 %	50 %	25 %	0 %	383480874
8	NC_017042	TAAT	2	8	2427	2434	50 %	50 %	0 %	0 %	383480874
9	NC_017042	ATAA	2	8	2448	2455	75 %	25 %	0 %	0 %	383480874
10	NC_017042	ATTT	2	8	2511	2518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017042	ATGC	2	8	3134	3141	25 %	25 %	25 %	25 %	383480875
12	NC_017042	ATAG	2	8	3548	3555	50 %	25 %	25 %	0 %	383480876
13	NC_017042	AATG	2	8	3765	3772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017042	TATT	2	8	3774	3781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017042	ATAA	2	8	3898	3905	75 %	25 %	0 %	0 %	383480877
16	NC_017042	ATTT	2	8	4382	4389	25 %	75 %	0 %	0 %	383480877
17	NC_017042	GTCA	2	8	4962	4969	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017042	CTTA	2	8	5102	5109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017042	ATTT	2	8	5370	5377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017042	ATTT	2	8	5817	5824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017042	ATTT	2	8	6025	6032	25 %	75 %	0 %	0 %	383480878
22	NC_017042	TAAT	2	8	7246	7253	50 %	50 %	0 %	0 %	383480881
23	NC_017042	GATT	2	8	7608	7615	25 %	50 %	25 %	0 %	383480881
24	NC_017042	TACC	2	8	7908	7915	25 %	25 %	0 %	50 %	383480881
25	NC_017042	TTCC	2	8	7954	7961	0 %	50 %	0 %	50 %	383480881
26	NC_017042	AATA	2	8	8315	8322	75 %	25 %	0 %	0 %	383480881
27	NC_017042	TTTA	2	8	8330	8337	25 %	75 %	0 %	0 %	383480881
28	NC_017042	TTAA	2	8	8505	8512	50 %	50 %	0 %	0 %	383480881
29	NC_017042	ACCC	2	8	9362	9369	25 %	0 %	0 %	75 %	383480881
30	NC_017042	GTAG	2	8	9810	9817	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017042	TAAA	2	8	9837	9844	75 %	25 %	0 %	0 %	383480882
32	NC_017042	CGAA	2	8	9961	9968	50 %	0 %	25 %	25 %	383480882
33	NC_017042	GAAC	2	8	9971	9978	50 %	0 %	25 %	25 %	383480882
34	NC_017042	TTTC	2	8	10330	10337	0 %	75 %	0 %	25 %	383480883
35	NC_017042	TAGC	2	8	10361	10368	25 %	25 %	25 %	25 %	383480883
36	NC_017042	ACCT	2	8	10475	10482	25 %	25 %	0 %	50 %	383480883
37	NC_017042	GGAT	2	8	10518	10525	25 %	25 %	50 %	0 %	383480883
38	NC_017042	TGTA	2	8	11268	11275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017042	ATTA	2	8	11333	11340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017042	GAAA	2	8	11393	11400	75 %	0 %	25 %	0 %	383480884
41	NC_017042	TAGT	2	8	11566	11573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017042	CATC	2	8	11642	11649	25 %	25 %	0 %	50 %	383480885
43	NC_017042	GCTT	2	8	11856	11863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017042	TGTT	2	8	11914	11921	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017042	GTTT	2	8	11947	11954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017042	TTCC	2	8	12166	12173	0 %	50 %	0 %	50 %	383480886
47	NC_017042	TAAT	2	8	12423	12430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017042	TATT	2	8	13181	13188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017042	TTAT	2	8	13404	13411	25 %	75 %	0 %	0 %	383480888
50	NC_017042	TTGA	2	8	14902	14909	25 %	50 %	25 %	0 %	383480888
51	NC_017042	AGAA	2	8	15227	15234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017042	TAAT	2	8	15264	15271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017042	GAAG	2	8	15362	15369	50 %	0 %	50 %	0 %	383480889
54	NC_017042	AGCA	2	8	15615	15622	50 %	0 %	25 %	25 %	383480889
55	NC_017042	CGGT	2	8	15960	15967	0 %	25 %	50 %	25 %	383480889
56	NC_017042	ATCT	2	8	16835	16842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017042	ATTT	2	8	16874	16881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017042	ATTT	2	8	17091	17098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017042	TAGT	2	8	17730	17737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017042	GAAA	2	8	18101	18108	75 %	0 %	25 %	0 %	383480891
61	NC_017042	AAAG	2	8	18356	18363	75 %	0 %	25 %	0 %	383480891
62	NC_017042	GTAG	2	8	19441	19448	25 %	25 %	50 %	0 %	383480892
63	NC_017042	TTAT	2	8	19487	19494	25 %	75 %	0 %	0 %	383480892
64	NC_017042	GCGA	2	8	20395	20402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017042	TCGC	2	8	20459	20466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017042	TTTC	2	8	20573	20580	0 %	75 %	0 %	25 %	383480893
67	NC_017042	ATAA	2	8	21213	21220	75 %	25 %	0 %	0 %	383480893
68	NC_017042	GGTA	2	8	21261	21268	25 %	25 %	50 %	0 %	383480893
69	NC_017042	AAAT	2	8	21405	21412	75 %	25 %	0 %	0 %	383480893
70	NC_017042	AATG	2	8	21433	21440	50 %	25 %	25 %	0 %	383480893
71	NC_017042	GTAA	2	8	21642	21649	50 %	25 %	25 %	0 %	383480893
72	NC_017042	AGTA	2	8	21813	21820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017042	GATA	2	8	22565	22572	50 %	25 %	25 %	0 %	383480895
74	NC_017042	TCAT	2	8	23066	23073	25 %	50 %	0 %	25 %	383480895
75	NC_017042	AGTT	2	8	23122	23129	25 %	50 %	25 %	0 %	383480895
76	NC_017042	TCAT	2	8	23213	23220	25 %	50 %	0 %	25 %	383480895
77	NC_017042	AATT	2	8	24052	24059	50 %	50 %	0 %	0 %	383480896
78	NC_017042	TTCT	2	8	24544	24551	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017042	TAAA	2	8	24670	24677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017042	TGCA	2	8	24689	24696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017042	TAAA	2	8	25614	25621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017042	TTAT	2	8	25674	25681	25 %	75 %	0 %	0 %	383480898
83	NC_017042	TAAA	2	8	26113	26120	75 %	25 %	0 %	0 %	383480899
84	NC_017042	CAAT	2	8	26653	26660	50 %	25 %	0 %	25 %	383480899
85	NC_017042	ATTT	2	8	26974	26981	25 %	75 %	0 %	0 %	383480899
86	NC_017042	TAAA	2	8	27418	27425	75 %	25 %	0 %	0 %	383480899
87	NC_017042	TGCT	2	8	28267	28274	0 %	50 %	25 %	25 %	383480900
88	NC_017042	CTAT	2	8	28627	28634	25 %	50 %	0 %	25 %	383480901
89	NC_017042	TTGC	2	8	28770	28777	0 %	50 %	25 %	25 %	383480901
90	NC_017042	ATTA	2	8	28854	28861	50 %	50 %	0 %	0 %	383480901
91	NC_017042	ATTA	2	8	28971	28978	50 %	50 %	0 %	0 %	383480901
92	NC_017042	ATTT	2	8	29000	29007	25 %	75 %	0 %	0 %	383480901
93	NC_017042	TTCT	2	8	29813	29820	0 %	75 %	0 %	25 %	383480901
94	NC_017042	TATT	2	8	30043	30050	25 %	75 %	0 %	0 %	383480901
95	NC_017042	TCTT	2	8	30093	30100	0 %	75 %	0 %	25 %	383480901
96	NC_017042	TAAT	2	8	30137	30144	50 %	50 %	0 %	0 %	383480901
97	NC_017042	CATT	2	8	30570	30577	25 %	50 %	0 %	25 %	383480902
98	NC_017042	AAGC	2	8	30796	30803	50 %	0 %	25 %	25 %	383480902
99	NC_017042	ATGC	2	8	31091	31098	25 %	25 %	25 %	25 %	383480902
100	NC_017042	GAAA	2	8	31317	31324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017042	TCTT	2	8	31583	31590	0 %	75 %	0 %	25 %	383480903
102	NC_017042	TATC	2	8	31793	31800	25 %	50 %	0 %	25 %	383480904
103	NC_017042	AATA	2	8	31813	31820	75 %	25 %	0 %	0 %	383480904
104	NC_017042	GGCA	2	8	33470	33477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017042	CGAA	2	8	33572	33579	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017042	AGAT	2	8	34521	34528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017042	AATT	2	8	34660	34667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017042	GTTA	2	8	34810	34817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017042	TAAC	2	8	34826	34833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017042	TTAC	2	8	35525	35532	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017042	TTTA	2	8	35624	35631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017042	TTTA	2	8	35752	35759	25 %	75 %	0 %	0 %	383480907
113	NC_017042	GATA	2	8	35762	35769	50 %	25 %	25 %	0 %	383480907
114	NC_017042	ATTT	2	8	36267	36274	25 %	75 %	0 %	0 %	383480908
115	NC_017042	TATT	2	8	36591	36598	25 %	75 %	0 %	0 %	383480908
116	NC_017042	AACA	2	8	36890	36897	75 %	0 %	0 %	25 %	383480908
117	NC_017042	AGTA	2	8	36904	36911	50 %	25 %	25 %	0 %	383480908
118	NC_017042	AGTA	2	8	37919	37926	50 %	25 %	25 %	0 %	383480909
119	NC_017042	CTTT	2	8	37986	37993	0 %	75 %	0 %	25 %	383480909
120	NC_017042	GTAA	2	8	38057	38064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017042	TGCT	2	8	38195	38202	0 %	50 %	25 %	25 %	383480910
122	NC_017042	ATTG	2	8	38437	38444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017042	GCAA	2	8	38827	38834	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017042	TTAT	2	8	39837	39844	25 %	75 %	0 %	0 %	383480912
125	NC_017042	TAAG	2	8	40086	40093	50 %	25 %	25 %	0 %	383480912
126	NC_017042	AGGC	2	8	40382	40389	25 %	0 %	50 %	25 %	383480913
127	NC_017042	ATTC	2	8	40624	40631	25 %	50 %	0 %	25 %	383480913
128	NC_017042	CTAT	2	8	40640	40647	25 %	50 %	0 %	25 %	383480913
129	NC_017042	CAAA	2	8	40671	40678	75 %	0 %	0 %	25 %	383480913
130	NC_017042	TAAA	2	8	40869	40876	75 %	25 %	0 %	0 %	383480914
131	NC_017042	ATTG	2	8	41377	41384	25 %	50 %	25 %	0 %	383480914
132	NC_017042	TAAA	2	8	41789	41796	75 %	25 %	0 %	0 %	383480914
133	NC_017042	TAAT	2	8	41892	41899	50 %	50 %	0 %	0 %	383480914
134	NC_017042	TTAT	2	8	41912	41919	25 %	75 %	0 %	0 %	383480914
135	NC_017042	AATG	2	8	42411	42418	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017042	AAGC	2	8	42522	42529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017042	GAAA	2	8	42554	42561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017042	TAAT	2	8	42930	42937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017042	GACA	2	8	43014	43021	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017042	AAAT	2	8	43036	43043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017042	TTAT	2	8	43691	43698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017042	AAAT	2	8	43919	43926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017042	AAAC	2	8	44466	44473	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017042	GGCA	2	8	44730	44737	25 %	0 %	50 %	25 %	383480915
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146	NC_017042	ATAA	2	8	46197	46204	75 %	25 %	0 %	0 %	383480916
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