MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017042	GTA	2	6	154775	154780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481020
4003	NC_017042	AT	3	6	154819	154824	50 %	50 %	0 %	0 %	383481020
4004	NC_017042	TAC	2	6	154827	154832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481020
4005	NC_017042	TTA	2	6	154905	154910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481020
4006	NC_017042	TAT	2	6	154935	154940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481020
4007	NC_017042	ATCCTG	2	12	154977	154988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383481020
4008	NC_017042	TAT	2	6	155112	155117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481020
4009	NC_017042	ATT	2	6	155219	155224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481020
4010	NC_017042	TTGC	2	8	155230	155237	0 %	50 %	25 %	25 %	383481020
4011	NC_017042	A	6	6	155241	155246	100 %	0 %	0 %	0 %	383481020
4012	NC_017042	GATG	2	8	155331	155338	25 %	25 %	50 %	0 %	383481020
4013	NC_017042	AAAAG	2	10	155386	155395	80 %	0 %	20 %	0 %	383481020
4014	NC_017042	TA	3	6	155541	155546	50 %	50 %	0 %	0 %	383481020
4015	NC_017042	TA	4	8	155566	155573	50 %	50 %	0 %	0 %	383481020
4016	NC_017042	GGGTT	2	10	155596	155605	0 %	40 %	60 %	0 %	383481020
4017	NC_017042	GTA	2	6	155628	155633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481020
4018	NC_017042	ATG	2	6	155684	155689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481020
4019	NC_017042	T	6	6	155708	155713	0 %	100 %	0 %	0 %	383481020
4020	NC_017042	T	6	6	155723	155728	0 %	100 %	0 %	0 %	383481020
4021	NC_017042	GCT	2	6	155906	155911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481020
4022	NC_017042	GGA	2	6	155924	155929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383481020
4023	NC_017042	TAT	2	6	155953	155958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481020
4024	NC_017042	TTTAT	2	10	155972	155981	20 %	80 %	0 %	0 %	383481020
4025	NC_017042	GTAATA	2	12	156035	156046	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383481020
4026	NC_017042	AT	3	6	156053	156058	50 %	50 %	0 %	0 %	383481020
4027	NC_017042	TAAA	2	8	156072	156079	75 %	25 %	0 %	0 %	383481020
4028	NC_017042	TAAA	2	8	156096	156103	75 %	25 %	0 %	0 %	383481020
4029	NC_017042	A	7	7	156139	156145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017042	T	7	7	156172	156178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017042	A	7	7	156246	156252	100 %	0 %	0 %	0 %	383481021
4032	NC_017042	TAT	3	9	156285	156293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481021
4033	NC_017042	GTC	2	6	156317	156322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481021
4034	NC_017042	TAT	2	6	156408	156413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481021
4035	NC_017042	TTA	2	6	156443	156448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481021
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4041	NC_017042	GTA	2	6	156769	156774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481021
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4043	NC_017042	ATA	2	6	156788	156793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481021
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4046	NC_017042	TGTT	2	8	156936	156943	0 %	75 %	25 %	0 %	383481021
4047	NC_017042	TGTT	2	8	156953	156960	0 %	75 %	25 %	0 %	383481021
4048	NC_017042	TA	3	6	156961	156966	50 %	50 %	0 %	0 %	383481021
4049	NC_017042	GTC	2	6	157121	157126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481021
4050	NC_017042	GCTTA	2	10	157158	157167	20 %	40 %	20 %	20 %	383481021
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4052	NC_017042	TTCT	2	8	157223	157230	0 %	75 %	0 %	25 %	383481021
4053	NC_017042	T	6	6	157240	157245	0 %	100 %	0 %	0 %	383481021
4054	NC_017042	AGC	2	6	157275	157280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481021
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4056	NC_017042	AGG	3	9	157440	157448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383481021
4057	NC_017042	ATT	2	6	157449	157454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481021
4058	NC_017042	A	6	6	157480	157485	100 %	0 %	0 %	0 %	383481021
4059	NC_017042	TAA	2	6	157492	157497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017042	ACAAT	2	10	157522	157531	60 %	20 %	0 %	20 %	383481022
4061	NC_017042	TACT	2	8	157590	157597	25 %	50 %	0 %	25 %	383481022
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4064	NC_017042	T	6	6	157693	157698	0 %	100 %	0 %	0 %	383481022
4065	NC_017042	AT	3	6	157713	157718	50 %	50 %	0 %	0 %	383481022
4066	NC_017042	GTA	2	6	157732	157737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481022
4067	NC_017042	GGA	2	6	157755	157760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383481022
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4074	NC_017042	GTTAT	2	10	158147	158156	20 %	60 %	20 %	0 %	383481023
4075	NC_017042	A	6	6	158248	158253	100 %	0 %	0 %	0 %	383481023
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4080	NC_017042	CTG	2	6	158447	158452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481023
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4090	NC_017042	A	7	7	159333	159339	100 %	0 %	0 %	0 %	383481023
4091	NC_017042	A	6	6	159353	159358	100 %	0 %	0 %	0 %	383481023
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4102	NC_017042	AAT	2	6	159814	159819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017042	AGTT	2	8	159843	159850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017042	A	6	6	159851	159856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017042	ATCA	2	8	159865	159872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_017042	ATA	2	6	159885	159890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017042	AT	3	6	159915	159920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017042	AT	3	6	159943	159948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017042	ATA	2	6	159951	159956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017042	TAT	2	6	160009	160014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017042	AAGT	2	8	160033	160040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017042	ATA	2	6	160099	160104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017042	AATC	2	8	160115	160122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_017042	A	6	6	160132	160137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017042	GTA	2	6	160150	160155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017042	A	6	6	160205	160210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017042	TTA	2	6	160236	160241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017042	A	6	6	160247	160252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017042	TAG	2	6	160267	160272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017042	AG	3	6	160280	160285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017042	GAA	2	6	160326	160331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017042	AGG	2	6	160399	160404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383481024
4123	NC_017042	ACT	2	6	160421	160426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481024
4124	NC_017042	TGC	2	6	160447	160452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481024
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4500	NC_017042	AT	3	6	174841	174846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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