MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017042	T	6	6	135044	135049	0 %	100 %	0 %	0 %	383481001
3503	NC_017042	GCA	2	6	135083	135088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481001
3504	NC_017042	TAC	2	6	135097	135102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481001
3505	NC_017042	ATC	2	6	135190	135195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481001
3506	NC_017042	GTT	2	6	135252	135257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017042	A	6	6	135262	135267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017042	CAT	2	6	135278	135283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_017042	ACA	2	6	135359	135364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_017042	ATCT	2	8	135389	135396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_017042	TAA	2	6	135402	135407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017042	AAT	2	6	135474	135479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481002
3513	NC_017042	TTA	2	6	135484	135489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481002
3514	NC_017042	ACTT	2	8	135540	135547	25 %	50 %	0 %	25 %	383481002
3515	NC_017042	T	6	6	135591	135596	0 %	100 %	0 %	0 %	383481002
3516	NC_017042	TAATAG	2	12	135608	135619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383481002
3517	NC_017042	TTC	2	6	135624	135629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481002
3518	NC_017042	TAA	2	6	135660	135665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481002
3519	NC_017042	ATG	2	6	135876	135881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481002
3520	NC_017042	AAT	2	6	135910	135915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481002
3521	NC_017042	CCA	2	6	135921	135926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383481002
3522	NC_017042	T	6	6	135954	135959	0 %	100 %	0 %	0 %	383481002
3523	NC_017042	TTGC	2	8	135998	136005	0 %	50 %	25 %	25 %	383481002
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3525	NC_017042	CCG	2	6	136066	136071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383481002
3526	NC_017042	ATAA	2	8	136084	136091	75 %	25 %	0 %	0 %	383481002
3527	NC_017042	GCT	2	6	136114	136119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481002
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3530	NC_017042	CATC	2	8	136221	136228	25 %	25 %	0 %	50 %	383481002
3531	NC_017042	TAT	2	6	136259	136264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481002
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3533	NC_017042	ATTT	3	12	136397	136408	25 %	75 %	0 %	0 %	383481002
3534	NC_017042	ATT	2	6	136458	136463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481002
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3537	NC_017042	AT	3	6	136630	136635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_017042	TATT	2	8	136664	136671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017042	TAA	2	6	136694	136699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017042	AACG	2	8	136776	136783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_017042	TAA	2	6	136788	136793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017042	CT	3	6	136816	136821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_017042	TAT	2	6	136888	136893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481003
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3550	NC_017042	TTA	2	6	137140	137145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481004
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3553	NC_017042	T	6	6	137249	137254	0 %	100 %	0 %	0 %	383481004
3554	NC_017042	T	7	7	137256	137262	0 %	100 %	0 %	0 %	383481004
3555	NC_017042	TCA	2	6	137314	137319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481004
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3557	NC_017042	TAA	2	6	137348	137353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_017042	TTA	2	6	137363	137368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017042	ATA	2	6	137407	137412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017042	ATA	2	6	137424	137429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017042	GTTT	2	8	137475	137482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017042	TA	3	6	137495	137500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017042	TAT	2	6	137526	137531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481005
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3572	NC_017042	ATT	3	9	137678	137686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481005
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3601	NC_017042	ATC	2	6	138717	138722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3604	NC_017042	TTG	2	6	138763	138768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017042	TGT	2	6	138859	138864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017042	T	7	7	138873	138879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017042	CAA	2	6	138919	138924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017042	TAC	3	9	138949	138957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3612	NC_017042	A	7	7	139136	139142	100 %	0 %	0 %	0 %	383481008
3613	NC_017042	ATT	2	6	139152	139157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481008
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3623	NC_017042	TAG	2	6	139514	139519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481008
3624	NC_017042	AGTC	2	8	139527	139534	25 %	25 %	25 %	25 %	383481008
3625	NC_017042	ATA	2	6	139535	139540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481008
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