MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017042	GTT	2	6	57461	57466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017042	A	7	7	57551	57557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017042	AGTTCT	2	12	57567	57578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383480932
1504	NC_017042	ACT	2	6	57594	57599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480932
1505	NC_017042	AAT	2	6	57731	57736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480932
1506	NC_017042	AT	3	6	57735	57740	50 %	50 %	0 %	0 %	383480932
1507	NC_017042	TTC	2	6	57749	57754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480932
1508	NC_017042	TCG	3	9	57759	57767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480932
1509	NC_017042	AAT	2	6	57824	57829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480932
1510	NC_017042	T	7	7	57964	57970	0 %	100 %	0 %	0 %	383480932
1511	NC_017042	AAT	2	6	58094	58099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480932
1512	NC_017042	ATT	2	6	58155	58160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017042	CAA	2	6	58183	58188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017042	GCT	2	6	58269	58274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480933
1515	NC_017042	TTAT	3	12	58275	58286	25 %	75 %	0 %	0 %	383480933
1516	NC_017042	TTA	4	12	58306	58317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480933
1517	NC_017042	TAA	2	6	58322	58327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480933
1518	NC_017042	ATA	2	6	58361	58366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480933
1519	NC_017042	T	7	7	58396	58402	0 %	100 %	0 %	0 %	383480933
1520	NC_017042	GAA	2	6	58420	58425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480933
1521	NC_017042	GCG	2	6	58448	58453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480933
1522	NC_017042	ATG	2	6	58462	58467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480933
1523	NC_017042	T	6	6	58473	58478	0 %	100 %	0 %	0 %	383480933
1524	NC_017042	CTT	2	6	58489	58494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480933
1525	NC_017042	ATT	2	6	58534	58539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480933
1526	NC_017042	ATA	2	6	58673	58678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480933
1527	NC_017042	TAT	3	9	58686	58694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480933
1528	NC_017042	A	6	6	58855	58860	100 %	0 %	0 %	0 %	383480934
1529	NC_017042	GTA	2	6	58880	58885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480934
1530	NC_017042	AGC	2	6	59011	59016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480934
1531	NC_017042	AGAA	2	8	59127	59134	75 %	0 %	25 %	0 %	383480934
1532	NC_017042	GAA	2	6	59141	59146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480934
1533	NC_017042	GAA	2	6	59246	59251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480934
1534	NC_017042	GAA	2	6	59284	59289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480934
1535	NC_017042	TAA	2	6	59290	59295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480934
1536	NC_017042	T	6	6	59306	59311	0 %	100 %	0 %	0 %	383480934
1537	NC_017042	AT	3	6	59381	59386	50 %	50 %	0 %	0 %	383480934
1538	NC_017042	ATTT	2	8	59388	59395	25 %	75 %	0 %	0 %	383480934
1539	NC_017042	AGGGG	2	10	59464	59473	20 %	0 %	80 %	0 %	383480934
1540	NC_017042	A	6	6	59514	59519	100 %	0 %	0 %	0 %	383480934
1541	NC_017042	A	8	8	59564	59571	100 %	0 %	0 %	0 %	383480934
1542	NC_017042	TAG	2	6	59583	59588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480934
1543	NC_017042	ATTAT	2	10	59705	59714	40 %	60 %	0 %	0 %	383480934
1544	NC_017042	TTA	2	6	59778	59783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480934
1545	NC_017042	GAAAA	2	10	59789	59798	80 %	0 %	20 %	0 %	383480934
1546	NC_017042	TTA	2	6	59805	59810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480934
1547	NC_017042	CGA	2	6	59833	59838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480934
1548	NC_017042	TAAA	2	8	59844	59851	75 %	25 %	0 %	0 %	383480934
1549	NC_017042	T	7	7	59863	59869	0 %	100 %	0 %	0 %	383480934
1550	NC_017042	A	8	8	59952	59959	100 %	0 %	0 %	0 %	383480934
1551	NC_017042	A	7	7	59970	59976	100 %	0 %	0 %	0 %	383480934
1552	NC_017042	A	6	6	59980	59985	100 %	0 %	0 %	0 %	383480934
1553	NC_017042	GCA	2	6	59991	59996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480934
1554	NC_017042	TTA	2	6	60025	60030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480934
1555	NC_017042	T	6	6	60035	60040	0 %	100 %	0 %	0 %	383480934
1556	NC_017042	AGA	2	6	60075	60080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480934
1557	NC_017042	TTG	2	6	60170	60175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480934
1558	NC_017042	TTAAAT	2	12	60224	60235	50 %	50 %	0 %	0 %	383480934
1559	NC_017042	TAA	3	9	60238	60246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480934
1560	NC_017042	GAA	2	6	60254	60259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480934
1561	NC_017042	ATA	2	6	60291	60296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480934
1562	NC_017042	A	6	6	60330	60335	100 %	0 %	0 %	0 %	383480934
1563	NC_017042	T	6	6	60341	60346	0 %	100 %	0 %	0 %	383480934
1564	NC_017042	T	7	7	60351	60357	0 %	100 %	0 %	0 %	383480934
1565	NC_017042	ATT	2	6	60358	60363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480934
1566	NC_017042	TAA	2	6	60400	60405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480934
1567	NC_017042	ATA	2	6	60408	60413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480934
1568	NC_017042	TAT	2	6	60426	60431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480934
1569	NC_017042	TAA	2	6	60459	60464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480934
1570	NC_017042	ACA	2	6	60469	60474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480934
1571	NC_017042	TA	3	6	60531	60536	50 %	50 %	0 %	0 %	383480934
1572	NC_017042	A	6	6	60536	60541	100 %	0 %	0 %	0 %	383480934
1573	NC_017042	TTA	2	6	60588	60593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480934
1574	NC_017042	ATT	2	6	60610	60615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480934
1575	NC_017042	CTT	2	6	60621	60626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_017042	A	6	6	60634	60639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017042	AGCAAT	2	12	60658	60669	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383480935
1578	NC_017042	ATAG	2	8	60691	60698	50 %	25 %	25 %	0 %	383480935
1579	NC_017042	A	6	6	60706	60711	100 %	0 %	0 %	0 %	383480935
1580	NC_017042	ATG	2	6	60740	60745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480935
1581	NC_017042	AAC	2	6	60751	60756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480935
1582	NC_017042	TAA	2	6	60768	60773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480935
1583	NC_017042	GAT	2	6	60853	60858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480935
1584	NC_017042	GAA	2	6	60886	60891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480935
1585	NC_017042	AGA	2	6	60936	60941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480935
1586	NC_017042	TAC	2	6	60951	60956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480935
1587	NC_017042	GAT	2	6	60958	60963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480935
1588	NC_017042	G	6	6	60990	60995	0 %	0 %	100 %	0 %	383480935
1589	NC_017042	AGGA	2	8	61046	61053	50 %	0 %	50 %	0 %	383480935
1590	NC_017042	GTT	2	6	61100	61105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480935
1591	NC_017042	GTATG	2	10	61111	61120	20 %	40 %	40 %	0 %	383480935
1592	NC_017042	A	6	6	61136	61141	100 %	0 %	0 %	0 %	383480935
1593	NC_017042	TAC	2	6	61145	61150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480935
1594	NC_017042	ATG	2	6	61202	61207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480935
1595	NC_017042	TAG	2	6	61215	61220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480935
1596	NC_017042	TATCTA	2	12	61256	61267	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383480935
1597	NC_017042	A	6	6	61351	61356	100 %	0 %	0 %	0 %	383480935
1598	NC_017042	A	6	6	61399	61404	100 %	0 %	0 %	0 %	383480935
1599	NC_017042	TAA	2	6	61407	61412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480935
1600	NC_017042	ATT	2	6	61419	61424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480935
1601	NC_017042	GAA	2	6	61468	61473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480935
1602	NC_017042	TAAT	2	8	61508	61515	50 %	50 %	0 %	0 %	383480935
1603	NC_017042	TGA	2	6	61575	61580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480935
1604	NC_017042	AT	3	6	61581	61586	50 %	50 %	0 %	0 %	383480935
1605	NC_017042	GCA	2	6	61603	61608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480935
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1607	NC_017042	A	6	6	61616	61621	100 %	0 %	0 %	0 %	383480935
1608	NC_017042	A	6	6	61633	61638	100 %	0 %	0 %	0 %	383480935
1609	NC_017042	TA	3	6	61675	61680	50 %	50 %	0 %	0 %	383480935
1610	NC_017042	A	6	6	61744	61749	100 %	0 %	0 %	0 %	383480935
1611	NC_017042	A	6	6	61766	61771	100 %	0 %	0 %	0 %	383480935
1612	NC_017042	GA	3	6	61774	61779	50 %	0 %	50 %	0 %	383480935
1613	NC_017042	A	7	7	61794	61800	100 %	0 %	0 %	0 %	383480935
1614	NC_017042	TATC	2	8	61832	61839	25 %	50 %	0 %	25 %	383480935
1615	NC_017042	A	6	6	61843	61848	100 %	0 %	0 %	0 %	383480935
1616	NC_017042	AAG	2	6	61886	61891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480935
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1618	NC_017042	CAAG	2	8	62005	62012	50 %	0 %	25 %	25 %	383480935
1619	NC_017042	TAA	2	6	62049	62054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480935
1620	NC_017042	TAC	2	6	62057	62062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480935
1621	NC_017042	TGA	2	6	62205	62210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480935
1622	NC_017042	CGG	2	6	62217	62222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480935
1623	NC_017042	GAA	2	6	62335	62340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480935
1624	NC_017042	AGA	2	6	62391	62396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480935
1625	NC_017042	GCA	2	6	62403	62408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480935
1626	NC_017042	ACA	2	6	62466	62471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480935
1627	NC_017042	A	6	6	62485	62490	100 %	0 %	0 %	0 %	383480935
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1629	NC_017042	GTG	2	6	62519	62524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383480935
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