MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017042	TGA	2	6	18997	19002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480891
502	NC_017042	TTA	2	6	19014	19019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480891
503	NC_017042	CAA	2	6	19022	19027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383480891
504	NC_017042	AAT	2	6	19076	19081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480891
505	NC_017042	AGA	2	6	19117	19122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480891
506	NC_017042	AT	4	8	19135	19142	50 %	50 %	0 %	0 %	383480891
507	NC_017042	A	8	8	19167	19174	100 %	0 %	0 %	0 %	383480891
508	NC_017042	AGA	2	6	19210	19215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480891
509	NC_017042	TTTAA	2	10	19228	19237	40 %	60 %	0 %	0 %	383480891
510	NC_017042	TTA	2	6	19241	19246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017042	ATT	2	6	19266	19271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017042	T	6	6	19388	19393	0 %	100 %	0 %	0 %	383480892
513	NC_017042	TATTT	2	10	19417	19426	20 %	80 %	0 %	0 %	383480892
514	NC_017042	GTAG	2	8	19441	19448	25 %	25 %	50 %	0 %	383480892
515	NC_017042	CTT	2	6	19461	19466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480892
516	NC_017042	TTAT	2	8	19487	19494	25 %	75 %	0 %	0 %	383480892
517	NC_017042	T	6	6	19494	19499	0 %	100 %	0 %	0 %	383480892
518	NC_017042	TTA	2	6	19532	19537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480892
519	NC_017042	ATTTT	2	10	19553	19562	20 %	80 %	0 %	0 %	383480892
520	NC_017042	T	6	6	19559	19564	0 %	100 %	0 %	0 %	383480892
521	NC_017042	TAT	2	6	19602	19607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480892
522	NC_017042	CAT	2	6	19620	19625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480892
523	NC_017042	TGA	2	6	19706	19711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480892
524	NC_017042	TCA	2	6	19757	19762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480892
525	NC_017042	AGT	2	6	19792	19797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480892
526	NC_017042	A	6	6	19844	19849	100 %	0 %	0 %	0 %	383480892
527	NC_017042	AG	3	6	19891	19896	50 %	0 %	50 %	0 %	383480892
528	NC_017042	TTC	2	6	19924	19929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480892
529	NC_017042	CGA	2	6	19972	19977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480892
530	NC_017042	TCC	2	6	20008	20013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383480892
531	NC_017042	ATT	2	6	20018	20023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480892
532	NC_017042	ATC	2	6	20035	20040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480892
533	NC_017042	AAT	2	6	20057	20062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480892
534	NC_017042	AT	3	6	20061	20066	50 %	50 %	0 %	0 %	383480892
535	NC_017042	CCA	2	6	20252	20257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480892
536	NC_017042	CAC	2	6	20259	20264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480892
537	NC_017042	GTCCG	2	10	20266	20275	0 %	20 %	40 %	40 %	383480892
538	NC_017042	GCC	2	6	20320	20325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383480892
539	NC_017042	TA	4	8	20338	20345	50 %	50 %	0 %	0 %	383480892
540	NC_017042	TCA	2	6	20354	20359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480892
541	NC_017042	GCGA	2	8	20395	20402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
542	NC_017042	TGA	2	6	20433	20438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017042	TCGC	2	8	20459	20466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
544	NC_017042	GAC	2	6	20470	20475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017042	CT	3	6	20505	20510	0 %	50 %	0 %	50 %	383480893
546	NC_017042	CTG	2	6	20542	20547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480893
547	NC_017042	T	6	6	20549	20554	0 %	100 %	0 %	0 %	383480893
548	NC_017042	TTTC	2	8	20573	20580	0 %	75 %	0 %	25 %	383480893
549	NC_017042	ATA	2	6	20662	20667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480893
550	NC_017042	TC	3	6	20700	20705	0 %	50 %	0 %	50 %	383480893
551	NC_017042	TTG	2	6	20767	20772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480893
552	NC_017042	CTT	2	6	20798	20803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480893
553	NC_017042	TA	4	8	20846	20853	50 %	50 %	0 %	0 %	383480893
554	NC_017042	TTAGCT	2	12	20896	20907	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383480893
555	NC_017042	AT	3	6	20908	20913	50 %	50 %	0 %	0 %	383480893
556	NC_017042	TTA	2	6	20954	20959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480893
557	NC_017042	CCG	2	6	20974	20979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383480893
558	NC_017042	TTA	2	6	21109	21114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480893
559	NC_017042	T	6	6	21121	21126	0 %	100 %	0 %	0 %	383480893
560	NC_017042	ATT	2	6	21127	21132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480893
561	NC_017042	CAT	2	6	21168	21173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480893
562	NC_017042	ATAA	2	8	21213	21220	75 %	25 %	0 %	0 %	383480893
563	NC_017042	GCG	2	6	21253	21258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480893
564	NC_017042	GGTA	2	8	21261	21268	25 %	25 %	50 %	0 %	383480893
565	NC_017042	ATA	2	6	21367	21372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480893
566	NC_017042	AAAT	2	8	21405	21412	75 %	25 %	0 %	0 %	383480893
567	NC_017042	AATG	2	8	21433	21440	50 %	25 %	25 %	0 %	383480893
568	NC_017042	ATT	2	6	21462	21467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480893
569	NC_017042	A	6	6	21520	21525	100 %	0 %	0 %	0 %	383480893
570	NC_017042	ATATC	2	10	21550	21559	40 %	40 %	0 %	20 %	383480893
571	NC_017042	TA	3	6	21591	21596	50 %	50 %	0 %	0 %	383480893
572	NC_017042	TAG	2	6	21602	21607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480893
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574	NC_017042	GTAA	2	8	21642	21649	50 %	25 %	25 %	0 %	383480893
575	NC_017042	ATT	3	9	21768	21776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480893
576	NC_017042	AT	4	8	21787	21794	50 %	50 %	0 %	0 %	383480893
577	NC_017042	AGTA	2	8	21813	21820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017042	TTA	2	6	21858	21863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017042	TAA	2	6	21962	21967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017042	TA	4	8	22015	22022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017042	CTT	2	6	22042	22047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017042	CCT	2	6	22064	22069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_017042	ATT	2	6	22110	22115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480894
584	NC_017042	CTA	2	6	22157	22162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480894
585	NC_017042	AAT	2	6	22193	22198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480894
586	NC_017042	CTT	2	6	22240	22245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_017042	TTA	2	6	22290	22295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017042	GAT	2	6	22341	22346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017042	AT	3	6	22358	22363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017042	ATT	2	6	22386	22391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017042	AAG	2	6	22441	22446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480895
592	NC_017042	TAT	2	6	22449	22454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480895
593	NC_017042	GATA	2	8	22565	22572	50 %	25 %	25 %	0 %	383480895
594	NC_017042	ATA	2	6	22588	22593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480895
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597	NC_017042	TAA	2	6	22680	22685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480895
598	NC_017042	AGG	2	6	22753	22758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383480895
599	NC_017042	T	6	6	22793	22798	0 %	100 %	0 %	0 %	383480895
600	NC_017042	TAG	2	6	22947	22952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480895
601	NC_017042	TAG	2	6	22984	22989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480895
602	NC_017042	TTC	2	6	23002	23007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480895
603	NC_017042	ATT	2	6	23011	23016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480895
604	NC_017042	TAT	2	6	23049	23054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480895
605	NC_017042	TCAT	2	8	23066	23073	25 %	50 %	0 %	25 %	383480895
606	NC_017042	AGTT	2	8	23122	23129	25 %	50 %	25 %	0 %	383480895
607	NC_017042	TAT	2	6	23133	23138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480895
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609	NC_017042	TCAT	2	8	23213	23220	25 %	50 %	0 %	25 %	383480895
610	NC_017042	TTAAAA	2	12	23225	23236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017042	ATC	2	6	23294	23299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480896
612	NC_017042	CTT	2	6	23301	23306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480896
613	NC_017042	ATG	2	6	23365	23370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480896
614	NC_017042	ATT	2	6	23373	23378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480896
615	NC_017042	ATATT	2	10	23410	23419	40 %	60 %	0 %	0 %	383480896
616	NC_017042	GCA	3	9	23454	23462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480896
617	NC_017042	ATATA	2	10	23476	23485	60 %	40 %	0 %	0 %	383480896
618	NC_017042	CAT	2	6	23550	23555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480896
619	NC_017042	CAT	2	6	23583	23588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480896
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621	NC_017042	TCA	2	6	23613	23618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480896
622	NC_017042	ATA	2	6	23683	23688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480896
623	NC_017042	TAA	2	6	23764	23769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480896
624	NC_017042	AAT	2	6	23793	23798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480896
625	NC_017042	A	6	6	23824	23829	100 %	0 %	0 %	0 %	383480896
626	NC_017042	GGC	2	6	23847	23852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383480896
627	NC_017042	AAG	2	6	23854	23859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383480896
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629	NC_017042	GTA	2	6	23899	23904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480896
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