MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 33107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017042	GTA	2	6	212590	212595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481078
5502	NC_017042	AGAA	2	8	212596	212603	75 %	0 %	25 %	0 %	383481078
5503	NC_017042	GCTA	2	8	212604	212611	25 %	25 %	25 %	25 %	383481078
5504	NC_017042	TTTG	2	8	212615	212622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017042	TTG	2	6	212653	212658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017042	A	6	6	212720	212725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017042	T	7	7	212741	212747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017042	ATT	2	6	212748	212753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017042	T	6	6	212752	212757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017042	ACT	2	6	212780	212785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_017042	GTA	2	6	212822	212827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_017042	ATT	2	6	212872	212877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017042	AGC	2	6	212887	212892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_017042	T	6	6	212956	212961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017042	CTG	2	6	212998	213003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_017042	GTT	2	6	213023	213028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017042	ACT	2	6	213053	213058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481079
5518	NC_017042	TCA	2	6	213106	213111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481079
5519	NC_017042	AAATC	2	10	213142	213151	60 %	20 %	0 %	20 %	383481079
5520	NC_017042	TTG	2	6	213180	213185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481079
5521	NC_017042	TAA	2	6	213213	213218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481079
5522	NC_017042	TAA	3	9	213229	213237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481079
5523	NC_017042	TTA	2	6	213309	213314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481079
5524	NC_017042	TTA	2	6	213388	213393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481079
5525	NC_017042	GTTA	2	8	213418	213425	25 %	50 %	25 %	0 %	383481079
5526	NC_017042	ATTG	2	8	213430	213437	25 %	50 %	25 %	0 %	383481079
5527	NC_017042	AAG	2	6	213442	213447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481079
5528	NC_017042	ATT	2	6	213512	213517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481079
5529	NC_017042	ACT	2	6	213591	213596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481079
5530	NC_017042	TATG	2	8	213607	213614	25 %	50 %	25 %	0 %	383481079
5531	NC_017042	AGT	2	6	213617	213622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481079
5532	NC_017042	AAG	2	6	213630	213635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481079
5533	NC_017042	TTC	2	6	213704	213709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383481080
5534	NC_017042	ATA	2	6	213738	213743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481080
5535	NC_017042	GTA	2	6	213748	213753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481080
5536	NC_017042	GAA	2	6	213761	213766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481080
5537	NC_017042	CTA	2	6	213793	213798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481080
5538	NC_017042	TTA	2	6	213799	213804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481080
5539	NC_017042	ATT	2	6	213815	213820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481080
5540	NC_017042	AT	4	8	213870	213877	50 %	50 %	0 %	0 %	383481080
5541	NC_017042	A	6	6	213943	213948	100 %	0 %	0 %	0 %	383481080
5542	NC_017042	TAT	3	9	213986	213994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481080
5543	NC_017042	AGT	2	6	214041	214046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481080
5544	NC_017042	GTT	2	6	214051	214056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481080
5545	NC_017042	GCAA	2	8	214094	214101	50 %	0 %	25 %	25 %	383481080
5546	NC_017042	A	7	7	214100	214106	100 %	0 %	0 %	0 %	383481080
5547	NC_017042	ATG	2	6	214138	214143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481080
5548	NC_017042	T	6	6	214157	214162	0 %	100 %	0 %	0 %	383481080
5549	NC_017042	TAT	2	6	214172	214177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481080
5550	NC_017042	TTA	2	6	214194	214199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481080
5551	NC_017042	ATA	3	9	214210	214218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481080
5552	NC_017042	GCGA	2	8	214242	214249	25 %	0 %	50 %	25 %	383481080
5553	NC_017042	TTA	2	6	214269	214274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481080
5554	NC_017042	TTAAC	2	10	214279	214288	40 %	40 %	0 %	20 %	383481080
5555	NC_017042	CAA	2	6	214294	214299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481080
5556	NC_017042	TATAA	2	10	214371	214380	60 %	40 %	0 %	0 %	383481080
5557	NC_017042	TTG	2	6	214398	214403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481080
5558	NC_017042	GAT	2	6	214416	214421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481080
5559	NC_017042	TAA	2	6	214424	214429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481080
5560	NC_017042	GAA	2	6	214437	214442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481080
5561	NC_017042	ATTA	2	8	214445	214452	50 %	50 %	0 %	0 %	383481080
5562	NC_017042	ATA	2	6	214477	214482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481080
5563	NC_017042	AGTA	2	8	214637	214644	50 %	25 %	25 %	0 %	383481081
5564	NC_017042	TGC	2	6	214652	214657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481081
5565	NC_017042	GAT	2	6	214676	214681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481081
5566	NC_017042	TATT	2	8	214684	214691	25 %	75 %	0 %	0 %	383481081
5567	NC_017042	GCT	2	6	214725	214730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481081
5568	NC_017042	TTATA	2	10	214745	214754	40 %	60 %	0 %	0 %	383481081
5569	NC_017042	TAAA	2	8	214789	214796	75 %	25 %	0 %	0 %	383481081
5570	NC_017042	TAA	2	6	214820	214825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481081
5571	NC_017042	TAC	2	6	214830	214835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481081
5572	NC_017042	T	6	6	214895	214900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017042	TG	3	6	214945	214950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_017042	TAC	2	6	214993	214998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_017042	AAAT	2	8	215047	215054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_017042	AGC	2	6	215100	215105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481082
5577	NC_017042	CAA	2	6	215122	215127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481082
5578	NC_017042	TTA	2	6	215203	215208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481082
5579	NC_017042	TTA	2	6	215213	215218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481082
5580	NC_017042	AAAT	2	8	215219	215226	75 %	25 %	0 %	0 %	383481082
5581	NC_017042	CTG	2	6	215243	215248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481082
5582	NC_017042	ATG	2	6	215249	215254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481082
5583	NC_017042	CTTA	2	8	215289	215296	25 %	50 %	0 %	25 %	383481082
5584	NC_017042	AGA	2	6	215341	215346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481082
5585	NC_017042	TTA	2	6	215414	215419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481082
5586	NC_017042	T	6	6	215467	215472	0 %	100 %	0 %	0 %	383481082
5587	NC_017042	TA	3	6	215495	215500	50 %	50 %	0 %	0 %	383481082
5588	NC_017042	AAG	2	6	215542	215547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481082
5589	NC_017042	TAA	2	6	215562	215567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481082
5590	NC_017042	GAAA	2	8	215598	215605	75 %	0 %	25 %	0 %	383481082
5591	NC_017042	GCG	2	6	215735	215740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383481082
5592	NC_017042	T	6	6	215806	215811	0 %	100 %	0 %	0 %	383481082
5593	NC_017042	AAG	2	6	215832	215837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383481082
5594	NC_017042	CTTTGT	2	12	215955	215966	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383481082
5595	NC_017042	CAT	2	6	216106	216111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481082
5596	NC_017042	ATA	2	6	216134	216139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481082
5597	NC_017042	AT	3	6	216155	216160	50 %	50 %	0 %	0 %	383481082
5598	NC_017042	GCA	2	6	216169	216174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383481082
5599	NC_017042	TA	3	6	216265	216270	50 %	50 %	0 %	0 %	383481082
5600	NC_017042	TAC	2	6	216384	216389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481082
5601	NC_017042	TTTTA	2	10	216403	216412	20 %	80 %	0 %	0 %	383481082
5602	NC_017042	T	6	6	216529	216534	0 %	100 %	0 %	0 %	383481082
5603	NC_017042	GAG	2	6	216545	216550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383481082
5604	NC_017042	ATA	2	6	216719	216724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383481082
5605	NC_017042	A	8	8	216764	216771	100 %	0 %	0 %	0 %	383481082
5606	NC_017042	GAT	2	6	216892	216897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481082
5607	NC_017042	TA	3	6	216980	216985	50 %	50 %	0 %	0 %	383481082
5608	NC_017042	TGA	2	6	217038	217043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481082
5609	NC_017042	CAA	2	6	217189	217194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383481082
5610	NC_017042	T	7	7	217208	217214	0 %	100 %	0 %	0 %	383481082
5611	NC_017042	AT	3	6	217272	217277	50 %	50 %	0 %	0 %	383481082
5612	NC_017042	TTAA	2	8	217279	217286	50 %	50 %	0 %	0 %	383481082
5613	NC_017042	CTA	2	6	217298	217303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383481082
5614	NC_017042	T	6	6	217311	217316	0 %	100 %	0 %	0 %	383481082
5615	NC_017042	AGTT	2	8	217350	217357	25 %	50 %	25 %	0 %	383481082
5616	NC_017042	GTA	2	6	217408	217413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481082
5617	NC_017042	AG	3	6	217429	217434	50 %	0 %	50 %	0 %	383481082
5618	NC_017042	CTGT	2	8	217502	217509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5619	NC_017042	ATT	2	6	217620	217625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383481083
5620	NC_017042	GTA	2	6	217631	217636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383481083
5621	NC_017042	TGC	2	6	217769	217774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383481083
5622	NC_017042	TTG	2	6	217799	217804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383481083
5623	NC_017042	TC	3	6	217838	217843	0 %	50 %	0 %	50 %	383481083
5624	NC_017042	ATTT	2	8	217892	217899	25 %	75 %	0 %	0 %	383481083
5625	NC_017042	GCTTT	2	10	217979	217988	0 %	60 %	20 %	20 %	383481083
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5999	NC_017042	AAG	2	6	234251	234256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6000	NC_017042	TTA	2	6	234265	234270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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