MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack plasmid pMC5_1

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017041	GA	4	8	287	294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017041	CT	3	6	641	646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017041	AT	3	6	2072	2077	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
4	NC_017041	AT	3	6	2275	2280	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
5	NC_017041	AT	3	6	2551	2556	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
6	NC_017041	GA	3	6	3240	3245	50 %	0 %	50 %	0 %	383479188
7	NC_017041	AG	3	6	4491	4496	50 %	0 %	50 %	0 %	383479188
8	NC_017041	TA	3	6	5485	5490	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
9	NC_017041	TA	3	6	5530	5535	50 %	50 %	0 %	0 %	383479188
10	NC_017041	CT	3	6	5723	5728	0 %	50 %	0 %	50 %	383479188
11	NC_017041	AT	3	6	6161	6166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017041	AT	3	6	6493	6498	50 %	50 %	0 %	0 %	383479190
13	NC_017041	AT	3	6	6606	6611	50 %	50 %	0 %	0 %	383479190
14	NC_017041	TA	3	6	7480	7485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017041	TA	3	6	7526	7531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017041	TA	3	6	7554	7559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017041	TA	3	6	7634	7639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017041	CT	3	6	8357	8362	0 %	50 %	0 %	50 %	383479193
19	NC_017041	AT	3	6	8568	8573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017041	AG	3	6	8762	8767	50 %	0 %	50 %	0 %	383479194
21	NC_017041	GT	3	6	8877	8882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017041	AT	3	6	8985	8990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017041	AT	3	6	9154	9159	50 %	50 %	0 %	0 %	383479195
24	NC_017041	AG	3	6	9320	9325	50 %	0 %	50 %	0 %	383479195
25	NC_017041	AC	3	6	9448	9453	50 %	0 %	0 %	50 %	383479195
26	NC_017041	TA	3	6	10094	10099	50 %	50 %	0 %	0 %	383479195
27	NC_017041	TA	3	6	10144	10149	50 %	50 %	0 %	0 %	383479195
28	NC_017041	AT	3	6	10358	10363	50 %	50 %	0 %	0 %	383479195
29	NC_017041	AG	3	6	10375	10380	50 %	0 %	50 %	0 %	383479195
30	NC_017041	AG	3	6	10516	10521	50 %	0 %	50 %	0 %	383479195
31	NC_017041	GA	3	6	10906	10911	50 %	0 %	50 %	0 %	383479195
32	NC_017041	GC	3	6	10928	10933	0 %	0 %	50 %	50 %	383479195
33	NC_017041	AT	3	6	11094	11099	50 %	50 %	0 %	0 %	383479195
34	NC_017041	TA	3	6	11633	11638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017041	AT	3	6	11712	11717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017041	AT	3	6	11740	11745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017041	TA	3	6	11787	11792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017041	AG	3	6	13046	13051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017041	AT	4	8	14126	14133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017041	GT	3	6	14511	14516	0 %	50 %	50 %	0 %	383479196
41	NC_017041	AT	3	6	15271	15276	50 %	50 %	0 %	0 %	383479196
42	NC_017041	AG	3	6	15438	15443	50 %	0 %	50 %	0 %	383479197
43	NC_017041	AT	3	6	15959	15964	50 %	50 %	0 %	0 %	383479197
44	NC_017041	AT	3	6	16113	16118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017041	GT	3	6	16834	16839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017041	AT	3	6	16861	16866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017041	CA	3	6	16900	16905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017041	AT	3	6	17283	17288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017041	TG	3	6	17475	17480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017041	TA	3	6	17982	17987	50 %	50 %	0 %	0 %	383479200
51	NC_017041	AT	3	6	18116	18121	50 %	50 %	0 %	0 %	383479200
52	NC_017041	AT	4	8	18452	18459	50 %	50 %	0 %	0 %	383479202
53	NC_017041	AG	3	6	19969	19974	50 %	0 %	50 %	0 %	383479205
54	NC_017041	AT	3	6	20476	20481	50 %	50 %	0 %	0 %	383479205
55	NC_017041	AT	3	6	21083	21088	50 %	50 %	0 %	0 %	383479205
56	NC_017041	GA	4	8	21207	21214	50 %	0 %	50 %	0 %	383479205
57	NC_017041	AG	3	6	22369	22374	50 %	0 %	50 %	0 %	383479205
58	NC_017041	AG	3	6	22708	22713	50 %	0 %	50 %	0 %	383479205
59	NC_017041	TG	3	6	23951	23956	0 %	50 %	50 %	0 %	383479205
60	NC_017041	AG	3	6	24174	24179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017041	AT	3	6	25680	25685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017041	AT	3	6	25935	25940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017041	AT	3	6	26135	26140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.