MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 plasmid pRMB

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016939	AT	4	8	343	350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016939	TA	3	6	396	401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016939	AT	3	6	698	703	50 %	50 %	0 %	0 %	378750099
4	NC_016939	AT	3	6	771	776	50 %	50 %	0 %	0 %	378750099
5	NC_016939	AG	3	6	954	959	50 %	0 %	50 %	0 %	378750099
6	NC_016939	TA	3	6	1314	1319	50 %	50 %	0 %	0 %	378750100
7	NC_016939	AT	4	8	1323	1330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016939	AT	3	6	1647	1652	50 %	50 %	0 %	0 %	378750101
9	NC_016939	AG	3	6	1693	1698	50 %	0 %	50 %	0 %	378750101
10	NC_016939	TA	3	6	2714	2719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016939	TG	3	6	2748	2753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016939	AG	3	6	2876	2881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016939	AT	3	6	3330	3335	50 %	50 %	0 %	0 %	378750102
14	NC_016939	AT	3	6	3382	3387	50 %	50 %	0 %	0 %	378750102
15	NC_016939	AT	3	6	4499	4504	50 %	50 %	0 %	0 %	378750102
16	NC_016939	TA	3	6	4654	4659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016939	AG	3	6	4816	4821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016939	AT	3	6	4970	4975	50 %	50 %	0 %	0 %	378750103
19	NC_016939	TA	3	6	5258	5263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016939	CT	3	6	5555	5560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016939	AT	3	6	5879	5884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016939	AT	3	6	6908	6913	50 %	50 %	0 %	0 %	378750104
23	NC_016939	AT	3	6	7226	7231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016939	CT	4	8	7419	7426	0 %	50 %	0 %	50 %	378750105
25	NC_016939	AT	3	6	7647	7652	50 %	50 %	0 %	0 %	378750105
26	NC_016939	TA	3	6	7851	7856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016939	TA	3	6	8184	8189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016939	TA	3	6	8212	8217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016939	AT	3	6	8261	8266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016939	CA	3	6	8462	8467	50 %	0 %	0 %	50 %	378750106
31	NC_016939	AG	3	6	8643	8648	50 %	0 %	50 %	0 %	378750106
32	NC_016939	TA	3	6	8688	8693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016939	CA	3	6	8797	8802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016939	GA	3	6	9047	9052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016939	AT	3	6	9221	9226	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
36	NC_016939	AT	3	6	9492	9497	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
37	NC_016939	AT	4	8	9537	9544	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
38	NC_016939	AT	3	6	10216	10221	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
39	NC_016939	AT	3	6	10363	10368	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
40	NC_016939	CT	3	6	10556	10561	0 %	50 %	0 %	50 %	378750107
41	NC_016939	TA	3	6	10646	10651	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
42	NC_016939	AT	3	6	10654	10659	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
43	NC_016939	TA	3	6	11050	11055	50 %	50 %	0 %	0 %	378750107
44	NC_016939	CT	3	6	12348	12353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016939	CT	3	6	12579	12584	0 %	50 %	0 %	50 %	378750109
46	NC_016939	TC	3	6	12896	12901	0 %	50 %	0 %	50 %	378750109
47	NC_016939	AT	3	6	13352	13357	50 %	50 %	0 %	0 %	378750109
48	NC_016939	AT	3	6	13476	13481	50 %	50 %	0 %	0 %	378750109
49	NC_016939	TA	3	6	13690	13695	50 %	50 %	0 %	0 %	378750109
50	NC_016939	AT	3	6	13890	13895	50 %	50 %	0 %	0 %	378750109
51	NC_016939	TA	3	6	14941	14946	50 %	50 %	0 %	0 %	378750109

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.