MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016931	GCGA	2	8	134982	134989	25 %	0 %	50 %	25 %	379713215
3502	NC_016931	TTA	2	6	135009	135014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713215
3503	NC_016931	TTAAC	2	10	135019	135028	40 %	40 %	0 %	20 %	379713215
3504	NC_016931	AGC	2	6	135032	135037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713215
3505	NC_016931	TATAA	2	10	135111	135120	60 %	40 %	0 %	0 %	379713215
3506	NC_016931	GAT	2	6	135156	135161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713215
3507	NC_016931	TAA	2	6	135164	135169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713215
3508	NC_016931	GAA	2	6	135177	135182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713215
3509	NC_016931	ATTA	2	8	135185	135192	50 %	50 %	0 %	0 %	379713215
3510	NC_016931	ATA	2	6	135217	135222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713215
3511	NC_016931	AGTA	2	8	135377	135384	50 %	25 %	25 %	0 %	379713216
3512	NC_016931	TGC	2	6	135392	135397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713216
3513	NC_016931	GAT	2	6	135416	135421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713216
3514	NC_016931	TATT	2	8	135424	135431	25 %	75 %	0 %	0 %	379713216
3515	NC_016931	GCT	2	6	135465	135470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713216
3516	NC_016931	TTATA	2	10	135485	135494	40 %	60 %	0 %	0 %	379713216
3517	NC_016931	TAAA	2	8	135529	135536	75 %	25 %	0 %	0 %	379713216
3518	NC_016931	TAA	2	6	135560	135565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713216
3519	NC_016931	TAC	2	6	135570	135575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713216
3520	NC_016931	AAAT	2	8	135655	135662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_016931	AGC	2	6	135708	135713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713217
3522	NC_016931	CAA	2	6	135730	135735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713217
3523	NC_016931	TTA	2	6	135811	135816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713217
3524	NC_016931	TTA	2	6	135821	135826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713217
3525	NC_016931	AAAT	2	8	135827	135834	75 %	25 %	0 %	0 %	379713217
3526	NC_016931	CTG	2	6	135851	135856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713217
3527	NC_016931	ATG	2	6	135857	135862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713217
3528	NC_016931	CTTA	2	8	135897	135904	25 %	50 %	0 %	25 %	379713217
3529	NC_016931	AGA	2	6	135949	135954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713217
3530	NC_016931	TTA	2	6	136022	136027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713217
3531	NC_016931	T	6	6	136075	136080	0 %	100 %	0 %	0 %	379713217
3532	NC_016931	TA	3	6	136103	136108	50 %	50 %	0 %	0 %	379713217
3533	NC_016931	AAG	2	6	136150	136155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713217
3534	NC_016931	TAA	2	6	136170	136175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713217
3535	NC_016931	GAAA	2	8	136206	136213	75 %	0 %	25 %	0 %	379713217
3536	NC_016931	GCG	2	6	136343	136348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379713217
3537	NC_016931	T	6	6	136414	136419	0 %	100 %	0 %	0 %	379713217
3538	NC_016931	AAG	2	6	136440	136445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713217
3539	NC_016931	CAG	2	6	136505	136510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713217
3540	NC_016931	CTTTGT	2	12	136563	136574	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379713217
3541	NC_016931	CAT	2	6	136714	136719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713217
3542	NC_016931	ATA	2	6	136742	136747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713217
3543	NC_016931	AT	3	6	136763	136768	50 %	50 %	0 %	0 %	379713217
3544	NC_016931	GCA	2	6	136777	136782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713217
3545	NC_016931	TA	3	6	136873	136878	50 %	50 %	0 %	0 %	379713217
3546	NC_016931	TAC	2	6	136992	136997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713217
3547	NC_016931	TTTTA	2	10	137011	137020	20 %	80 %	0 %	0 %	379713217
3548	NC_016931	T	6	6	137137	137142	0 %	100 %	0 %	0 %	379713217
3549	NC_016931	GAG	2	6	137153	137158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713217
3550	NC_016931	ATA	2	6	137327	137332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713217
3551	NC_016931	A	8	8	137372	137379	100 %	0 %	0 %	0 %	379713217
3552	NC_016931	GAT	2	6	137500	137505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713217
3553	NC_016931	TA	3	6	137588	137593	50 %	50 %	0 %	0 %	379713217
3554	NC_016931	TGA	2	6	137646	137651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713217
3555	NC_016931	CAA	2	6	137797	137802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713217
3556	NC_016931	T	7	7	137816	137822	0 %	100 %	0 %	0 %	379713217
3557	NC_016931	AT	3	6	137880	137885	50 %	50 %	0 %	0 %	379713217
3558	NC_016931	TTAA	2	8	137887	137894	50 %	50 %	0 %	0 %	379713217
3559	NC_016931	CTA	2	6	137906	137911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713217
3560	NC_016931	T	6	6	137919	137924	0 %	100 %	0 %	0 %	379713217
3561	NC_016931	GTA	2	6	138016	138021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713217
3562	NC_016931	AG	3	6	138037	138042	50 %	0 %	50 %	0 %	379713217
3563	NC_016931	GTA	2	6	138239	138244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713218
3564	NC_016931	TGC	2	6	138377	138382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713218
3565	NC_016931	TTG	2	6	138407	138412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713218
3566	NC_016931	TC	3	6	138446	138451	0 %	50 %	0 %	50 %	379713218
3567	NC_016931	ATTT	2	8	138500	138507	25 %	75 %	0 %	0 %	379713218
3568	NC_016931	GCTTT	2	10	138587	138596	0 %	60 %	20 %	20 %	379713218
3569	NC_016931	TAA	2	6	138600	138605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713218
3570	NC_016931	AATT	2	8	138611	138618	50 %	50 %	0 %	0 %	379713218
3571	NC_016931	TTGCTA	2	12	138653	138664	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379713218
3572	NC_016931	GAT	2	6	138694	138699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713218
3573	NC_016931	AAAG	2	8	138702	138709	75 %	0 %	25 %	0 %	379713218
3574	NC_016931	TAAA	2	8	138716	138723	75 %	25 %	0 %	0 %	379713218
3575	NC_016931	A	8	8	138721	138728	100 %	0 %	0 %	0 %	379713218
3576	NC_016931	TGA	2	6	138762	138767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713218
3577	NC_016931	AT	3	6	138799	138804	50 %	50 %	0 %	0 %	379713218
3578	NC_016931	AAGATA	2	12	138818	138829	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379713218
3579	NC_016931	AT	3	6	138882	138887	50 %	50 %	0 %	0 %	379713218
3580	NC_016931	CTTTAG	2	12	138980	138991	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379713218
3581	NC_016931	GATG	2	8	139012	139019	25 %	25 %	50 %	0 %	379713218
3582	NC_016931	AGT	2	6	139053	139058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713218
3583	NC_016931	TAA	2	6	139106	139111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713218
3584	NC_016931	TATGT	2	10	139237	139246	20 %	60 %	20 %	0 %	379713218
3585	NC_016931	T	6	6	139246	139251	0 %	100 %	0 %	0 %	379713218
3586	NC_016931	TA	3	6	139297	139302	50 %	50 %	0 %	0 %	379713218
3587	NC_016931	TGC	2	6	139461	139466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713218
3588	NC_016931	TCCG	2	8	139467	139474	0 %	25 %	25 %	50 %	379713218
3589	NC_016931	TCTT	2	8	139494	139501	0 %	75 %	0 %	25 %	379713218
3590	NC_016931	ATT	2	6	139559	139564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713218
3591	NC_016931	AT	3	6	139574	139579	50 %	50 %	0 %	0 %	379713218
3592	NC_016931	T	6	6	139620	139625	0 %	100 %	0 %	0 %	379713218
3593	NC_016931	TTTAGT	2	12	139639	139650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379713218
3594	NC_016931	CCA	2	6	139654	139659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379713218
3595	NC_016931	TATT	2	8	139662	139669	25 %	75 %	0 %	0 %	379713218
3596	NC_016931	ATG	2	6	139699	139704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713218
3597	NC_016931	TGC	2	6	139749	139754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713218
3598	NC_016931	CTC	2	6	139814	139819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379713218
3599	NC_016931	ATT	2	6	139856	139861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713218
3600	NC_016931	TGG	2	6	139907	139912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713218
3601	NC_016931	AGA	2	6	140004	140009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713218
3602	NC_016931	TAA	2	6	140061	140066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713218
3603	NC_016931	GAT	2	6	140074	140079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713218
3604	NC_016931	AGT	2	6	140262	140267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713218
3605	NC_016931	TGT	2	6	140282	140287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713218
3606	NC_016931	AT	3	6	140324	140329	50 %	50 %	0 %	0 %	379713218
3607	NC_016931	GTTA	2	8	140337	140344	25 %	50 %	25 %	0 %	379713218
3608	NC_016931	TAG	2	6	140379	140384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713218
3609	NC_016931	AGCT	2	8	140387	140394	25 %	25 %	25 %	25 %	379713218
3610	NC_016931	TGC	2	6	140400	140405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713218
3611	NC_016931	TAA	2	6	140430	140435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713218
3612	NC_016931	GCAA	2	8	140451	140458	50 %	0 %	25 %	25 %	379713218
3613	NC_016931	TGC	2	6	140496	140501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713218
3614	NC_016931	G	6	6	140508	140513	0 %	0 %	100 %	0 %	379713218
3615	NC_016931	AGG	2	6	140532	140537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713218
3616	NC_016931	GGA	2	6	140566	140571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713218
3617	NC_016931	ATA	2	6	140612	140617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713218
3618	NC_016931	TGC	2	6	140619	140624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713218
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3620	NC_016931	TCT	2	6	140671	140676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713218
3621	NC_016931	AGT	2	6	140704	140709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713218
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3999	NC_016931	ATA	2	6	157116	157121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_016931	TTTATC	2	12	157235	157246	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379713226

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