MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 32225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_016931	GTT	2	6	1236917	1236922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714259
31503	NC_016931	GATAAA	2	12	1236958	1236969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31504	NC_016931	CGT	2	6	1237031	1237036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31505	NC_016931	CGCTC	2	10	1237073	1237082	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31506	NC_016931	TTC	2	6	1237132	1237137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31507	NC_016931	AAT	2	6	1237152	1237157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31508	NC_016931	A	7	7	1237200	1237206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31509	NC_016931	ATT	2	6	1237217	1237222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31510	NC_016931	GTG	2	6	1237234	1237239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31511	NC_016931	TTA	2	6	1237251	1237256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31512	NC_016931	ATA	2	6	1237261	1237266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31513	NC_016931	ATT	2	6	1237308	1237313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31514	NC_016931	TTA	2	6	1237335	1237340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31515	NC_016931	TTA	2	6	1237352	1237357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714260
31516	NC_016931	A	6	6	1237431	1237436	100 %	0 %	0 %	0 %	379714260
31517	NC_016931	TAAAAA	2	12	1237440	1237451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379714260
31518	NC_016931	A	8	8	1237447	1237454	100 %	0 %	0 %	0 %	379714260
31519	NC_016931	TA	3	6	1237471	1237476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31520	NC_016931	AATA	2	8	1237528	1237535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31521	NC_016931	TAT	2	6	1237585	1237590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31522	NC_016931	AGG	2	6	1237672	1237677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714261
31523	NC_016931	GCAATT	2	12	1237679	1237690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379714261
31524	NC_016931	TTAT	2	8	1237707	1237714	25 %	75 %	0 %	0 %	379714261
31525	NC_016931	AAC	2	6	1237717	1237722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714261
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31527	NC_016931	TAA	2	6	1237891	1237896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714261
31528	NC_016931	GAAT	2	8	1237953	1237960	50 %	25 %	25 %	0 %	379714261
31529	NC_016931	A	7	7	1237984	1237990	100 %	0 %	0 %	0 %	379714261
31530	NC_016931	CAA	2	6	1237991	1237996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714261
31531	NC_016931	CAAA	2	8	1238048	1238055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31532	NC_016931	A	6	6	1238099	1238104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31533	NC_016931	AGA	2	6	1238225	1238230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31534	NC_016931	ATT	3	9	1238238	1238246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31535	NC_016931	TA	3	6	1238304	1238309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31536	NC_016931	TA	3	6	1238319	1238324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31537	NC_016931	T	6	6	1238349	1238354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31538	NC_016931	GTA	2	6	1238363	1238368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31539	NC_016931	TAT	2	6	1238369	1238374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31540	NC_016931	A	6	6	1238381	1238386	100 %	0 %	0 %	0 %	379714262
31541	NC_016931	GCA	2	6	1238412	1238417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714262
31542	NC_016931	TAT	2	6	1238436	1238441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714262
31543	NC_016931	AT	3	6	1238446	1238451	50 %	50 %	0 %	0 %	379714262
31544	NC_016931	T	6	6	1238471	1238476	0 %	100 %	0 %	0 %	379714262
31545	NC_016931	CAC	2	6	1238481	1238486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714262
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31548	NC_016931	TTTG	2	8	1238571	1238578	0 %	75 %	25 %	0 %	379714262
31549	NC_016931	GCA	2	6	1238594	1238599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714262
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31552	NC_016931	ATT	2	6	1238714	1238719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714262
31553	NC_016931	TAAAA	2	10	1238773	1238782	80 %	20 %	0 %	0 %	379714262
31554	NC_016931	AGA	2	6	1238824	1238829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714262
31555	NC_016931	GTA	2	6	1238930	1238935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714262
31556	NC_016931	CTT	2	6	1238996	1239001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714262
31557	NC_016931	ATT	2	6	1239063	1239068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714262
31558	NC_016931	TA	3	6	1239140	1239145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31559	NC_016931	TGC	2	6	1239146	1239151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31560	NC_016931	CT	3	6	1239185	1239190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31561	NC_016931	T	6	6	1239216	1239221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31562	NC_016931	TTA	2	6	1239235	1239240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31563	NC_016931	ATT	2	6	1239253	1239258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31564	NC_016931	CTT	2	6	1239264	1239269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31565	NC_016931	T	6	6	1239300	1239305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31566	NC_016931	AATA	2	8	1239384	1239391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31569	NC_016931	GAC	2	6	1239545	1239550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31572	NC_016931	CAT	2	6	1239690	1239695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714263
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31580	NC_016931	ATTG	2	8	1239881	1239888	25 %	50 %	25 %	0 %	379714263
31581	NC_016931	GCTT	2	8	1239890	1239897	0 %	50 %	25 %	25 %	379714263
31582	NC_016931	TA	3	6	1239932	1239937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31583	NC_016931	T	6	6	1239986	1239991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31586	NC_016931	T	7	7	1240124	1240130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31587	NC_016931	TAT	2	6	1240168	1240173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31590	NC_016931	ATT	2	6	1240229	1240234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31591	NC_016931	TA	3	6	1240237	1240242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31592	NC_016931	CAATTT	2	12	1240261	1240272	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31593	NC_016931	T	10	10	1240270	1240279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31594	NC_016931	ATTG	2	8	1240289	1240296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31595	NC_016931	ATT	2	6	1240309	1240314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31596	NC_016931	AT	3	6	1240351	1240356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31597	NC_016931	TAAC	2	8	1240365	1240372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31598	NC_016931	TTA	2	6	1240424	1240429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31599	NC_016931	TA	3	6	1240428	1240433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31600	NC_016931	AT	3	6	1240507	1240512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31601	NC_016931	TTA	2	6	1240544	1240549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31603	NC_016931	TTTA	2	8	1240615	1240622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31604	NC_016931	TC	3	6	1240644	1240649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31605	NC_016931	ATA	2	6	1240655	1240660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31606	NC_016931	TAT	2	6	1240675	1240680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31607	NC_016931	ATTA	2	8	1240711	1240718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31608	NC_016931	GCT	2	6	1240760	1240765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31609	NC_016931	TA	3	6	1240864	1240869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31610	NC_016931	ATA	2	6	1240934	1240939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31612	NC_016931	TTC	2	6	1240999	1241004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31613	NC_016931	AAG	2	6	1241014	1241019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31614	NC_016931	AG	3	6	1241038	1241043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31615	NC_016931	TCA	2	6	1241054	1241059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31616	NC_016931	CGG	2	6	1241100	1241105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31617	NC_016931	TGATTA	2	12	1241174	1241185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31618	NC_016931	AAT	2	6	1241272	1241277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31619	NC_016931	AGT	2	6	1241287	1241292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31620	NC_016931	CTC	2	6	1241301	1241306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31621	NC_016931	AT	3	6	1241435	1241440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31622	NC_016931	TGA	2	6	1241446	1241451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31623	NC_016931	A	6	6	1241499	1241504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31624	NC_016931	GCC	2	6	1241565	1241570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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31626	NC_016931	CT	3	6	1241627	1241632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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