MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 1200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016930	TTTTA	2	10	2536	2545	20 %	80 %	0 %	0 %	379711746
2	NC_016930	ATTTA	2	10	2889	2898	40 %	60 %	0 %	0 %	379711746
3	NC_016930	GGTCA	2	10	4136	4145	20 %	20 %	40 %	20 %	379711747
4	NC_016930	TAAAT	2	10	4845	4854	60 %	40 %	0 %	0 %	379711747
5	NC_016930	GTAGT	2	10	5171	5180	20 %	40 %	40 %	0 %	379711747
6	NC_016930	ACTTT	2	10	6503	6512	20 %	60 %	0 %	20 %	379711749
7	NC_016930	AATAC	2	10	7044	7053	60 %	20 %	0 %	20 %	379711749
8	NC_016930	ATCCA	2	10	7540	7549	40 %	20 %	0 %	40 %	379711750
9	NC_016930	AATTA	2	10	9107	9116	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016930	AGAAT	2	10	10835	10844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016930	GAATT	2	10	11190	11199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016930	TAACG	2	10	12134	12143	40 %	20 %	20 %	20 %	379711755
13	NC_016930	CGCTC	2	10	12313	12322	0 %	20 %	20 %	60 %	379711755
14	NC_016930	GGCTC	2	10	12850	12859	0 %	20 %	40 %	40 %	379711756
15	NC_016930	AGCAG	2	10	13275	13284	40 %	0 %	40 %	20 %	379711756
16	NC_016930	TTAAT	2	10	13418	13427	40 %	60 %	0 %	0 %	379711756
17	NC_016930	TAACT	2	10	14701	14710	40 %	40 %	0 %	20 %	379711759
18	NC_016930	ATTTA	2	10	16355	16364	40 %	60 %	0 %	0 %	379711761
19	NC_016930	TTTTA	2	10	17123	17132	20 %	80 %	0 %	0 %	379711761
20	NC_016930	TTTAA	2	10	18497	18506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016930	TCAAG	2	10	19525	19534	40 %	20 %	20 %	20 %	379711763
22	NC_016930	ATAAA	2	10	19579	19588	80 %	20 %	0 %	0 %	379711763
23	NC_016930	AGAAA	2	10	19841	19850	80 %	0 %	20 %	0 %	379711763
24	NC_016930	AAAGC	2	10	20097	20106	60 %	0 %	20 %	20 %	379711763
25	NC_016930	GAATA	2	10	20303	20312	60 %	20 %	20 %	0 %	379711763
26	NC_016930	TAATA	2	10	21044	21053	60 %	40 %	0 %	0 %	379711763
27	NC_016930	CAAAG	2	10	21136	21145	60 %	0 %	20 %	20 %	379711763
28	NC_016930	TTAGT	2	10	21319	21328	20 %	60 %	20 %	0 %	379711763
29	NC_016930	AGCAG	2	10	21462	21471	40 %	0 %	40 %	20 %	379711763
30	NC_016930	TACCT	2	10	22793	22802	20 %	40 %	0 %	40 %	379711763
31	NC_016930	TATAA	2	10	24272	24281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016930	ATATT	2	10	25822	25831	40 %	60 %	0 %	0 %	379711766
33	NC_016930	ATATT	2	10	25860	25869	40 %	60 %	0 %	0 %	379711766
34	NC_016930	AAATA	2	10	26308	26317	80 %	20 %	0 %	0 %	379711767
35	NC_016930	TTTGT	2	10	27731	27740	0 %	80 %	20 %	0 %	379711770
36	NC_016930	TCATT	2	10	29510	29519	20 %	60 %	0 %	20 %	379711774
37	NC_016930	TAGTA	2	10	30312	30321	40 %	40 %	20 %	0 %	379711774
38	NC_016930	AAGTG	2	10	32975	32984	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016930	ATTTT	2	10	32987	32996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016930	TTAAT	2	10	34690	34699	40 %	60 %	0 %	0 %	379711779
41	NC_016930	TGAGT	2	10	34717	34726	20 %	40 %	40 %	0 %	379711780
42	NC_016930	TTAGT	2	10	37236	37245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016930	CTTTT	2	10	39294	39303	0 %	80 %	0 %	20 %	379711784
44	NC_016930	TTATT	2	10	39701	39710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016930	TTTTA	2	10	39805	39814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016930	AGTTG	2	10	40553	40562	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016930	TAAGT	2	10	43103	43112	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016930	GAGAG	2	10	43780	43789	40 %	0 %	60 %	0 %	379711789
49	NC_016930	CAAAC	2	10	43832	43841	60 %	0 %	0 %	40 %	379711789
50	NC_016930	ACGTA	2	10	44002	44011	40 %	20 %	20 %	20 %	379711789
51	NC_016930	TAACT	2	10	44273	44282	40 %	40 %	0 %	20 %	379711790
52	NC_016930	AGAAA	2	10	44883	44892	80 %	0 %	20 %	0 %	379711791
53	NC_016930	GTTTC	2	10	45323	45332	0 %	60 %	20 %	20 %	379711791
54	NC_016930	ATTTT	2	10	45872	45881	20 %	80 %	0 %	0 %	379711791
55	NC_016930	AAGAG	2	10	47126	47135	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016930	AGTAC	2	10	47583	47592	40 %	20 %	20 %	20 %	379711794
57	NC_016930	TTTAA	2	10	47801	47810	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016930	TTTCT	2	10	48874	48883	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016930	CATTA	2	10	49925	49934	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016930	TTGAT	2	10	51834	51843	20 %	60 %	20 %	0 %	379711797
61	NC_016930	TAAAG	2	10	52861	52870	60 %	20 %	20 %	0 %	379711797
62	NC_016930	ATTAT	2	10	52934	52943	40 %	60 %	0 %	0 %	379711797
63	NC_016930	TTTGC	2	10	55424	55433	0 %	60 %	20 %	20 %	379711800
64	NC_016930	ATTAT	2	10	56557	56566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016930	TCGGT	2	10	58402	58411	0 %	40 %	40 %	20 %	379711805
66	NC_016930	GCTTT	2	10	59828	59837	0 %	60 %	20 %	20 %	379711806
67	NC_016930	TAAAA	2	10	63959	63968	80 %	20 %	0 %	0 %	379711810
68	NC_016930	ACTTT	2	10	66991	67000	20 %	60 %	0 %	20 %	379711814
69	NC_016930	GCTTA	2	10	67180	67189	20 %	40 %	20 %	20 %	379711814
70	NC_016930	CATTT	2	10	67883	67892	20 %	60 %	0 %	20 %	379711814
71	NC_016930	TTAAA	2	10	67908	67917	60 %	40 %	0 %	0 %	379711814
72	NC_016930	TAAAT	2	10	67986	67995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016930	ACATA	2	10	70714	70723	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016930	TTTCT	2	10	73480	73489	0 %	80 %	0 %	20 %	379711821
75	NC_016930	ATTTA	2	10	73894	73903	40 %	60 %	0 %	0 %	379711822
76	NC_016930	AAAAG	2	10	74670	74679	80 %	0 %	20 %	0 %	379711822
77	NC_016930	GGGTT	2	10	74880	74889	0 %	40 %	60 %	0 %	379711822
78	NC_016930	TTTAT	2	10	75256	75265	20 %	80 %	0 %	0 %	379711822
79	NC_016930	GCTTA	2	10	76496	76505	20 %	40 %	20 %	20 %	379711823
80	NC_016930	ACAAT	2	10	76860	76869	60 %	20 %	0 %	20 %	379711824
81	NC_016930	GTTAT	2	10	77485	77494	20 %	60 %	20 %	0 %	379711825
82	NC_016930	GTAGA	2	10	77791	77800	40 %	20 %	40 %	0 %	379711825
83	NC_016930	CAATG	2	10	80143	80152	40 %	20 %	20 %	20 %	379711827
84	NC_016930	ATAAA	2	10	80606	80615	80 %	20 %	0 %	0 %	379711828
85	NC_016930	ATTAT	2	10	81041	81050	40 %	60 %	0 %	0 %	379711828
86	NC_016930	ATTAA	2	10	81312	81321	60 %	40 %	0 %	0 %	379711828
87	NC_016930	ATACA	2	10	81513	81522	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016930	GAAAA	2	10	81841	81850	80 %	0 %	20 %	0 %	379711829
89	NC_016930	AATTA	2	10	82283	82292	60 %	40 %	0 %	0 %	379711829
90	NC_016930	TTAAA	2	10	85297	85306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016930	CGCAT	3	15	89575	89589	20 %	20 %	20 %	40 %	379711835
92	NC_016930	TGAAA	2	10	92805	92814	60 %	20 %	20 %	0 %	379711837
93	NC_016930	TTGAT	2	10	94485	94494	20 %	60 %	20 %	0 %	379711840
94	NC_016930	ACTAT	2	10	95111	95120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016930	TAATA	2	10	95129	95138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016930	TTGTA	2	10	95267	95276	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016930	ATTTA	2	10	96206	96215	40 %	60 %	0 %	0 %	379711842
98	NC_016930	CATTT	2	10	96422	96431	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016930	AATTA	2	10	96572	96581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016930	TCAAA	2	10	97860	97869	60 %	20 %	0 %	20 %	379711844
101	NC_016930	TTAAT	2	10	98578	98587	40 %	60 %	0 %	0 %	379711845
102	NC_016930	AAACT	2	10	101152	101161	60 %	20 %	0 %	20 %	379711847
103	NC_016930	TTAGT	2	10	101500	101509	20 %	60 %	20 %	0 %	379711848
104	NC_016930	CCAAA	2	10	103939	103948	60 %	0 %	0 %	40 %	379711851
105	NC_016930	TTTAT	2	10	104329	104338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016930	CGGAT	2	10	104486	104495	20 %	20 %	40 %	20 %	379711852
107	NC_016930	TAATA	2	10	105243	105252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016930	TTGAT	2	10	105944	105953	20 %	60 %	20 %	0 %	379711853
109	NC_016930	ATTAT	2	10	106125	106134	40 %	60 %	0 %	0 %	379711853
110	NC_016930	TTTGA	2	10	109840	109849	20 %	60 %	20 %	0 %	379711853
111	NC_016930	TGCTT	2	10	109935	109944	0 %	60 %	20 %	20 %	379711853
112	NC_016930	GCAAA	2	10	111814	111823	60 %	0 %	20 %	20 %	379711854
113	NC_016930	TGGAT	2	10	113769	113778	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016930	TTAGT	2	10	116519	116528	20 %	60 %	20 %	0 %	379711859
115	NC_016930	ATAAA	2	10	117736	117745	80 %	20 %	0 %	0 %	379711859
116	NC_016930	AAGTA	2	10	118342	118351	60 %	20 %	20 %	0 %	379711860
117	NC_016930	ATTCG	2	10	120175	120184	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016930	AGATT	2	10	120193	120202	40 %	40 %	20 %	0 %	379711862
119	NC_016930	TAAAA	2	10	120510	120519	80 %	20 %	0 %	0 %	379711863
120	NC_016930	TTTAA	2	10	121282	121291	40 %	60 %	0 %	0 %	379711863
121	NC_016930	GTTAC	2	10	122371	122380	20 %	40 %	20 %	20 %	379711865
122	NC_016930	TGAAA	2	10	122732	122741	60 %	20 %	20 %	0 %	379711865
123	NC_016930	AGCTA	2	10	123157	123166	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016930	GCAAG	2	10	123390	123399	40 %	0 %	40 %	20 %	379711866
125	NC_016930	TTAAA	2	10	125333	125342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016930	CTTGT	2	10	125823	125832	0 %	60 %	20 %	20 %	379711870
127	NC_016930	AGTAT	2	10	126130	126139	40 %	40 %	20 %	0 %	379711870
128	NC_016930	ATGAT	2	10	126882	126891	40 %	40 %	20 %	0 %	379711871
129	NC_016930	CTTGT	2	10	127220	127229	0 %	60 %	20 %	20 %	379711872
130	NC_016930	TATTT	2	10	127646	127655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016930	TCTTT	2	10	128781	128790	0 %	80 %	0 %	20 %	379711875
132	NC_016930	TTGCT	2	10	129021	129030	0 %	60 %	20 %	20 %	379711876
133	NC_016930	CGCTC	2	10	129614	129623	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_016930	AACCT	2	10	129810	129819	40 %	20 %	0 %	40 %	379711878
135	NC_016930	TTAAC	2	10	131830	131839	40 %	40 %	0 %	20 %	379711881
136	NC_016930	TATAA	2	10	131922	131931	60 %	40 %	0 %	0 %	379711881
137	NC_016930	TTATA	2	10	132296	132305	40 %	60 %	0 %	0 %	379711882
138	NC_016930	TTTTA	2	10	133949	133958	20 %	80 %	0 %	0 %	379711883
139	NC_016930	GCTTT	2	10	135525	135534	0 %	60 %	20 %	20 %	379711884
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