MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 3816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016930	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016930	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016930	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	379711746
4	NC_016930	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	379711746
5	NC_016930	AACT	2	8	3302	3309	50 %	25 %	0 %	25 %	379711747
6	NC_016930	CAAA	2	8	3348	3355	75 %	0 %	0 %	25 %	379711747
7	NC_016930	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	379711747
8	NC_016930	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	379711747
9	NC_016930	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	379711747
10	NC_016930	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	379711747
11	NC_016930	TAAA	2	8	6327	6334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016930	ATAA	2	8	6784	6791	75 %	25 %	0 %	0 %	379711749
13	NC_016930	ACTT	2	8	7166	7173	25 %	50 %	0 %	25 %	379711750
14	NC_016930	ATTT	2	8	7573	7580	25 %	75 %	0 %	0 %	379711750
15	NC_016930	CTGT	2	8	8009	8016	0 %	50 %	25 %	25 %	379711751
16	NC_016930	CCTC	2	8	9841	9848	0 %	25 %	0 %	75 %	379711753
17	NC_016930	CAAT	2	8	9888	9895	50 %	25 %	0 %	25 %	379711753
18	NC_016930	ATTA	2	8	10888	10895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016930	ATTA	2	8	11102	11109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016930	ATCT	2	8	11408	11415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016930	GATT	2	8	11857	11864	25 %	50 %	25 %	0 %	379711755
22	NC_016930	AAAT	2	8	11865	11872	75 %	25 %	0 %	0 %	379711755
23	NC_016930	AATT	2	8	11892	11899	50 %	50 %	0 %	0 %	379711755
24	NC_016930	TTAA	2	8	12073	12080	50 %	50 %	0 %	0 %	379711755
25	NC_016930	ATGA	2	8	12772	12779	50 %	25 %	25 %	0 %	379711756
26	NC_016930	TAAA	2	8	13795	13802	75 %	25 %	0 %	0 %	379711757
27	NC_016930	TAAA	2	8	13954	13961	75 %	25 %	0 %	0 %	379711757
28	NC_016930	TCAT	2	8	14075	14082	25 %	50 %	0 %	25 %	379711757
29	NC_016930	CTTT	2	8	14209	14216	0 %	75 %	0 %	25 %	379711757
30	NC_016930	TTAG	2	8	14451	14458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016930	GCAA	2	8	14549	14556	50 %	0 %	25 %	25 %	379711758
32	NC_016930	TCTT	2	8	14626	14633	0 %	75 %	0 %	25 %	379711758
33	NC_016930	AGTA	2	8	14884	14891	50 %	25 %	25 %	0 %	379711759
34	NC_016930	GCTT	2	8	15410	15417	0 %	50 %	25 %	25 %	379711760
35	NC_016930	AATT	2	8	15759	15766	50 %	50 %	0 %	0 %	379711760
36	NC_016930	TTGC	2	8	16032	16039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016930	AATA	2	8	16383	16390	75 %	25 %	0 %	0 %	379711761
38	NC_016930	TCTA	2	8	16850	16857	25 %	50 %	0 %	25 %	379711761
39	NC_016930	ACGT	2	8	17273	17280	25 %	25 %	25 %	25 %	379711761
40	NC_016930	CTTG	2	8	17388	17395	0 %	50 %	25 %	25 %	379711761
41	NC_016930	TAAA	2	8	18139	18146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016930	AAAC	2	8	18187	18194	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016930	TAAA	2	8	18262	18269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016930	TTAT	2	8	18460	18467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016930	GTAA	2	8	19374	19381	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
46	NC_016930	AGAT	2	8	19628	19635	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
47	NC_016930	AGCA	2	8	19747	19754	50 %	0 %	25 %	25 %	379711763
48	NC_016930	AAAT	2	8	19790	19797	75 %	25 %	0 %	0 %	379711763
49	NC_016930	AATG	2	8	19991	19998	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
50	NC_016930	ATTA	2	8	20292	20299	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
51	NC_016930	ATAG	2	8	20340	20347	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
52	NC_016930	ATAG	2	8	20352	20359	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
53	NC_016930	CGTT	2	8	20770	20777	0 %	50 %	25 %	25 %	379711763
54	NC_016930	TAGT	2	8	21217	21224	25 %	50 %	25 %	0 %	379711763
55	NC_016930	AAGC	2	8	21957	21964	50 %	0 %	25 %	25 %	379711763
56	NC_016930	TAAA	2	8	22318	22325	75 %	25 %	0 %	0 %	379711763
57	NC_016930	AAGT	2	8	22831	22838	50 %	25 %	25 %	0 %	379711763
58	NC_016930	TTCA	2	8	23380	23387	25 %	50 %	0 %	25 %	379711763
59	NC_016930	AATA	2	8	23873	23880	75 %	25 %	0 %	0 %	379711763
60	NC_016930	TAAA	2	8	24019	24026	75 %	25 %	0 %	0 %	379711763
61	NC_016930	ACTA	2	8	24155	24162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016930	ATGT	2	8	24818	24825	25 %	50 %	25 %	0 %	379711765
63	NC_016930	TTAT	2	8	24872	24879	25 %	75 %	0 %	0 %	379711765
64	NC_016930	AGCA	2	8	24946	24953	50 %	0 %	25 %	25 %	379711765
65	NC_016930	TAAT	2	8	25747	25754	50 %	50 %	0 %	0 %	379711766
66	NC_016930	AAGA	2	8	25899	25906	75 %	0 %	25 %	0 %	379711766
67	NC_016930	AAAT	2	8	25991	25998	75 %	25 %	0 %	0 %	379711766
68	NC_016930	ATTA	2	8	26019	26026	50 %	50 %	0 %	0 %	379711766
69	NC_016930	TAAA	2	8	26866	26873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016930	AGGA	2	8	26924	26931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016930	TAAA	2	8	26956	26963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016930	GCTA	2	8	26966	26973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016930	TCTA	2	8	27715	27722	25 %	50 %	0 %	25 %	379711770
74	NC_016930	ATTT	2	8	27759	27766	25 %	75 %	0 %	0 %	379711770
75	NC_016930	TGTC	2	8	27823	27830	0 %	50 %	25 %	25 %	379711770
76	NC_016930	TAAT	2	8	28213	28220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016930	ATAC	2	8	28420	28427	50 %	25 %	0 %	25 %	379711772
78	NC_016930	ATAA	2	8	28844	28851	75 %	25 %	0 %	0 %	379711772
79	NC_016930	CACT	2	8	28938	28945	25 %	25 %	0 %	50 %	379711772
80	NC_016930	TATT	2	8	29764	29771	25 %	75 %	0 %	0 %	379711774
81	NC_016930	AATT	2	8	31397	31404	50 %	50 %	0 %	0 %	379711776
82	NC_016930	TACC	2	8	31487	31494	25 %	25 %	0 %	50 %	379711776
83	NC_016930	GTTA	2	8	31869	31876	25 %	50 %	25 %	0 %	379711776
84	NC_016930	AAAC	2	8	33296	33303	75 %	0 %	0 %	25 %	379711778
85	NC_016930	TTAG	2	8	33472	33479	25 %	50 %	25 %	0 %	379711778
86	NC_016930	TTGC	2	8	33767	33774	0 %	50 %	25 %	25 %	379711778
87	NC_016930	TTCC	2	8	34007	34014	0 %	50 %	0 %	50 %	379711778
88	NC_016930	TGTT	2	8	34475	34482	0 %	75 %	25 %	0 %	379711779
89	NC_016930	TTGT	2	8	35081	35088	0 %	75 %	25 %	0 %	379711781
90	NC_016930	TATT	2	8	35160	35167	25 %	75 %	0 %	0 %	379711781
91	NC_016930	GTAA	2	8	35171	35178	50 %	25 %	25 %	0 %	379711781
92	NC_016930	AATG	2	8	35944	35951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016930	GTTT	2	8	36446	36453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016930	ATAA	2	8	36937	36944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016930	AACA	2	8	37034	37041	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016930	CTGA	2	8	38987	38994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016930	ATTG	2	8	39165	39172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016930	TAAA	2	8	39322	39329	75 %	25 %	0 %	0 %	379711784
99	NC_016930	ATTT	2	8	39427	39434	25 %	75 %	0 %	0 %	379711784
100	NC_016930	ATTA	2	8	39593	39600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016930	ATTA	2	8	39648	39655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016930	TGCT	2	8	39771	39778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016930	GCTT	2	8	39898	39905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016930	ATTA	2	8	40379	40386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016930	TAAT	2	8	40672	40679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016930	ATTA	2	8	40742	40749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016930	AAAT	2	8	40846	40853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016930	GAAA	2	8	41057	41064	75 %	0 %	25 %	0 %	379711786
109	NC_016930	ATTT	2	8	41101	41108	25 %	75 %	0 %	0 %	379711786
110	NC_016930	ACAA	2	8	41368	41375	75 %	0 %	0 %	25 %	379711786
111	NC_016930	AAAT	2	8	41572	41579	75 %	25 %	0 %	0 %	379711787
112	NC_016930	TACC	2	8	42926	42933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016930	AAAC	2	8	42934	42941	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016930	TAAT	2	8	43010	43017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016930	ATTT	2	8	43037	43044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016930	ATTA	2	8	43045	43052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016930	AAAT	2	8	43064	43071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016930	AAAT	2	8	43079	43086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016930	TAAC	2	8	43467	43474	50 %	25 %	0 %	25 %	379711789
120	NC_016930	ATTC	2	8	43895	43902	25 %	50 %	0 %	25 %	379711789
121	NC_016930	ATGT	2	8	44250	44257	25 %	50 %	25 %	0 %	379711790
122	NC_016930	ATTT	2	8	44408	44415	25 %	75 %	0 %	0 %	379711790
123	NC_016930	TTAC	2	8	44487	44494	25 %	50 %	0 %	25 %	379711790
124	NC_016930	ATCA	2	8	45162	45169	50 %	25 %	0 %	25 %	379711791
125	NC_016930	TGCC	2	8	45472	45479	0 %	25 %	25 %	50 %	379711791
126	NC_016930	TATC	2	8	46031	46038	25 %	50 %	0 %	25 %	379711791
127	NC_016930	TTAA	2	8	46054	46061	50 %	50 %	0 %	0 %	379711791
128	NC_016930	AGTA	2	8	46982	46989	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016930	ATAC	2	8	47200	47207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016930	TTGC	2	8	47345	47352	0 %	50 %	25 %	25 %	379711793
131	NC_016930	GTTT	2	8	47711	47718	0 %	75 %	25 %	0 %	379711794
132	NC_016930	AAGT	2	8	47751	47758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016930	CTTG	2	8	48219	48226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016930	ATCT	2	8	48797	48804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016930	TGCT	2	8	48962	48969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016930	TTTA	2	8	49373	49380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016930	TCAC	2	8	49482	49489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016930	TAAA	2	8	49522	49529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016930	TTTA	2	8	50255	50262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016930	ATTA	2	8	50637	50644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016930	TAAA	2	8	50862	50869	75 %	25 %	0 %	0 %	379711797
142	NC_016930	GAGG	2	8	50888	50895	25 %	0 %	75 %	0 %	379711797
143	NC_016930	ATTG	2	8	51271	51278	25 %	50 %	25 %	0 %	379711797
144	NC_016930	TTAT	2	8	51485	51492	25 %	75 %	0 %	0 %	379711797
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